初，沈葆桢奉命防台，即言铁甲船当购、电报当设。遂招电线洋匠到台，拟从台湾府城北至沪尾，转白沙渡海，过万安寨（在福清县）登陆至马尾（在福州省城东），先从陆路起工；洋匠请回沪，与外国电局商议。洋将日意格以台地与沪、粤隔远，辨购多艰，因留斯恭塞格于台，自请归沪另雇工匠、购办物料；葆桢并谕其定买铁甲船二。旋雇来炮台洋匠头帛尔、陀鲁富二人、枪炮洋教习都布阿拉、保德、蛤利孟、贝鲁爱四人到台，令于安平海口相度要隘，绘图以进。
葆桢旋疏陈防务，略云：‘台地六、七月间台飓时作，琅〈王乔〉浪涌，难泊轮船；龟山倭营又当风冲，亦难站脚。倘我陆兵厚集，乘此烈风暴雨并力合剿，彼铁甲船不得近岸；孤军悬绝，不难尽歼之海隅。此等情形，想亦倭所深悉；所以日来情状，倍见张皇。若八、九月风浪渐平，彼之轮船必麇集海岸，互为攻援，我之防水较防陆更亟；此时非多备战舰不为功。现在柳原至都，款服与否，尚未可知；臣等夙夜深筹，既望淮军即至，又盼铁甲遄来，盖为此耳’！又疏：‘请并力防务，以伐戎心。闻李让礼为厦门领事所擒，又为沪领事所释；虽信否未可知，究一李让礼之去来，何关大局？我若可以自信，彼亦无所能为。淮军计日可以到台，臣霨复于初四日驰赴凤山，饬将营棚、薪米一切具备；南路得此劲旅，可壮声威。提臣罗大春已赴苏澳，“扬武”轮船往载其原部楚勇一营；夏献纶派朱名登所招楚勇，闻亦成军：日内均可东渡，北路亦足资扞御。澎湖守备素虚，现借海关“凌风”轮船驻彼教习，分闽厂六船随之，合操阵法；并兼顾地方。惟安平之炮台，照西法兴筑；所雇洋匠初至，尚未施功。而台地自六月以来暴风猛雨迭作，通计台城二千七百余丈，倒塌千有余丈、坼裂又三四百丈；固由始基不慎，亦缘台地常震，土弱沙松，砖石难购所致。见已发银，由台湾知府周懋琦转饬绅士分段监修，多加蜃灰，厚砌基址；冀以外防冲突，内固人心。而役钜工繁；非一时可毕。电线已有成言，近复翻异，屡经日意格驳诰，乃欲以旧线搪塞；臣等饬其不许迁就，致重款虚糜。
然电线尚可缓图，而铁甲船必不容少，臣等曩派船政总监叶文澜同日意格赴沪定买，近据函称：所议英国之船，非英使周旋其间，无从成购；丹国一船合约垂定，旋以不肯担承直驶入中国及换中国旗号，复致中变；日耳曼一船，有船无炮，制成且逾十稔，水缸只堪包用两年。臣思国家掷此巨款，原为利用起见；倘费百余万帑金，易一朽烂之船，将益为外人所侮。臣嘱日意格勿惮往复之劳，务求坚致之物；倘议购不成，不如鸠工自造。虽三年求艾，要可计日成功。南北抚番、开路诸事，勇夫齐集，畚锸日兴。惟中路水沙连、秀姑峦一带为全台适中之区、腹背膏腴之壤，故洋人在台者，每雇奸民带往煽惑番众。闻该处社藔，竟有教堂数处。深林叠嶂，罪人、积匪往往逋匿其间，如逆匪廖有富等即恃以藏身；而彰化之集集街，近复有“扎厝”毙命之事。安保日后不为倭族勾通，断我南北之路。臣等与营务处黎兆棠，商令募兵前往抚番搜匪，并开路设防。要之，倭将非不知难思退，而其主因贪成虐，不惜以数千兵民为孤注之举；谣言四布，冀我受其恫喝，迁就求和。倘入其彀中，必且得步进步。此皆屡试屡验之覆辙，早在圣明洞鉴之中。议者以为台地得淮军、得铁甲船，则战事起；臣等以为得淮军、得铁甲船，而后抚局成。夫费数百万帑金，歼此贪主所陷溺之数千兵民，不特无以体皇上遍覆之仁，抑且不足示天朝止戈之武。臣等之汲汲于儆备，非为台湾一战计，实为海疆全局计；愿国家勿惜目前之巨费，以杜后患于未形。彼见我无隙可乘，自必帖耳而去。但宽其称兵既往之咎，已足见朝廷逾格之恩；倘妄肆要求，伏恳我皇上坚特定见以却之。彼暴师于外，怨讟繁兴；不待挥我天戈，而内乱将作。倘议者徒急欲销兵，臣等恐转成滋蔓矣’！
沈葆桢请奖税务司好博逊。
夏献纶来苏澳招抚岐莱生番，首查倭人刘穆斋失银，社番有无盗劫，以防倭人藉口。沪尾税务司好博逊习知倭情，愿相助；许之。令与委员偕至苏澳，集讯船户卑鲁等，知日本人破船后银物均搬至岸，雇人守之；惟欲从生番租地，及许，月给引线人辛资，则给有洋银；其称失银千圆，则均不知。献纶立饬噶玛兰通判洪熙恬、委员张斯桂与好博逊乘船往勘花莲港倭人遭风破船处，研讯其地要人李振发暨南日番目润澜、加礼宛社番目八宝并居民曾生等，其词大略与卑鲁同，无劫掠事；惟先后受雇值工价银百八十圆，其租地银以番目来益不受而止。番目等随缴出日本前给旗物，及城主静、儿玉利国、上田新助三人合具原单，成富清风题扇。又询猴猴社番目笼爻孝礼，亦云‘五月间该船回泊南风澳，尚见内有三倭人，所携箱笼诸物具在’。献纶据禀，葆桢因奏称：‘查日本和约第三条，禁商民不准诱惑土人；第十四条，约沿海未经指定口岸，概不准驶入；第二十七条，约船只如到不准通商口岸私作买卖，准地方官查拏。今台后岐莱地方，中国所辖，并非通商口岸；此次前赴岐莱之成富清风、儿玉利国、上田新助，虽准该国领事品川请给游历执照，何得潜往勾引土番？种种均违和约。现已确查，岐莱各社并无窃盗银物，应毋庸议；其缴出旗、扇各件，臣等当即发交苏松太道沈秉成转给驻沪之日本领事收回，将前次所给游历执照追销。惟前闻到岐莱者为刘穆斋，此次番目所供俱系成富清风；据洋行呈出成富清风名纸，背印字“穆斋”，其为一人无疑。其违约妄为之处，应由该国自行查办。以后该领事请发执照，应查明实在安分之人，方许发给。一面钞录城主静等原单暨各民番供结，咨呈总理衙门照会其外务省转饬该国领事照章办理，以弭衅端。至税务司好博逊深明大义，踊跃从公，涉履危途，弭我边患；除地方官及各委员俟汇案保奖外，合无仰恳天恩，饬总理衙门先将好博逊酌议奖励，以答其效顺之忱’。
提督唐定奎统军驻凤山。
唐定奎统洋枪队自徐州起程，沈葆桢派轮船七号赴瓜州迎载。是月十二日均抵澎湖，以小轮船陆续载至旗后登岸，分驻要地；定奎自驻凤山县城，军势甚壮。定奎往谒葆桢，备筹攻战方略；葆桢深以为然，属其蓄锐养精，以俟朝命定进止。
秋八月，日本遣人来军致书。
日本素恶天主教，痛绝西洋人；近见诸国纵横海表，与我立约通商，遂复变易衣冠，事事仿泰西，亦欲称雄东海，屡为诸国所愚。比窥伺台湾，见我军威甚振、民志甚固，意颇悔；然犹冀美国人援助，不即旋师。至是，其酋遣吉利用通等六人自琅〈王乔〉来致书。一复葆桢责其伤我乡民、阻我驿书之事；请以后公差给予执照。一复劝其退兵；谓当俟柳原前光及久大保商定，彼兵进退应需主命。葆桢恐倭情狡诈，藉觇虚实，亦密遣人往侦，知倭人顷给附近奸民洋银七百圆，酬其招番及收前琉球死者颅骨之劳；又给近番号旗、布物。惟疫瘴流行，日有死亡。其副都督川琦、通事彭城中平、管粮官富田等相继染疫；以重值所雇美人机慎为入牡丹诸社绘图，亦病思归。自是，倭营已情见势屈矣。
提督罗大春、同知袁闻柝剿抚台湾叛番。
罗大春在北路开山，自东澳缒凿幽险，至大南澳岭（岭距东澳二十余里），有番贼伏丛莽，伺我军翼日逾岭刊木，兵役方瘁，凶番数百突以刀、标、鸟枪从林薄来犯，都司陈光华、守备黄明厚、千总王得凯等率勇迎拒，伤毙数番，始各骇散，我兵亦伤五人。进至大南澳，平埔广长数十里，有竹园番四十余社集众数千，将邀我军，架巨木为台，凭高下瞰；大春患其据险力拒，猝难剿平，遣人往抚，其渠皆听命，因增募勇夫千人以助役。葆桢又调驻台南东港总兵戴德祥前往，而咨唐定奎分营驻东港，为枋藔后援。南路则袁闻柝督人夫自赤山披斩荆棘，逾狮头山、入鸡笼坑；埤南番目陈安生等已率番众循山辟路，出昆仑坳以迎我军。附近番社，亦各缴倭旗归化；昆仑坳及内社番目率二百余人，请领开路器具为前导，闻柝各加赏犒。旁有望祖力社番目武甲素仇埤南，率众伏箐林放枪邀截之；埤南番格杀武甲等三人。闻柝驰谕，望祖力社亦悔罪求抚。葆桢恐闻柝孤军深入无后继，令副将李光进扼双溪口、游击郑荣进驻内埔为应援。时淮军均在凤山，张其光与南澳镇总兵吴光亮所募粤勇二千亦至旗后，军声愈壮。