二十五日（癸酉），谕议政王军机大臣等：顺天府府尹林寿图奏（请厘剔闽省积弊）一摺，据称（闽省州县交代未清者数百案，无案不与军需轇轕。各州县或因募勇过兵，设法筹垫；不肖者或以例得请销，有心浮报。事平造册，而上司准驳之权操之幕友、委员、书吏，藩司之外另立军需局，往返稽延，以便高下其手；尚有不淮不驳，久为寝阁，以俟其浼托关通者。州县照原报抵交，後任以未奉批准，不肯接收，交案因而日积；须遴派贤员悉心考核，照过兵数目、驻兵日期、募勇原案、勇饷章程，分别应淮应驳，不使刀笔之吏便其私图：此报销之亟宜查办也。闽省前因钱法疲敝，奏停永丰官局。嗣因兵饷不敷，复出淮银司票，标写淮纳税课钱粮，实止茶叶、洋药二项厘税可以搭交；入少出多，递有减折，徒使牟利商民坐享其利，於国计民生毫无裨益。且恐商人与外洋交易，贱收司票，假手支银。宜将已发司票，定章收缴，永不再出：此司票之急宜停止也。全闽土产，以洋药、茶叶为大宗。自添设厘金以来，微至手挈肩挑，亦皆层层抽税，商民交困。厘局有总督衙门承办书吏分设局所饭食等费，名目滋繁，与小民争利；一以官势行之，往往激而生变。如福州、兴化、泉州各局，皆有闯关毁卡之事，官亦无如之何：此杂项抽厘之亟宜裁革也。至茶叶、洋药两项，当於本行户中酌举数人，轮流承办，不必多派委员）等语。福建积弊已深，亟宜力加整顿；着耆龄、徐宗干按照所奏各条逐一访查，务使无弊不剔、有犯必惩，以肃官常而苏民困。原摺着钞给阅看。耆龄现在浦城，恐其未能兼顾地方公事；徐宗干务当不避嫌怨，实力办理。耆龄前奏围攻汤溪，进取武义，并拨兵援剿台湾；当经谕令该督督饬康国器等随同蒋益澧迅拔坚城，并催林文察攻克武义。现在军情未知若何？着即相机督剿，以期渐次肃清。台湾地方紧要；该督、抚务须会商添派兵勇，迅速蒇事，毋令日久生懈。各路近日军情，仍着随时具奏。前有旨令秦如虎署理浙江提督，该员是否销假？着耆龄再行严催赴任，毋任再延。徐宗干交查事件，日久尚未奏结；着即认真查办，迅速覆奏，毋许稽延。将此各谕令知之。寻耆龄奏：闽省各属报销，业经派员经理，严催造报。司票易滋流弊，现拟妥定收缴章程；厘金向来不徵小贩，惟设卡过多，现筹归并。台湾嘉义、凤山一带复有匪徒窃发，现已击散，嘉义县城解围。彰化逆匪叠次扑营，均经击退；近复图犯大甲汛城，现已调兵防守。浙江提督秦如虎，已报即赴署任。报闻。
二十七日（乙亥），谕〔议政王军机大臣等〕：徐宗干奏（调集内地官兵渡台分剿，并台湾道洪毓琛历陈彰化逆匪情形）一摺，逆首戴万生自攻陷斗六斗後，进逼嘉义，台湾郡城亦岌岌可危。曾玉明现顾北路、保守鹿港，未能分军援嘉。该抚现委吴鸿源暂署水师提督，藉壮声威；着即饬该署提督督率各军奋力兜剿，先将嘉义近城，贼寨扫荡，克复斗六、进规彰化，以期与曾玉明合力会剿，肃清台境。耆龄远在浦城，鞭长莫及。该抚责无旁贷，务当振刷精神，严饬派出各军实力剿办，并督饬洪毓琛就近激励将士，迅扫妖氛；不得贻误，致乾咎戾。林向荣及斗六军营文武下落，迅速查明具奏。将此由六百里谕知徐宗干，并传谕洪毓琛知之。
十二月二十一日（戊戍），谕〔议政王军机大臣等〕：洪毓琛奏（斗六失陷、嘉义吃紧，现办情形）一摺，斗六为嘉、彰联界之所，既已失陷，非力固嘉义，则郡城岌岌可危，所关非轻。前据徐宗干奏：（已饬吴鸿源统带各军渡台，援剿嘉义；曾玉明一军保守鹿港，专顾北路）。惟此时嘉义尤形吃紧，且郡城精锐兵勇悉皆调归林向荣部下，自败挫後兵勇散亡；刻下援嘉之师，非厚集兵力，不足扫荡逆氛。曾玉明素习战阵，着即迅饬该总兵督率所部，节节进剿；并迅催吴鸿源统带诸军前进，会合夹击，保全嘉义、进攻彰化，肃清台境，毋致稽延时日。逆党林晟踞守彰城，欲牵制曾玉明兵勇，则鹿港亦须兼顾；并着饬令该总兵等分拨兵勇，严为扼剿。该督等务当振刷精神，严饬各军速歼逆氛，不得稍有贻误；致令匪势蔓延，自干咎戾。洪毓琛近在郡城，一切守御事宜及各营派兵筹饷，尤宜悉心筹办。此时斗六既陷、彰化未复，道路恐致中阻；所需粮饷、军火，仍着设法由海道运往接济。将此由六百里谕知耆龄、徐宗干，并传谕洪毓琛知之。
调福建福宁镇总兵官曾玉明为台湾总兵官、四川建昌镇总兵官林文察为福建福甯镇总兵官。
复福建台湾阵亡已革总兵官林向荣原官暨副将王国忠、游击颜常春、同知宁长敬均予祭葬、世职。
三十日（丁未），谕〔议政王军机大臣等〕：耆龄奏：（贼援汤溪，迎剿获胜，及催调水陆援师进攻台湾）各摺片，汤溪逆匪久已穷蹙，知府康国器率部攻剿，虽因援贼众多，而旷日持久，蕞尔小城尚未攻拔；其剿办未能得力，已可概见，且闻有纵勇滋扰各情。现在该督添募南康勇三千名前往助剿，即着严饬在事员弁迅速攻拔，毋再迁延。台湾军情，自斗六失陷，贼势愈炽；在事将弁，甚可痛恨！金、厦、铜山徵兵既已抵台，吴鸿源等所部岂可任意逗遛！着耆龄、徐宗干严催该副将等即日渡台，将斗六先图克复，以解郡城之急，再行节节进剿；毋得徒托空言。日久无成，必将在事员弁托严惩办，恐该督、抚亦不能当此重咎也。将此由六百里谕令知之。
同治二年（一八六三、癸亥）春正月初七日（甲寅），谕〔议政王军机大臣等〕：洪毓琛奏（郡城防守觕定，现拟先靖近城各路、再剿彰逆）一摺，台湾匪徒猖獗，彰城尚被匪踞，嘉义及郡城时形吃紧；必须添兵济饷，方足以资攻剿。前已谕令耆龄、徐宗干迅饬曾玉明、吴鸿源诸军厚集兵力，进攻彰化，保全嘉义，肃清台境。着该督速饬该总兵等督率兵勇会合前进，力图扫荡；如兵力不敷，即添拨内地官军迅速渡台，以资剿办。至台湾饷需，并着该督等赶紧设法筹济。洪毓琛现在郡城，一切筹防及饷项事宜，仍着悉心筹办；就现有兵力分投攻剿，不得专待援师，致匪势日形猖獗。将此由五百里谕知耆龄、徐宗干，并传谕洪毓琛知之。
擢记名道张铨庆为福建布政使。
初九日（丙辰），命福建学政厉恩官来京，以翰林院修撰章鋆提督福建学政。
二月十一日（丁亥），谕〔议政王军机大臣等〕：耆龄奏（援师克复永康、武义两县详细情形，并东阳、义乌、浦江等县踞贼逃遁）一摺，逆匪盘踞浙东各城，并分股屯聚永康、武义牵制我军，自攻克汤溪、龙游各城後，复经林文察等将永康等城克复，义乌、浦江之贼俱渡江窜往杭州；是浙东贼势日渐穷蹙。现在耆龄已饬林文察、康国器等率台、广、南康各勇由义乌、东阳分路前进，会合浙师扫荡浙东；即着饬令派出各军会同左宗棠所部将弁，乘此声威迅克绍郡，进规杭、嘉、湖三府以靖全浙。至贼匪时思旁窜，其界连江西、福建各隘口，该督仍应处处兼顾。前谕该督居中策应，以仍驻浦城为宜；即当遵旨酌量情形办理，毋稍疏虞。将此由五百里谕令知之。
十九日（乙未），谕〔议政王军机大臣等〕：徐宗干奏（台湾各路官军叠获胜仗，并内地援师抵郡会剿）一摺，台匪久踞彰城，攻陷斗六，分扑嘉城；台湾道洪毓琛等派拨义首李成龙等由盐水港进剿北路，其另股分扑嘉城之贼亦经参将汤得陞等先後击退，保全嘉城：是台境军情已有转机，彰城踞匪无多。吴鸿源现已统领全军抵台，军威益振；即着耆龄、徐宗干督饬该署提督等会合曾玉明、洪毓琛水陆各军联络一气，迅将彰城、斗六攻克，肃清台境。逆首戴万生遁入番社，贼党难保不思他窜；并着迅速拏获，以清後患。本日据左宗棠奏：（绍兴克复，浙东已就肃清，闽防稍松）。如台境兵力不敷，即着耆龄等酌拨兵勇前往，以便及早廓清台境。刻下各路援师赴台，一切军火、粮饷，即着洪毓琛悉心妥筹解济，毋稍贻误。将此由六百里谕知耆龄、徐宗干，并传谕洪毓琛知之。
三月十六日（壬戌），谕〔议政王军机大臣等〕：本日洪毓琛奏（派队进攻盐水港贼匪获胜，台湾郡城防守已固，署提督吴鸿源援师进发）一摺，与上月徐宗干奏到各情形大略相同。惟据徐宗干奏称逆首戴万生遁入番社；而此次洪毓琛所奏，则戴逆仍踞守彰化县城。现在贼势穷蹙，西螺义民请给劄谕清庄练勇；即着宽其既往，饬令迅将戴、林二逆捦获，毋得徒托空言。倘能迅速蒇事，即准破格保桨，俾知感奋。吴鸿源已由盐水港进发，谅近日嘉义城外匪党早可肃清；即着耆龄、徐宗干转饬该署提督等仍遵前旨，克期将彰化、斗六克复，毋得稍涉稽延，至有窜逸之虞。其鹿港营盘，并着转饬曾玉明严密防守，毋稍疏懈。再，四川成绵龙茂道锺峻，前因该省清查捐募案内有该员经手事件，听候查办。现在员缺久悬，如该员应查事件业已完结，即饬迅赴新任；倘一时不克赴任，即着奏闻，毋稍迁就。将此由四百里谕知耆龄、徐宗干，并传谕洪毓琛知之。
予福建彰化阵亡守备刘国标等祭葬、世职加等。