初八日（己卯），谕军机大臣等：沈葆桢等奏（理谕日人稍有端倪，仍遵旨加紧筹防并请饬彭楚汉带队赴台）各摺片，潘霨偕道员夏献纶等於五月初八日驰抵琅峤，与日本中将西乡从道反覆辩论，逐条穷诘；西乡从道理屈词穷，旋以（所用兵费无着）为言，复经潘霨据理驳斥，彼请一面致书柳原前光、一面寄信该国暂不添兵前来。惟彼族贪鸷性成，未必遽能就我范围。沈葆桢等所奏（非益严警备，难望转圜。倘恃其款词，日延一日，奸民乘隙构煽，必至事败垂成）等语，深合机宜。着照所请，由北洋大臣调拨久练洋枪队三千人、南洋大臣调拨久练洋枪队二千人，均乘坐轮船赴台。该郡现有兵勇不甚得力，李鸿章、李宗羲务当迅速调派，令其克日起程前往，以壮声势。南、北洋防务紧要，俟日本兵退後，沈葆桢即令此项队伍各归防所。前据文煜等奏，拟留罗大春驻紮厦门；当经降旨，仍令迅即渡台办理淡水一带防务，并谕李鸿章檄饬彭楚汉迅赴本任。沈葆桢等此时计可接奉前旨，所陈台湾南、北路布置情形及令曾元福提倡乡团各事宜，即着督饬该员等悉心筹办，务臻周妥；并侦探日本情形，随时详悉具奏。潘霨在琅王乔时传各社生番头目，至者百数十人，皆称日本欺陵，恳求保护，并愿设官经理，永隶编氓；仍着沈葆桢等遵奉叠次谕旨，妥为收抚，以固其心。所有奏调之前南澳镇总兵吴光亮、浙江候补道刘璈，着瑞麟、杨昌濬派令迅往台郡，用资任使。闽省轮船不敷调拨，江苏、广东沿海各口轮船前有旨准归沈葆桢调遣，即着於沪局添调数号由吴大廷督带驶往。前谕李鸿章饬彭楚汉赴闽，如该提督尚未起程，此次调拨之北洋洋枪队三千人，着即令其统带，迅由轮船驶赴台湾，毋稍迟缓。该提督抵台後，应否留於该郡督队办防之处，着该大臣等与文煜、李鹤年会商办理。将此由六百里密谕沈葆桢、瑞麟、李鸿章、文煜、李宗羲、李鹤年、杨昌濬，并传谕潘霨知之。
十二日（癸未），谕军机大臣等：本日文祥奏（病仍未痊，恳请开缺）一摺，已明降谕旨再赏假两个月，俾得安心调理矣。数月以来，该大臣病体仍未就痊，甚深廑系。惟各国交涉事件甚繁，刻下日本与生番寻衅，办理亦无头绪，亟须该大臣前赴总理各国事务衙门会同筹画；着文祥不必拘定假期，随时前往该衙门悉心会商妥办，共济时艰。将此谕令知之。
又谕：李鸿章奏（遵旨筹派洋枪队航海驰赴台防，并请调驻陕铭军东来，以备南、北海口策应）一摺，前据沈葆桢等奏，请由北洋拨久练洋枪队三千人、南洋二千人驰赴台湾，当经谕令李鸿章、李宗羲迅速调派。兹据李鸿章奏称：（直隶防军拱卫畿辅，必须留备缓急，碍难分调；南洋洋枪队无多，亦难酌拨。且於两处抽拨，恐兵将素不相习，转致贻误。查有提督唐定奎所统现驻徐州之武毅（铭）字一军，素习西洋枪炮，训练有年，堪以派往）等语。着照所请，即饬唐定奎统带所部步队六千五百人由徐拔赴瓜洲口分起航海赴台，听候沈葆桢调遣。由李宗羲、张树声饬调沪局轮船暨雇用招商局轮船驶赴瓜洲，以备该军东渡；并着沈葆桢酌派闽厂兵船入江接载，俾期迅速。该军所需月饷、军装、子药等项，仍着源源筹拨，毋任稍有缺乏。提督彭楚汉，着李鸿章饬令星速赴任，筹办防务。日本违约称兵，心存叵测；所有南、北洋沿海各口均须严密设防，自应添调劲兵屯紮适中之地，以壮声援。现在陕西防务已松，着邵亨豫迅饬臬司刘盛藻统率陕防武毅铭军马步二十二营星夜兼程拔赴山东济宁及江南徐州一带择要扼紮，以备南、北海口策应。该军到防後，着李鸿章、李宗羲随时会商，相机调派。南、北洋防务紧要，并着该督等悉心妥筹，详细具奏。福州一带沿海地方，文煜、李鹤年、王凯泰当实力筹防，务臻周密；不得稍存大意，致误事机。日本近日情形若何？着沈葆桢等随时确探；并将应行豫备事宜，妥为区画，即行奏闻。另片奏：（轮船迟速无常，嗣後寄谕沈葆桢等夹板等件，除发交齎摺原轮船递回、可期迅速外，其余应仍由驿递径发闽省）等语。览奏已悉，嗣後发交该督饬令递回之件，即着随时交原轮船飞速齎递。将此由六百里密谕沈葆桢、李鸿章、文煜、李宗羲、李鹤年、王凯泰、张树声、邵亨豫，并传谕潘霨知之。
十三日（甲申），谕军机大臣等：传谕福建陆路提督罗大春：罗大春奏（日本渐肆狂悖，密陈筹备事宜）一摺，所奏闽省海防及各省海口应行筹办各节，不为无见。所有台湾暨福州、厦门等处，前经谕令沈葆桢、文煜、李鹤年妥筹办理，并谕沿海各督、抚、将军预为布置矣。该提督前经沈葆桢奏调赴台，并据文煜等奏（已催令该提督东渡，其厦门一带防务，改派孙开华接办）；着罗大春刻即驰赴台湾，会同沈葆桢、潘霨督率淡水等处防兵妥筹布置，以资得力。
十四日（己酉），谕军机大臣等：文祥奏（海防紧要，请饬宽筹饷需）一摺，现在日本藉端启衅、违约称兵，虽经沈葆桢等据理辩论，仍应整顿海防，以为自强之计。所有各省沿海地方，前经谕令该将军、督、抚妥筹办理；惟布置设防用款甚钜，着户部通盘筹画，凡一切不急之需竭力撙节，将海防经费先事预筹，庶各海疆大吏不至以饷项支绌致误事机。将此谕令知之。
二十日（辛卯），谕〔军机大臣等〕：沈葆桢等奏（外情叵测，续筹防务情形）一摺，日本复到轮船一只装兵二百余人带有铁链、农器等件，又有轮船驶往後山一带，其为意存觊觎，悍不旋师，自不待问；亟应厚集兵力，益严儆备，庶有以杜其诡谋。提督唐定奎一军，着李鸿章檄令星速拔队、兼程前进，不得稍涉延缓，致误事机；并着沈葆桢、李宗羲、张树声遵奉前旨，分别饬调船只，妥为预备，俾得迅到防所，以壮军威。台湾南、北路防守事宜，均甚紧要；澎湖守备空虚，现添募勇丁一营，是否足资扞御？沈葆桢等务当督饬张其光、夏献纶等妥筹布置，严密防守。北路淡水等处，前谕罗大春前往督防；该提督此时当已渡台，并着该大臣等与之会商，相机筹办。日本遣人往勾卑南社番目，经沈葆桢等将该番目陈安生等招致来郡；潘霨现拟驻营凤山，就近相度形势，次第抚绥。惟日本狡诈多端，既约牡丹社生番议和，并以（王）字社生番不肯议和，有进兵往攻之说；沈葆桢等应如何联络番众，俾不至为彼族煽惑之处？务宜设法妥办。福州、厦门一带，文煜、李鹤年、王凯泰现在如何筹防？着即区画周密，详悉奏闻。另片奏：（近阅香港新闻纸，将该大臣等四月十九日奏片刊刻）等语；此等紧要事宜，岂容稍有泄漏！前经叠降谕旨，严行训诫该大臣、将军、督、抚等应如何加意慎重，此次究由何处泄露？即着该大臣、将军、督、抚等确切查明，据实具奏。嗣後遇有中外交涉事件，务当益加慎密；不得稍涉疏虞，致干咎戾。并着照该大臣所请，嗣後奉到谕旨及陈奏摺片，除钞寄总理各国事务衙门及应行函寄各处外，其余均不必钞咨，以昭严密。将此由六百里密谕沈葆桢、李鸿章、文煜、李宗羲、李鹤年、张树声、王凯泰，并传谕潘霨知之。
二十二日（癸巳），谕军机大臣等：李鹤年奏（提督不遵节制，请旨严议）一摺，提督罗大春经李鹤年催令迅速东渡，仍未起程，实属延玩。罗大春着革职留任，仍着文煜、李鹤年、王凯泰饬令该提督迅赴台湾、驻紮苏澳一带，随时与沈葆桢、潘霨筹办防务。倘敢抗违或到台後不能得力，即着沈葆桢、李鹤年据实严参治罪。将此由六百里谕知沈葆桢、文煜、李鹤年、王凯泰，并传谕潘霨知之。