放〈糸索〉溪：在凤山县西七十里力力溪南。源出大山中，北源曰中溪，南源曰毕乡溪，合而西南流，经放〈糸索〉社北，又西南至鳖兴港，入于海。
浊水溪：在凤山县北三十里。通志：源出大滚水山，水流极浊，南合小冈山之水，会弥陀港，入于海。
八掌溪：在嘉义县南二十里。通志：源发玉山，过枋仔岸山、阿里山、牛朝山之西南，至白须公潭，过小龟佛山，西至青峰阙入海。
急水溪：在嘉义县南三十里。通志作啯溪，源出大武垄山十八重溪，合哆啰啯社北九重溪水，过双溪口，西南为急水溪，下急水渡，西汇于蚊港入海。
湾里溪：在嘉义县南七十里。源发县东南大山，西流过湾里铺北，又西至新港口入海，稍北有麻豆溪，西流入海。
牛朝溪：在嘉义县西五里。通志：源发大武峦山，出大福兴山、牛朝山之北，西过北新庄，至槺榔庄，为龟仔港入海。
山叠溪：在嘉义县北二十里。通志：在牛朝溪北，发源阿里山，西流至双溪口，北会石龟溪，又西流至笨港入海。石龟溪发源奇泠岸山，西流南与山叠溪合。按府志作三叠溪。
虎尾溪：在嘉义县北六十五里彰化县南。二县以溪为界。过此而北，人烟渐少。旧志：源出大山中，从柴里斗六门社流出，截溪分流而北，经东螺社南，折而西南流，复合为一，西入于海。通志：虎尾溪源发于水沙连内山麓，西流过牛相触山，北分于东螺，又南会嘉义县阿拔泉溪之水为西螺，又西至台仔挖入于海。东螺溪分自虎尾溪北，折而西流，汇于海丰港入海。
大武郡溪：在彰化县南。通志：源出大武郡山，西流至鹿仔港入海。
大肚溪：在彰化县北十里。旧志：源出大山中，西流经大肚社南，又西入海。通志：溪阔水险，源发于南投山，过北投猫罗社北，合水沙连九十九尖之流，西过阿束社北为草港，入于海。
大甲溪：在彰化县北四十里。旧志：源出大山中，流经大甲社南，又西入海。溪中多石艰于行涉。通志：溪面甚阔，源发于岸里内山，西流，南分为牛骂溪、崩山溪，西入海。
大安溪：在彰化县北。通志：险如大甲，溪面较狭。发源于水沙连内山，西流过岸里、南日二山，支分于南日山之后，曰房里溪，分于铁砧山之北，曰猫盂溪，西汇于双寮海口入海。
吞霄溪：在彰化县北，发源于南日山，西流至倒旗山前，入于海。
后垄溪：在彰化县北。发源于猫里山，西流至后垄港入海。
中港溪：在彰化县后垄溪之北。源发于合欢大山，西流至中港社西入海。
竹堑溪：在彰化县中港溪之北。源出大山中，西流经竹堑社北，又西入海。
凤山溪：在彰化县竹堑溪之北。通志：源发查内山，西流至小凤山埔入于海。
南北大溪：在彰化县东北。俱发源大山中，西流入海。
南嵌溪：在彰化县北大溪之北。西流经南嵌社南，折而北，与社北之水会，西北流入海。
长豆溪：在彰化县东北。通志：源发八里坌山南，西流入于海。
上淡水溪：在彰化县东北上淡城西。旧志：源出东北界大山中，深十余寻，缘岸皆古梅，舟行数日不穷；中产红心鱼，长竟丈。其水西流北折，会巴浪泉水，北入于海。
通志：八里坌山之北，为淡水港海口，至干豆门水程十里，内有大澳，分为二港，可泊大艘数百。
磺溪：在彰化县东北。通志：源出磺山，西流出干豆门入海。东北即鸡笼港。
马沙港：在台湾县西南。旧志：西通大海，北接台湾南岸，即安平镇城，亦名马沙沟。新志：安平镇港潮汐，与鹿耳门七鲲身相连，宽衍可泊千艘。又北线尾在鹿耳门南，有柴头港，红毛时水甚深，夹板船可入，今淤浅。
大圆港：在台湾县西海港。自鹿耳门以内，周环皆堤，海舟聚泊；后红毛建城如台，因亦谓港为台湾。
网港：在台湾县西北废天兴州北。旧志：渔人恒取鱼于此。
新港：在台湾县北十五里。源出木冈山，西流至洲仔尾入海。港南为台湾县界，港北为嘉义县界。