十一月，以太监李奇茂监视陕西茶马、吴直监视登岛兵饷。初，上既罢诸内臣，事委督、抚；然上英察，辄以法随其后，外臣多不称任使者。崇祯二年，京师戒严，乃复以内臣视行营。自是衔命四出，而群相壅蔽，国事日非矣。工部郎中孙肇兴监督盔甲厂，以帑绌疏劾张彝宪；上怒，落职。
十二月，考选科道后，更核在任征输；户部尚书毕自严下狱，熊开元、郑友玄俱谪。吏科都给事中颜继祖上疏救，上切责之。礼部侍郎罗喻义直日讲，以“尚书”“商王布昭圣武”章送阁；温体仁裁其半，以所引京营大阅语也。喻义坚执不可，遂放归。
五年（壬申）正月，刑科给事中吴执御奏荐黄克缵、刘宗周等，御史吴彦芳奏荐李瑾、李邦华等。上以其朋比恶之，下彦芳、执御于理，坐上书不以实律，杖为城旦。
三月，工部右侍郎高弘图上言：‘臣部有公署，中则尚书、旁列侍郎，礼也。内臣张彝宪奉总理二部之命，俨临其上。臣今日为侍郎，贰尚书、非贰内臣。国家大体，臣固不容不慎持。且总理公署，奉命别建；则在臣部者，宜还之臣部’。上以军兴饷事重，应到部验核，不听。弘图引疾求去，疏七上；竟削籍。
六月，兵部员外华允诚上言“三大可惜、四大可忧”，刺温体仁、闵洪学；上切责之。允诚回奏，又极言其失，谓私沈演、唐世济等；上怒，夺允诚俸。
七月，以司礼监太监曹化淳提督京营戎政，以司礼监右少监刘劳誉提督九门。令百官进马，三品以上各贡一匹，余合进，俱纳于御马监；实金贸之本监也，否则虽骏骥亦却之。川贵总督朱燮元平水西安位，以善后便宜九事奏闻；上可其奏，加燮元少师，金币，荫一子锦衣卫指挥佥事世袭。
六年（癸酉）正月，大学士周延儒以宣府阅视太监王坤疏劾，乞罢；不允。左副都御史王志道上言：王坤不宜侵辅臣。上召廷臣于平台，谓志道曰：‘遣用内臣，原非得已；朕言甚明，何议论之多也？昨王坤之疏，朕已责其诬妄。乃廷臣举劾，莫不牵引内臣；岂处分各官，皆为内臣邪’！对曰：‘王坤直劾辅臣，臣为纪纲法度惜，非为诸臣地也’。上曰：‘廷臣不言国家大计，以内臣在镇不利奸弊，乃借王坤疏要挟朝廷，诚巧佞也’。因诘志道者再。周延儒曰：‘志道非专论内臣，实责臣等溺职’。上色稍霁曰：‘职掌不修，沽名立论，何堪宪纪’！立命志道退。
二月，谕吏部：‘荐举潜修之士，科道不必端出考选，馆员须应先历知推。永着为令’。
三月，刑科都给事陈赞化劾大学士周延儒招权纳贿：‘游客李元功借丛威人，延儒尝语去辅李标云：“上先允放，余封还原疏，上即改留”；颇有回天之力。今上羲皇上人也；此何语，岂徒小人之轻泄乎’？且引刑科给事中李世祺为证。世祺亦奏延儒实有此言；不问。户科给事中朱文焕亦劾延儒重荷国恩，毫无补救；亦不问。
五月，命司礼监太监张其鉴等赴各仓，同提督诸臣盘验收放。太监张应朝调南京，与胡承诏协同守备。谕兵部：‘流寇蔓延，各路兵将功罪，应有监纪’。特命太监陈大金、阎思印、谢文举、孙茂霖为内中军，会各抚道分入曹文诏、左良玉诸营。寻复以阎思印同总兵张应昌合剿。
六月，命太监高起潜监视宁锦、张国元监视山西石塘等路，综核兵饷。大学士周延儒罢。始，延儒与温体仁深相结纳，力延之以进。至是，体仁将夺其位；太监王坤疏攻延儒，体仁无一语相助。凡与延儒为难者，必阴助之；而助延儒者，皆诎。延儒放归。
十月，论囚，上素服御建极殿，召阁臣商榷，温体仁一无所平反。陕西华亭知县徐兆麒赴任七日城陷，竟弃市；上心恻，体仁不为救，人皆冤之。
七年（甲戌）正月，总理太监张彝宪请入觐官役册以隆体统；许之。山西提学佥事袁继咸力争，上不听。
二月，监视登岛太监魏相以给事中庄鳌献上“太平十二策”内撤监视，因求罢；不允。贬鳌献于外。