一、全台赋税，急宜清理也。查台湾田产，甲于东南，一年两熟。淡水一县，每年额征钱粮银仅七百八十余两，官庄榖才九千余石。宜兰一县，钱榖无征。其余各县，粮税亦寡。通计全台盐、茶、百货税厘，岁入银壹百零数万两。将来整顿各项税厘，剔除中饱，岁可百二十万。核以台澎三十五营之饷，岁需百二十万，乃适相资。惟轮船经费，一切杂支，并须添设制造局，岁需银约百五十万；所亏实多。若能将各县赋税一律清查，以台湾之入，供台湾之需，尚可有盈无绌。惟清赋一事，要在得人。臣不谙吏治，昧于理财，时与沈应奎商量，办理之法，必先清查户口，再谋次第举行，恐须一、二年方可以收实效。此清赋之不容缓者也。
一、全台生番，急宜招抚也。查台湾番族，从前多在外山，客民愈多，日侵月削，挤归山内，种类滋繁。迩来亦知耕种为生，各相统属。平日往来山外，居民亦颇相安。惟土匪成群，聚集番民交界之处，抢劫居民，或侵番族田庐，或诓番民财货。争端一起，械斗不休。奸民被杀，则诉冤于官，官辄兴师剿办。番族被冤，则无官可诉，类多集众复仇。番祸一兴，杀掠生番者转得置身事外，而生番杀掠，多系良民。将恐积怨日深，终至民番俱毙。不谋招抚，必致陕甘回乱之忧。即以防务论，台疆千里，防海又须防番。万一外寇猝临，阴结番民，使生内乱，腹心之害，何以御之？诚令全番归化，内乱无虞，外患虽来，尚可驱之御侮。既可减防节饷，又可伐内山之木以裕饷源。此抚番之不容缓者也。
查设防、练兵、清赋三端，皆可及时举办，惟抚番须待三者办成之后，方可议行。其次设电、购轮、造桥、修路，以通南北之邮，理屯、兴垦、开矿、取材，以兴自然之利，臣智识庸驽，难胜艰钜。御敌既无方略，办事又乏精诚，每念时局艰难，不获报称万一，彷徨中夜，惭疚万端！惟有殚竭愚忱，勉图职守。虽目疾万分沉重，残驱苟可支持，不敢片刻稍休，尤不敢自安缄默。除俟台南北各营撤定后，再将选留兵将分扎地方、另行续奏外，谨拟台澎善后诸大端，驰陈圣鉴。
按清赋条自言不谙吏治，昧于理财，时商沈应奎以求办理之法，推贤让能，非古大臣不能与此，此其所以成大功也。陈澹然识。
覆陈抚番清赋情形摺（光绪十四年十二月十六日台北府发）
光绪十四年十二月十三日，承准军机大臣字寄：光绪十四年十一月十一日奉上谕：‘有人奏疆臣不胜职任据实纠参一摺，据称刘铭传于抚番、清丈，徒事铺张，致有埤南激变之事；并任用非人，漫视民瘼，以致奸民土匪乘机作乱，官激民变，确有明征，用人办事，颟顸竭蹶各节。又片奏彰化各处，因科派单费，一乡尽逃，台南尤甚；及投效函招各员委署凤山等缺，变通补署，未免偏私各等语。刘铭传自简任台湾巡抚以来，办事尚为得力，惟恐操之过急，任用或不得人，措置不无失当，以致民心未协，激成近日番变。参摺所陈，均不为无因。着即钞寄刘铭传阅看，该抚当仰体朝廷开诚训诫、示以谤书之意，于摺内所陈，平心省察，据实覆奏。一面清厘正赋，禁革规费，并严查贪吏，从重惩办，勿稍瞻徇。至片奏台省缺员应请拣发一节，并着该抚酌核具奏。将此谕令知之。钦此’。仰见圣恩宽大，开诚训诫，信任不疑；臣何人斯，承兹眷遇；拜诵之下，感激涕零！
臣一介武夫，渥荷破格殊恩，畀以封疆重任，涓埃未报，惶悚滋深。惟莅台以来，惨淡经营，不辞劳怨，区区愚诚，妄冀孤岛自强，固七省海疆锁钥，仰副朝廷慎重海防之至意，抑亦微臣经营海表之初心。
台湾之抚番也，言者谓：番丁归化，宜有以善其后。乃十五、六万之众，未闻驭之；何人处之何地？何以筹其生计？何以驯其性情？不知抚番者，就而抚之、非迁而抚之也。台湾平埔民地居其四，高山番地居其六。番社错处，各有家室，各有田庐，耕凿自安，何须处之以地？且地多旷土，番人自垦外，尚招民垦，概未升科，何待筹其生计？各社本有头目曰“社长”，按社之大小，月给粮饷，钤束番丁。从前沿山垦民被杀，岁常千数百人，近则绝无仅有。番性虽犷，而舐犊之爱，转越恒情。乃择强大之社，饬令社长送子入学，与之衣食，教以言语，俾令粗识字义。大嵙崁抚垦局所收番童已二百人，乃父若母时来探望，莫不鼓舞欢欣。启番童之颛蒙，即以资众番之观感。其余抚垦十余局，均饬一律仿行，力筹教养。台湾抚番久矣，从前番民仇杀，官莫谁何，遂至纷争无已；徒以气质难驯，只可潜移，未容强致。此则阴阳气化之偏，虽圣人有不能骤夺者。
言者又谓：犒赏不赀，保奖优异，不免糜滥邀功。不知开道抚番，事皆艰钜。以经费言之，前江督沈葆桢创议举行，奏请每年开抚经费银二十万两，由闽协台。臣到任，闽省每年只协军饷银四十四万两，并无另协开抚经费。现在统计全台各局经费、各社番目口粮、及番童学塾，岁销不足十万两，较之从前抚番多而用费少；奏销可稽。以保奖言之，各营分布后山，数年来战亡病故，自提镇至千把，不下百余，兵勇死者二千余，均经奏报有案。除臣先后三次亲入内山剿抚叛番外，各将士年年苦战，择其尤为出力者随时保奖一、二人或十余人。三年之久，收抚生番十余万，辟地数百里，综计请奖不满五十人；保案可稽。此抚番之实在情形也。
台湾之清丈也，言者谓：甫报升科，旋有埤南激变之事。彰化等处，如果官民相安，何忽遍地皆贼？官激民变，确有明征。不知埤南本皆番，变非起自民。吕家望着名强社，犬羊反覆，乃事之常。奸匪张兆晖等以外籍游民，乘机抢劫番地，本无清丈，兆晖等又无尺寸田园。无论委员有无勒索，兆晖等断非被索之人。于清丈何与？台湾民情浮动，强悍异常，嘉、彰尤甚。从前抢斗巨案，无日不闻。臣莅任后，严拏着匪百数十，立置重典，抢斗之风稍戢。所谓嘉义新彰交界匪徒，究其踪迹，无非乘乱窃发，抢劫民财。其人无业无粮，又于清丈何与？惟彰化逆匪围城，谓因清赋激变，不为无因。但系绅激民变，非激自官。臣已将逆绅施家珍等挟仇谋逆等情具奏在案。如果官激民变，宜乎合县皆变矣。何以抗粮只鹿港一堡？会盟围城，又只鹿港附近数十村庄？其余各堡，匪特无变，如田产最多之绅士道员林朝栋，尚且力解城围，不遗余力。然此或谓臣委用，不能不仰助官军。郎中蔡占鳌，彰化第一巨富也，帮同解散胁从，拏匪首蔡芳正法。世职洪磐安、训导杨春华等亦各带练助剿。岂清丈独苛于鹿港一隅耶？