光绪十一年六月十六日，奉旨：‘……’。
帮办福建军务杨岳斌等奏澎湖法船撤退并查明失守情形折
帮办福建军务前陕甘总督杨岳斌、督办台湾防务福建巡抚刘铭传、帮办台湾防务福建陆路提督孙开华奏：为恭报澎湖法兵退去日期并查明失守情形，所有在事文武请旨分别处分事。
窃臣等于本年六月初六日派记名提督吴宏洛乘坐“万年青”轮船前往澎湖察看情形，十四日吴宏洛由澎湖回至淡水；据称：该提督到澎湖之后，查得李士卑斯于初九日接到撤兵国书，即于十二日开船出口；李并知会吴宏洛由赴香港法船之便，电报广东转电总署奏闻，计邀圣鉴。查澎湖二月十二日法船到境、十五日失守情形，已经左宗棠、杨昌浚会奏在案。其时臣岳斌正在台南，当即派探回称：‘十二日，有法船六只泊在淡水乌嵌开边海面；十三日该六船内分一大船泊近莳里澳、三船驶至妈宫西屿、二船至观音亭后，齐开大炮，纵横轰击。统领前路各军管带绥靖后营代理澎湖水师副将周善初、管带练军果毅营澎湖右营都司郑渔出队抵御，各炮台亦开炮还击；经法兵将四角山、新城、蛇山头、金龟头、观音亭各炮台及妈宫协署、军装局等处营房街道一律轰击倒坏，周善初等抵敌不住，退往大城北而去。十四日早，敌将先日泊在辩里澳大船一只驶至近岸，用小划渡兵三百余人登岸，来扑珠母水澳；管带绥靖副中营尽先副将陈得胜率队出迎，相持未久，即退往大城北而去，敌亦未追。十五日早，法兵约有八、九百名复由双头跨地方登岸，径至大城山下；周善初率管带绥靖前营台湾镇标中营守备冯楚燊队伍接仗时许，势不能支。陈得胜带队来援，手腿受伤；即退往西溪乡。周善初又调管带德义中营候补同知关镇岳、管带德义后营候补通判梁岳英带队来援，前后零星不齐、又无督率，不能抵御，关镇岳为飞子所伤；周善初、冯楚燊、关镇岳、梁岳英、郑渔等一齐退往北山赤嵌一带，澎湖遂尔失守’。
澎湖通判邓膺杰前曾通报练募水勇四百名，防守要口；及至法人攻澎湖三日，不闻其勇抵御何处。地方失守，咎有应得。周善初，郑膺杰二员，应请旨即行革职；郑膺杰尚有煤务经手事件，由臣铭传撤任，听候查办。候补通判梁岳英、澎湖右营都司郑渔、台湾镇标中营守备冯楚燊，均属督战不力；应请一并革职。候补同知关镇岳、尽先副将陈得胜，均经带伤；应请加恩免予处分。所有阵亡官勇，俟查明后再行奏请赐恤，以慰忠魂。
惟澎湖一岛地处孤危，面面受敌；既无得力炮位、炮台，又无兵轮、水雷。臣铭传于上年秋、冬之际，屡接周善初等来禀，请发水雷、大炮；臣愧无以应。十月底，台澎道刘璈即无饷接济澎军；经臣咨请督臣杨昌浚拨款接济并请督臣设法运送炮位、水雷，未接咨覆。刘璈申报至香港购买水雷、至东洋购买大炮，臣批令赶紧布置澎湖；亦无覆禀。周善初等失守地方，原有应得之咎；惟臣铭传有督办防务之责，不能预为筹划设法、且不能保守基隆，既参该厅协等失守之咎，若不一并处分，何以服该文武之心！应请旨将臣铭传交部从严议处，以肃军政。谨奏。
光绪十一年七月初八日，奉旨：‘已有旨’。
谕杨昌浚刘铭传等台湾建设行省着会商奏办电
上谕：‘前据刘铭传奏“筹度台湾情形，暂难改设省会”、又据杨昌浚奏“筹议台湾改设藩司”各一折，览奏均悉。台湾为南洋门户，业经钦奉懿旨将福建巡抚改为台湾巡抚；刘铭传所陈，着毋庸议。杨昌浚所奏添设台北道不如添设藩司，系为因地制宜起见；自可准行。惟该督所奏尚系大概情形，所有一切应办事宜，均未筹商定妥；台湾虽设行省，必须与福建联成一气如甘肃、新疆之制，庶可内外相维。着杨昌浚、刘铭传会商，奏请办理’。（十二月十二日）
粤督张之洞致总署日人以兵轮失踪为词拟派舰来粤寻访电
日外部文称：‘由法新造之“亩傍”兵轮船日久未到，现派“明治”、“长门”两舰前往汕头各港访寻；请电粤：如该二船入口时，勿视为商船’云云。巨舰不比纤芥，何须寻访；言语支离，必不怀好意。现粤电覆云：‘长崎杀戮华兵案，华民愤极，粤民尤甚。日舰来粤，恐难保其无事。崎寄正在商办，大局攸关；彼此均须加意。如果来粤各港口，当即电闻；切不必派舰来寻’等语。狡谋伺隙，是否有合？（十二月十三日）
闽督杨昌浚致总署日领知照不派兵舰到闽寻船电
日本领事知照“亩傍”兵船已查明于冬月八日由新加坡开行，至台湾之东边洋面失事沉没；所派“明治”、“长门”两舰不到闽湾访寻云。（十二月二十二日）
总署致李鸿章英法德等使言台湾系通商口岸希停收洋里电
英、法、德等使屡言台湾系通商口岸，非比内地；洋商不应领单、亦不应完厘，中国征收洋厘系属违约。迭经本署辩论，彼以延宕日久，不能再待，声称即饬洋商不令完厘；倘因此扣留货物，即须索赔，中国任咎云云。情势甚迫，断难再争；希即停抽洋商厘金，免致反受讹索。至本省如何征收落地税厘，另行设法办理。望速覆！（二月二十二日）