某哭公诗：二月长於天昼昏，都人争举李膺幡。笑将涕泪辞知己，坐索衣冠谢主恩。无路请还先轸首，何人招返屈原魂！当年北寺留皮骨，此日南朝仗尔存。
是时，闯贼李自成败，奔至湖广之通城有九宫山，为村民锄梃击死，献其首於楚督何腾蛟以闻（自成败出潼关，追至九宫山下，饥困。亲率十余骑上山觇形势；与金住僧，命炊饭。僧疑为逃将，有重赀。窃下山语村民，竞持锄梃上山乱击之，皆毙。解其衣，中有金龙衣者，箭镞集於其目，乃知为自成；枭其首报。腾蛟遂据实奏闻，略无夸张冒功之语；举朝叹服之）。其众无所归，推其兄子李锦（号一只虎）为主；同自成妻高氏乞降。腾蛟遣长沙知府周二南迎之；未至，中流矢死。贼帅欲得腾蛟亲至乃降，腾蛟即同道臣堵允锡径造贼营，贼帅惊喜，悉听命；一时增兵十余万。上大喜，告庙。进腾蛟大学士，封定兴侯；升允锡副都御史，巡抚湖南。降将皆授总兵官，李锦赐名李赤心、高氏弟赐名高必正，号其营为「忠贞营」。已因湖南粮不给，降者稍稍解去。李、高十三部散入施州卫，因粮歇马；其郝摇旗（改名永忠）、马进忠、王进才、张光翠、袁应第、午万才、张先璧等十余营，悉隶腾蛟麾下，受节制，声势颇壮。
九月，两广总制丁魁楚以桂林捷闻。先是，靖江王亨嘉於八月僭称监国，以杨国威为大将，踞有桂林。闽中颁诏，不受。广西新任巡抚瞿式耜甫至梧州闻变，即移书魁楚为备；檄思恩参将陈邦傅防梧。亨嘉自桂平道井济，促式耜赴桂林任，不应；亲率兵至梧，执式耜，劫其敕印，先用小艇载回桂林。而魁楚调邦傅及赵千驷、严遵诰、马吉翔等与亨嘉战，败之；追至桂林。靖江既败回，窘蹙，仍以敕印还式耜，趣出视事，令止东师；而师已抵城下矣。式耜在城，阴结国威标将焦琏为己用。兵至，琏与邦傅合。守城者皆琏兵，邦傅缒而入，遂破桂林。俘亨嘉及杨国威、顾奕等（奕，桂林推官，为靖江吏科给事中）至闽，戮於市；废亨嘉为庶人，幽死。封魁楚平粤伯，晋式耜兵部右侍郎。
十月，遣兵科给事中刘中藻颁诏浙东。浙东於六月初一日，张国维、方逢年、熊汝霖、孙嘉绩、郑遵谦、朱大典等已迎鲁王於台州，监国绍兴。中藻颁诏至，鲁王下令仍返台州。国维曰：今日之事，凡为高皇帝子孙，皆同心并力，共复国仇。有功之後，入关者王，此时未可定上下也。即具疏上言；且言监国当人心奔散之日，倡集为劳。一旦南拜正朔，猝然有变，鞭长不及，唇亡齿寒，悔莫可追。臣老臣也，岂若朝秦暮楚之客有左右其间哉！汝霖等皆曰：吾知奉主上而已；不知其他。遂不奉诏。中藻废然返，而闽与浙分水火矣。
上痛国事之坏，皆由守令以贪，失民心；欲杀贪吏数人；以惩其余。建阳知县施〈火豦〉，首以贪酷被逮。邵武推官朱健行部近邑，讹传北兵至，仓皇返郡，即潜遣其孥出城；知府吴炆炜继之，百姓有争门死者，实未有兵也。健无以自解，乃揭炆炜倡逃，并其平日赃秽状；炆炜亦揭健。上并逮至，〈火豦〉与炆炜论斩，健亦弃市；勳辅以下皆为申救，不听。
原任兵部侍郎王朝昇及彭遇凯至行在陛见，上加期昇总督、遇凯佥都御史；大学士路振飞、曾樱封还内降。上曰：方今多事，用人勿拘常调。振飞言：遇凯新进士，降贼而南；附马士英，改御史巡按浙江，因搜括闾阎，以至激变。期昇在太湖奉宗室盛徵称通城王，居然帝制；派饷卖劄，强夺民女，为两山百姓不容，乃逃入闽。臣等非有私隙也。上乃止。是时熊开元以大学士掌都察院事，颇重资格，恶以口舌得官者。上既特授钱邦芑御史，邦芑疏辞；开元因奏改兵部司务，台中合疏争之。上重违开元意，令邦芑以司务随征，许「非时言事，补朕阙失」。名为司务，实御史也。
初，汀、赣之间有峒贼数万，时出剽掠；百姓苦之。号为阎罗总目，分四营，故又名四营头；其前左营最强。张安者，首左营之一营也；骁勇善战，久有归正意。永宁王招出湖东，与敌遇，屡战皆捷；遂复抚州。湖西则临江乡绅杨廷麟与吉水乡绅刘同升以义师恢复临江。於是杨廷麟等争请上出江右，何腾蛟请出湖南，而浙中诸将亦望上幸衢州；原任山东临清知州金堡陛见，劝上急宜弃闽幸楚；腾蛟可恃、芝龙不可恃也。且言今时天子宜为将，不宜为帝。湖南有腾蛟新抚诸营，皇上亲入其军，效光武击铜马故事，此皆战兵可用。中兴天子，须以马上成功；若夫千骑万乘、出警入跸之威仪，皆可去也。上大喜，语廷臣曰：朕得金堡，如获至宝。即授堡兵科给事中；堡以守制固辞，请敕印联络江上义师以出。上遂决意出赣州，幸长沙。先遣大学士苏观生赴南安募兵，中途接应；上亲祖送之（金堡字道隐，杭州仁和人。庚辰进士，初任临清知州。京师陷，南奔。旋丁内艰，与乡人姚志卓起义山中。志卓屡有克捷，与江东诸营遥为声援。堡入闽，奏其功；上大喜，封志卓为仁武伯。擢堡兵科给事中，以服辞；乃请敕印、假虚衔，以墨衰从戎，联络江上义师。既至江东，入方国安营。鲁诸臣以堡北来奸细，争攻击之；监国以谕国安，国安遂执之。御史陈潜夫语国安曰：堡与姚志卓起义建功，公固知之，曾许迎其家渡江；今何乃尔？国安悟曰：是也。然此举非遵监国令，乃闽中二郑有书必欲杀之耳。盖二郑恶堡劝上弃闽幸楚，谓芝龙不可恃也。
因出示芝龙书，且云：吾纵其去，去勿入闽；若入闽，吾必追杀之。不然，无以取信二郑也。潜夫以谓堡，堡曰：吾必入闽缴敕印。倘中道被杀，是死於盗耳；命也。遂行。以次年夏至闽，缴上联络义师敕印。上欲夺情，堡再三辞；不允。已引先朝「杨嗣昌夺情，为黄道周诸正人所不容」为案；奉旨：嗣昌小人，何得与尔比例。芝龙见之，以为行将大拜堡也，忌害益甚。是时，上在延平，辅臣曾樱留守福州。隐知郑意，密疏劝上：欲保全金堡，莫如听其辞。堡凡七辞，同官朱某等亦代为请，始允。堡以丙戌八月十五日辞朝，从延平出汀、赣趋衡州。而上已有旨谕腾蛟，遣兵迎驾；腾蛟命郝永忠率銕骑五千赴行在，至韶州，闻汀州之变而返）。
十一月，上下诏亲征，以唐、邓二王监国。旧辅何吾驺自广东至，用为首辅，随营。以曾樱协同郑芝龙留守天兴，料理兵饷。以郑鸿逵为御营左先锋，出浙江；郑彩为御营右先锋，出江西。筑坛西郊，择吉日行推毂礼，鸿逵出城，马蹶仆地。及上誓师授钺，大风起，天帝及高皇帝位前烛皆灭，三军失色。以十二月十六日发福州，二十六日，驻跸建宁（上所部置，皆阳顺郑氏意，移跸建宁。其实信堡言，将相机出赣州、趋长沙也）。
二年丙戌正月己酉朔，上在建宁，不受朝贺；以三大罪自责，令百官皆戴罪立功。初□日大雨雹，雹大如斗，或如刀剑。天昼黑，对面不相见。
予有闽江水雹歌：闽江正月气郁蒸，日午天南赤血凝；照见江水蛟龙頳，划然有声加裂缯。少焉赤散云泼墨，北风刮云天昼黑；闽江舟人无颜色，须眉对面不相识。秦川公子善天文，急占有雹缆江濆；敛襟危坐敬天怒，须臾雹下何纷纷。初如刀剑相击争，忽似山摧万壑鸣；小如杯盘大如轮，恐是天上金银宫阙一时倾。沿江舴艋半打破，官舫漏彻何由坐；呼僮开舱扫雪堆，风亦渐止雹亦过。白须罟师老江边，自言此异人未传。此是阴气盛，毋乃兵祸连。北地沍冻固宜有，南方炎热今何然？天时地气俱变易，世人安得太平年！
交址、日本诸国皆遣使入贡。广东布政使汤来贺运粤饷十万由海道至，升来贺户部右侍郎（御史艾南英言解饷微劳，不宜遽膺显擢。且言来贺奸党周锺自贼逃回，曾匿来贺扬州刑署中云云。盖南英与锺旧有文字隙，至是以为来贺罪案，人咸笑之）。
二月，马胫岭兵变，命辅臣路振飞至浦城安抚之。江、楚迎驾疏相继而至，上意遂决出汀州入赣，与湖南为声援。芝龙欲挟上以自重，固请回天兴；令军民数万人遮道呼号拥驾，不得行，仍驻跸延平（芝龙初以海贼受抚，虽晋五等爵，与地方有司不相统属；闽士大夫辄呼之为贼，绝不与通。及拥戴上即位，芝龙位益尊、权益重；全闽兵马钱粮，皆领於芝龙兄弟。是芝龙以虚名奉上，而上以全闽与芝龙也。故芝龙不肯听上出闽，思常有闽也）。
马士英叩关请入朝，上数其罪，不许；前後七疏自理。有李蘧者，士英私人也；与上有旧，密疏言士英有治兵才，与阮大铖皆宜在使过之列。上特许士英以青衣视事，戴罪立功。鲁王遣其臣柯夏卿、曹惟才来聘，上加夏卿兵部尚书、惟才光禄寺卿。手书与王，谓朕无子，王为皇太侄；同心戮力，共拜孝陵。朕有天下，终致於王。取浙东所用职官，并列朝籍，不分彼此。已遣佥都御史陆清源（浙江平湖人）解饷十万犒浙东师。至江上，方国安纵兵攫饷，杀清源。闽、浙衅益深（或曰：士英激使之也）。