水寨官
旧制：水寨统以指挥一员，谓之把总。嘉靖四十二年，军门谭纶题奉钦依，比照浙江定海等关把总，以都指挥体统行事。于是浯屿寨为钦总，其浯铜游兵把总及万历二十五年新设彭湖游兵把总，俱军门扎给名色者。
水寨军兵
旧时水寨舟师皆拨各卫所军。南日寨则拨泉州卫，合兴化、平海二卫共一千五百余人。浯屿寨则拨永宁卫、福全所，合漳州卫共二千五百余人。近来军伍缺乏，寨卒悉系募兵，而卫所军止贴驾船。浯屿兵一千七十名（粮每名九钱，布政司发给），贴驾军五百八十名。浯铜游兵五百三十六名（粮俱布政司发给），贴驾军三百名。彭湖游兵八百五十名（春汛粮支给于泉，冬汛粮支给于漳）。
兵船
浯屿寨管福、哨、冬、鸟等船四十八只，浯屿游管冬、鸟等船二十二只，彭湖游管哨船二十只。
按福船势力雄大，最便冲犁，所以扼贼船于外洋。事久备懈，皆放贼船入港，始议迎击。港中山澳崎岖，贼船窄小，反易趋避，而大船转动多碍，皆为无用之器。故寨中有福船，又有次号哨船、冬船，以便攻战，小号鸟船、快船，以便哨探，或助力袭击。如福船出洋犁贼，贼船势将内逼，哨、冬船与鸟、快船急抢上风，又出贼船之内，向外逐打，务逼使出洋，内外夹击收功。如一概从外追打，逼贼登岸，具有军法。
信地
浯屿寨兵分四哨，出汛时一屯料罗，一屯围头，一屯崇武，一屯永宁。每汛与铜山、南日两寨及浯铜游兵合哨，稽风传筹。浯铜游兵分二哨，出汛时一屯旧浯屿，一屯担屿。每汛与浯屿寨兵合哨。惟彭湖游兵专过彭湖防守。凡汛春以清明前十日出，三个月收；冬以霜降前十日出，三个月收。收汛毕日，军兵放班，其看船兵拨信地小防。
按泉郡滨海，绵亘三百里，与岛夷为邻，其最险要宜防之地有三。一曰崇武，在惠安之东北，接湄洲与兴化连界，西通泉州大港，东接海洋，南与祥芝对峙，正当泉之上游，海寇入犯，首当其冲。一曰料罗，在同安极东，突出海外，上控围头，下瞰镇海，内扞金门，可通同安高浦、漳州广潮等处。其澳宽大，可容千艘。凡接济萑苻之徒，皆识其地以为标准。嘉靖间倭寇由此登岸，流毒最惨。一曰旧浯屿，在同安极南，孤悬大海之中，左连金门，右临岐尾，水道四通，乃漳州、海澄、同安门户。国初设寨于此，最为远虑。至崇武而南有永宁，料罗而上有围头，旧浯屿之北有担屿、烈屿，南有卓岐、镇海，皆海寇出入之路，抑其次也。今汛兵屯崇武、永宁，分哨则獭窟、祥芝、深沪、福全一带有赖；屯料罗、围头，分哨则〈犭责〉洲、安海、官澳、田浦、峰上、陈坑一带有赖；游兵屯旧浯屿、担屿，巡哨则镇海、岐尾、乌沙港一带有赖。彭湖绝岛旧为盗贼渊薮，今设有游兵防守，则贼至无所巢穴，又泉郡藩篱之固也。乃若选将校、核卒伍、修艨舰、明赏罚，使水军狎风涛而不敢偷安内澳，则在人而不在地。
漳州府志摘录
洋税考
嘉靖中，有佛郎机船载货泊浯屿，漳龙溪八、九都民及泉之贾人往贸易焉。巡海道至，发兵攻夷船，而贩者不止。总督闽浙都御史朱纨获通贩者九十余人，悉斩之，而海禁严。三十六年，海寇许老、谢策等突至月港，大杀掠。明年冬，诱倭寇三千人再抵月港，散劫八、九都，往来浯屿间。寇累岁不息，土人乘机为叛，号二十四将，沿海骚然。四十三年，巡海道周贤宣计讨平之。其明年，奏设海澄县治。
隆庆初年，巡抚福建涂泽民题请开海禁，准贩东西二洋。通政唐顺之有云：‘国初，浙、福、广三省设市舶司。在浙江者，专为日本入贡，带有货物，许其交易。在广东者，则西洋番舶之辏，许其交易而抽分之。若福建既不通贡，又不通舶，而国初设立市舶之意，漫不可考矣。舶之为利也，譬之矿然。封闭矿洞，驱斥矿徒，是为上策。度不能闭，则国收其利权而自操之，是为中策。不闭不收，利孔漏泄，以资奸萌啸聚其间，斯无策矣。今海贼据浯屿、南屿诸岛，公然番舶之利；而中土之民，交通接济，杀之而不能止，则利权之在也。宜备查国初设立市舶之意，毋泄利孔，使奸人得乘其便’。其于海禁利害晰如也。
然市舶之与商舶，其说稍异。市舶者，诸夷舶泊吾近地，与内地民互为市，若广之濠镜澳然。商舶则土着民醵钱造舟，装土产，径望东西洋而去，与海岛诸夷相贸易；其出有时，其归有候。广洋巨浸，船一开颿，四望惟天水相粘无畔岸。而海人习知海道者，率用指南针（即罗经）为其导向。相传有航海针经。针或单用，或指两辰间，以前知某洋岛所在。约更时当行水路几许，打量水深浅几托（方言几仞为几托），海中岛屿作何状，某洋礁险宜慎，或风云气候不常，以何法趋避之。异时海贩船十损二、三，及循习于常所往来，舟无恙若安澜焉。盖海滨民射利精如此。