庚戌（二十九日），宣平定江南捷音。
六月丙辰（初五日），遣侍卫尼雅达、费扬古等齎敕往谕豫亲王多铎等。敕曰：“览王等奏捷，朕心不胜喜悦！前者，击败流贼，着有懋功。未几，平河南、取扬州、破扬子江水陆诸营，直抵金陵，江南遂定。此皆王与诸臣同心报国所致，深可嘉尚！至各郡邑投诚官员，或为福王所用、或为王等所委，俱开明履历，分别注册。各处文武、军民，尽令薙发；倘有不从，以军法从事。其郡邑有未下者，或宜移檄招抚、或宜统兵征剿：地方一切事宜，酌议速奏”。
辛酉（初十日），定国大将军豫亲王多铎等奏：“南京既克，福王潜遁太平，遣贝勒尼堪、护军统领图赖、固山额真阿山、贝子屯齐、和托、护军统领阿济格尼堪、阿尔津、敦拜、署护军统领杜尔德、梅勒章京伊尔德、阿哈尼堪、前锋统领努山等率兵追之。福王走芜湖，我兵趋击；福王登舟欲渡江，图赖遂据江口，截其去路。伪靖国公黄得功逆战，击败之；敌兵皆堕水，尽夺其舟，得功中流矢死。伪总兵田雄、马得功缚福王及其妃来献，并率十总兵部众降，获金银、紬段、宝玉、貂皮等物无算”。得旨：“朕览王奏，福王朱由崧就擒，将领兵丁尽行归顺；知道了。王平定江南，克有成绩，深可嘉悦！本内各营功次，一并详察，以便优叙”。
丙寅（十五日）遣侍卫绰克图、巴克善往谕和硕豫亲王多译等。敕曰：“览王等奏捷，不胜喜悦！江南既定，福王就擒，此皆王与诸臣协力效忠所致。王可移文各该地方，宣布德意，招抚居民。钱粮应徵者照常徵收，应解京者照常运送。其投降骑兵，仍留彼地；步兵应留若干？应裁若干？尔等酌量裁减。蒙古人有投顺者，俱分隶旗下；俟回军日同赴京师安插，口粮照满洲兵丁支给。文武各官印信，俟尔等除授文册到日颁发。守洪武陵寝官员且暂留，将其官役地亩钱粮数目俱明注於册，送京裁夺。南京或仍为京、或改为省，俟大定日再议。一切紧要图籍，俱着收藏毋失”。
丁卯（十六日），镇守庐、凤、淮、扬等处固山额真准塔等奏：“五月间，臣自徐州水陆并进，值刘泽清下副将高佑统战舰攻宿迁，官兵大败之。师次清河，泽清所部总兵马化豹、副将张思义等率兵四万、船千余艘，据淮、黄、清三河口，连营十里。梅勒章京康喀赖同游击范炳、吉天相等率兵渡清河，列营相距，以炮击败敌舰。复遣都司楚进功率步兵六百人拒黄河北岸，鸣炮相应。又分兵两路：一自清河上游进击，一攻对岸马步敌兵：俱败之。合军追入淮安界，斩其副将二、参将一。师次清江浦，监司范鸣珂携敕印来降。泽清同伪总兵田仰，各率兵丁、家口登舟遁。伪总兵柏永馥率所部及城中官民出迎，遂克淮安。其凤阳、庐州一带望风纳款，臣随领兵巡历各处，安抚居民，委署官吏。是役共投降监司一、总兵一、副将二十三、参将二十五、游击四十、都司守备七十三，获船五百余艘、马九百余匹、橐驼二十五只、红衣炮一百二十位、银四万七千两”。下兵部察叙。
己卯（二十八日），诏曰：“本朝立国有年，幅员既广，无意并兼。向来疆场构兵，本欲言归於好；不期寇凶极祸，明运永终。於是整旅入关，代为雪耻；犹以贼渠未殄，不遑起居，随命二王誓师西讨。而南中乘衅立君，妄僭尊号；亟行乱政，重困人民。朕用是夙夜祗惧，思救茕黎。西贼既摧，旋命南伐，兵无顿刃。循汴抵淮；甫克维扬，随平江左。金陵士女，绍我见休。既获福藩，南土略定。特宏大赉，嘉与维新。其河南、江北、江南官民诖误，咸赦除之。从前横徵逋赋，悉行蠲免。大军所过，免今年税粮之半；余免三之一”。
故明总兵高进忠率部将黄中色等六十七人同都御史王燮、御史苏京自海中云台山请降。得旨：“江南既入版图，天下一统；朝廷方招罗俊杰，广示包容。总兵高进忠并文官王燮、苏京抒诚归顺，良可嘉悦！着遣官齎诏往谕。又马登洪、林庆业等已曾归顺，後闻福王潜号南京，遂不果来；今福王被擒，登洪等心怀疑愧，逡巡岛屿，殊为可念！特将前罪尽行赦免，亦差官齎诏招徕抚慰。若遵制薙发，幡然来归，许与新顺将帅一体优叙”。
闰六月甲申（初四日），靖远大将军英亲王阿济格等奏：“流贼李自成率西安府马步贼兵十三万并湖广襄阳、承天、荆州、德安四府所属各州县原设守御贼兵七万，共计二十万；声言欲取南京，水陆并进。我兵亦分水陆两路蹑其後，追及於邓州、承天、德安、武昌、富池口、桑家口、九江等七处，降者抚之、拒者诛之。穷追至贼老营，大败贼兵八次；贼兵尽力穷；窜入九宫山。随於山中遍索自成，不得。又四出搜缉，有降卒及被擒贼兵，俱言自成窜走时，携随身步卒仅二十人，为村民所困；不能脱，遂自缢死。因遣素识自成者往认其屍，屍朽莫辨。或存或亡，俟就彼再行察访。俘自成两叔伪赵侯、伪襄南侯并自成妻妾二口，获金印一颗，又获伪汝侯刘宗闵并一妻二媳、自成养子伪义侯姜耐妻、伪齐侯顾英妻、伪总兵左光先并一妻三子及术士伪军师宗矮子，又获太原府故明晋王二妃。其自成两叔及伪汝侯刘宗闵，俱斩於军。自成又有妻妾三口因追急，投扬子江死。计我兵追蹑自成及分翼出师败贼凡十有三战，获驼三十一、马赢六千四百五十、船三千一百八艘。又有故明宁南侯左良玉子梦庚、总督袁继咸、守道李犹龙、巡按黄树率总兵十二员、马步兵十万并家口泊舟於九江之东流县界扬子江中，俱投降，共带大小船艘四万。合计河南属城十二、湖广属城三十九、江西属城六、南京属城六，共计六十三城，设官抚定”。得旨：“逆贼李自成罪恶贯盈，神人共怒；朕恭行天讨，定乱救民。览王奏报，知督兵追剿直至九江，破贼众二十余万，所获马驼、船艘各数千计，贼寇荡平；及收降故帅左良玉子梦庚等兵十万人、船四万艘，河南，湖广、江西、江南等处尽皆归顺：朕甚嘉悦！郊、庙、社稷祭告礼仪，即择吉举行。王运筹决胜，茂着勳庸；特遣侍臣，前赴军中慰劳。一应有功内外王公、将士，作速察叙，以凭封赏”。
庚寅（初十日），遣侍卫坤巴图鲁齎书往谕英亲王阿济格等曰：“顷者，览王奏捷，知王与诸将同心奋勇，扫灭逆寇，克奏肤功；朕甚嘉悦！念王及行间将士驱驰跋涉悬崖峻岭、深江大河，万有余里；亦可谓劳苦而功高矣。今寇氛既靖，宜即班师。其左梦庚及河南北招抚兵丁，亦与偕来。余兵应留充军伍或散归田里，王与诸大臣商榷行之。故明晋藩二王妃，可优礼卫送来京”。
癸巳（十三日），命内大学士太子太保兵部尚书兼右副都御史洪承畴以原官总督军务，招抚江南各省。
癸卯（二十三日），以恭顺侯吴惟华为太子太保兼右副都御史总督军务，招抚广东；礼部左侍郎孙之獬为兵部尚书兼右副都御史、翰林院侍读学士提督军务，招抚江西；尚宝寺卿黄熙允为兵部右侍郎兼右佥都御史，招抚福建；原任大同巡抚江禹绪仍以兵部右待郎兼有佥都御史提督军务，招抚湖广；刑部郎中丁之龙为兵部右侍郎兼右佥都御史，招怃云、贵。
定国大将军豫亲王多铎等奏：“定南京後，令贝勒博洛、固山额真拜尹图、阿山等率兵趋杭州，招抚浙省。我兵至杭，贼分两路迎敌，大败之。是夜，贼兵悉渡钱塘江逃窜，我兵追至江岸驻营。贼兵见之，以为江潮朝夕有信，我兵必被淹；乃潮水连日不至，阖郡惊为神助。潞王大恐，遂率众开门纳款；浙西湖州、嘉兴、浙东绍兴、宁波、台州、严州等府，亦皆归顺。绍兴淮王渡江来见；复遣人至湖州絷周王眷属，移杭安置；收总兵王之仁所部兵将二万五千人。又闻杜阳王在庐州、和州作乱，随令总兵官吴兆胜等率师往剿，获杜阳王并其妻子”。得旨：“览王奏报，官兵进取杭州，潞王势穷归顺，浙江各府尽报遵依；总兵王之仁率众投降，杜阳王作乱擒获：俱知道了。王频奏奇勳，朕甚嘉悦！有功将帅、官兵，速行察叙”。
乙巳（二十五日），谕：“南京，着改为江南省；设官事宜，照各省例行。但向来久称都会，地广事繁；诸司职掌作何分任，听总督大学士洪承畴到时酌妥奏闻”。
戊申（二十八日），投诚伪东平侯刘泽清奏请奉母回籍，不允；命赴京朝见。
秋七月壬子（初三日），命贝勒勒克德浑为平南大将军，同固山额真叶臣等往江南代豫亲王多铎。
赐招抚南方内院大学士洪承畴敕曰：“朕以江南初经归命，其余各省远迩未同，恐巳归者尚多惊疑，未附者或怀观望；保厘南土，实赖股肱。是用命卿招抚江南各省地方，总督军务兼理粮饷；驰往江南，昭宣德意。一遵近日恩赦诏款，核实举行，使新附兆民，咸沾实惠。凡满洲大兵、直省官兵各有统领，卿宜会同固山额真叶臣及督、抚、镇等官调遣约束。其有不法扰民，在各旗旗下者，即移文咨会依法处治，毋使困民。江南各省已经归顺者，即责成抚、按问民疾苦，兴利除害，速图善後之策。未归顺者，先以文告再三晓谕，果不服从，方可加以师旅；即有攻讨，亦以平定安集为先。其间进止机宜，密与平南大将军贝勒勒克德浑参酌施行。其深山穷谷，声教未通；或有顽梗无知，乘机啸聚。即移檄抚、镇等官，多方解散；如有不悛，速令翦除。凡南方降服水陆诸军，宜移会各督、抚挑选精壮，参用满、汉，教成水军，以备不时调用。军资、粮饷，俱从各省地方通融支给。如有福王新设兵丁，尽行革除。其额军应汰老弱及解散降民，须申饬各属安插得宜，毋令失所。凡关国计民生大利大害，不时驰奏，请旨兴革。其山林隐逸及故明废绅才德堪用者，从公谘访，徵聘来京；或军前先委署事者，开列上闻，下部察核实授。所属文武有才望出众、御侮保民显着成绩者，特奏荐擢。如奸贪庸懦，即奏请罢斥；毋延时日，致误地方。至用兵之际，有稽迟粮运、违误军机或临阵退缩、杀良冒功及借军兴以剥民、侵兵饷以肥己，文官五品以下、武官副将以下，皆以军法从事，镇、道等官飞章参劾。其江宁、江西、湖广及将归附各省，悉听节制。敕中开载未尽事宜，准便宜举行。卿以辅弼忠贞，膺兹重寄；宜开诚布公、集思广益，慎持大体，曲尽群情，期於德威遐布，南服永清。朕方崇带砺，用答肤功；毋得因循轻率，偏执乖方，有负倚托至意”。
癸丑（初四日），镇守淮、扬等处固山额真准塔等奏：“故明东平侯刘泽清率所部兵丁并文武各官归顺，原住石城岛总兵马登洪、朝鲜总兵林庆业亦降”。
乙卯（初六日），以刘应宾为右佥都御史，巡抚安庐池太（故明通政使）；土国宝为右副都御史，巡抚江甯（由总兵迁）。
丙辰（初七日），以都督同知谢弘仪为右都督，招抚广西。
己未（初十日），以何鸣銮为右佥都御史，巡抚湖广（故明兴国州知州）；高斗光为兵部右侍郎兼右副都御史，巡抚偏沅（故明凤阳巡抚）；潘士良为兵部右侍郎兼右佥都御史，抚治郧阳（由刑部右侍郎迁）。
戊辰（十九日），内大臣何洛会、河南巡抚罗绣锦等奏：“我兵进克西平县，贼首刘洪起伏诛，汝、宁等处悉平”。下部议叙。
丁丑（二十八日），凤阳巡抚赵福星奏：“伪弘光总漕田仰指薙发为名，鼓惑奸民作乱，杀通州、如皋、海门牧令；臣同梅勒章京谭布等领兵剿抚，悉就平定”。
八月丙午（二十七日），梅勒章京屯泰奏：“江西总兵金声桓征讨益王，阵获叛官王养正等六员、锺祥王朱慈〈荧，石代火〉等九人。随同文武各官审实，将叛官正法；其故王皆衰残废弃，或应发原籍姑留残喘，以彰我朝浩荡之仁”。得旨：“故明诸王，无论大小，俱着赴京朝见”。
九月庚戌（初二日），浙闽总督张存仁奏：“叛贼方国安、王之仁从富阳渡江犯杭城，遣副将张杰、王定国督兵往剿，斩首四千级，余贼复盘踞富阳，又令定国往余杭防剿；至关头，遇贼对垒。我师奋勇掩杀，追至小岭二十余里，斩获无算；阵擒国安子士衍等，斩之”。
癸丑（初五日），命镇国公傅勒赫、辅国公扎额纳等率师协防江西。
辛酉（十三日），镇守庐、凤等府固山额真准塔等奏：“故明新昌王潜遁海岛云台山，聚众作乱，攻陷兴化县。官兵进剿，破其巢穴，斩首三千级；获新昌王於淮安，斩之。
庚午（二十二日），‘海寇’田仰寇福山，江宁巡抚土国宝率副将曹虎等败之。