光绪元年，于艋舺地方设台北府，裁淡水厅；置淡水、新竹二县。又于噶玛兰厅地方，改置宜兰县：均隶台北府。又设基隆厅，移噶玛兰通判驻扎。设卑南厅，以南路同知驻扎。
十年，设埔里社抚民通判；又于南猴洞地方置恒春县。
十一年，分为省。
十三年，析彰化县地置台湾县暨云林、苗粟二县，并旧有之凤山、嘉义、彰化及埔里社厅均隶新设台湾府；改旧台湾府为台南府，改奋台湾县为安平县，裁鹿港厅。
十五年，以恒春、嘉义、凤山三县、澎湖一厅均隶台南府，又改卑南厅为台东直隶州。
今定府三、直隶州一、厅三、县十一。台湾府领台湾（附郭）、彰化、云林、苗粟等县四，埔里社厅一；台南府领安平（附郭）、凤山、嘉义、恒春等县四，澎湖厅一；台北府领淡水（附郭）、新竹、宜兰等县三，基隆厅一。直隶台东州一。
——以上见“钦定大清会典事例”卷一百五十二。
户口
丁银摊征
乾隆十二年题准：福建台湾府官庄田园共五十八万三千三百七十八亩零，每亩匀丁银四厘一毫零至八厘六毫不等；共人丁银三千六百六十五两四钱，匀入田园征收。至各番众所耕田地概不完赋，止就丁纳银；仍照旧完纳，毋庸摊入田亩。
——见“钦定大清会典事例”卷一百五十七。
保甲
雍正十一年覆准：福建台属村庄居人流寓者多，除自立产业兼有父母、妻子者，自有十家甲牌可稽；其并无家室产业如佃户、佣工、贸易之人，取具业主、房主、邻佑保结附于甲牌之末，汇报督、抚稽查。如业主、房主、邻佑保结匪人，事发连坐；先首者，免罪。
流寓异地
乾隆十年题准：粤省在台湾人民情愿携眷者，止许搬取妻子；令地方官取具邻佑保结，照内填占注名数。如地方官不查明、混行给照，照滥给印结例议处；本人严加治罪。
十二年题准：携眷赴台湾完聚者，地方官取具邻佑保结，将搬取祖父母、父母、妻室、子女几名口填注照内。如乘机携带亲族、混行给照者，地方官照滥给印票例议处；本人严加治罪。其亲族有暂时赴台湾探视者，开明姓名、年貌呈本籍地方官注册，仍填给印照，定限五月回内地销照。若届期有疾病、事故淹留者，台地印官于回籍文内声明；凡州、县填照给文，密封交本人齎投厦防、台防二厅。两经拆验，易文封照，交本人亲投台属厅、县验明，留照注册；有人照不符者逐回。若由台回籍，亦照此查验。凡内外台地给照销案缘由，月终通报督、抚稽察，岁终报部考核。
二十六年覆准：台湾流寓民人搬眷过台一年期满，内外各地方官毋再滥行给照。有遇拿获揽载偷渡船只，将搭载大船及雇倩小船各船户，均照客头包揽过台之例治罪；仍严查前项船只系何船户连环互结，并究明原报澳甲及开张歇寓之人，一体惩儆；船只变价充公。其澳甲务选家道殷实、小心诚谨之人，取具族保、邻佑切结详充；令其将客头姓名、籍贯及寄居处所，开册呈送地方官按名查拿，分别押送收管。其拿获偷渡人犯，查明本籍解回。一名至十名及十名以上者，将本籍地方官分别议处；并究明由何处出口、入口，将失察之员照议处本籍地方官例查参，兵役治罪。至兵保、澳甲拿获偷渡人犯十名以上同船户、客头并获者，每十名赏银四两，十名以上照数递加；赏项令地方官于偷渡船只变价内支销。
番民归化
雍正十三年题准：福建台湾府属彰化县生番一百九十九名，汇入彰化县版籍（岁贡鹿皮折银二两四钱，汇入奏销）。
乾隆三年题准：台湾府属各番社向化生番男妇二百八十五名，附入台属版图（岁贡鹿，獐皮各一张，变价充饷）。
三十二年奏准：台湾屋鏊末毒狮子等一十三社虽俱系内山生番，但向属安分；今见攸武乃社凶番被剿，官兵路过，秋毫无犯，众番社畏威怀德，俱愿输诚归化，每年献纳鹿皮四张、小米四石。
道光六年议准：噶玛兰归化社番留给余埔三十余里，以资生计；栽树为界，毋许汉人侵越。如情愿贌给汉人耕佃取租，听其自便。每届三十年，清厘一次。如有奸民欺占或贌耕之后久假不归，地方官随时惩办。
光绪十二年，招抚台湾生番四百余社，归化七万余人。又台湾中路所苏鲁等七社、北路白阿歪等处生番二十社，一律归化。