《本草纲目））记载：扁鹊三豆饮由绿豆、赤小豆、黑豆、甘草节组成，治疮毒初起，又治“天行痘疹，预服此饮，疏解热毒，纵出亦少”。故历代医家多将此方用治痘疹、疮毒之症。
根据多年实践验证，本方药性平和，味甘而淡，不伤胃气，而有清热解毒，活血祛风，养肝润肺，滋燥生津诸作用。具有滋养之功，但滋而无滞，虽清热解毒，但清而不伐。全方清中寓补，补中寓清。若能灵活加减，除疮毒、痘疹之外，还可用于因风、热、燥、火等阳邪为患，导致伤津耗液之燥热等证；更适用于脏腑机能失调如内脏津亏，或脏腑燥热伤阴之证，如肺肾阴虚，肝肾阴虚，肺虚燥热，肺胃郁热，肝虚不眠等方面。经多年广泛运用于临床，灵活加减，疗效颇佳。
一、基础方及各豆功能
（一）基础方及加减药味基础方：黑豆，绿豆，红饭豆。替换用药方：淡豆豉，扁豆。
加减法：疏风解表加：桑叶、薄荷；清热解毒加：银花、连翘；泻火解毒加：黄芩、栀子、生石膏；破滞去瘀加：枳实、焦楂；清咽利膈加：牛蒡子、桔梗；宣肺止咳加：杏仁、贝母、枳壳；宣透痘疹加；虫蜕、芫荽、香菌脚；祛风止痒加：僵蚕、蝉蜕、刺吉力；清热消肿加：元参、夏枯草；清心除烦加：竹茹、灯心、栀子；养阴润燥加：麦冬、沙参、果杞、五味子；养肝润燥加：乌梅、冰糖；补益脾肺加：山药、莲子、苡仁；补脾养阴加：太子参、乌梅、山药。
上列各组药物，视病情需要可选择一、二组加入。
（二）各豆的功能
黑豆：性味甘平，入肝、肾二经。功能活血，利水，祛风，解毒。本品尚有润肾燥而止盗汗，补肾虚而止遗尿。
绿豆：性味甘平，入心、胃二经。功能清热解毒，消暑，利水。《药性三字经》谓本品“通行十二经”，“解一切药草。牛、马、金石诸毒。”
红饭豆：又名赤豆，本品性味甘酸平，入心、小肠二经。功能利水除湿，止痒，和血排脓，消肿解毒。古人有“久食瘦人”之说。
淡豆豉：由黑豆经加工发酵而成，性味辛而微苦，入肺、胃二经，有解毒除烦之功，但因炮制方法不同而性味各异。用青蒿、桑叶同制者，则药性偏寒，用麻黄、苏叶等同制者，则药性偏温。
扁豆：性味甘，微温。入肺、脾二经，健脾养胃，消暑除湿，补脾而不滋腻，化湿而不燥烈，为缓和滋养之品。
二、临床应用
（一）用于麻疹
1.麻疹初期，证偏阳热者，用淡豆豉、黑豆、绿豆，加桑叶、薄荷、虫蜕、香菌脚。若服后疹出顺畅，发热渐退，改用红饭豆、黑豆、绿豆加乌梅、冰糖，养肝润燥生滓，以资调整。
2.麻疹后期，热退、疹消，如出现视物不明，皮肤搔痒者，若属热伤肺阴，肺阴受损，宜清肺热、补肝阴为主，用黑豆、绿豆、扁豆、虫蜕、关吉力、赤芍、果杞治之。痒止后，仍用三豆加石决明、广木贼、关吉力、密蒙花、鸡肝。滋肝明目，以恢复视力。
3.麻疹靥后，若肝肺余热不尽，症见低热持续，微咳不止，治宜养阴润燥兼清肺经余热，用三豆汤合二仙汤（黑豆、绿豆、红饭豆、黄芩、杭芍）治之。如服后热退咳止。继用三豆汤加乌梅、冰糖，酸甘化阴调治为宜。
麻疹后期，变证颇多，如属有余之证，或余邪未尽，或肝肺津枯，均可采用三豆汤加减治之。
（二）用于风热和火毒
1.表邪外束，肺胃郁热，发热，咳嗽，头身疼痛，舌红，苔薄黄或薄白少津，脉浮数，证属风热袭肺，肺气不降，
（如支周感染等）治宜疏散风热，降逆止咳。方用枳实三豆银翘散（枳实、黑豆、绿豆、淡豆豉、银花、连翘、薄荷、牛蒡子、桑叶、贝母、苇根）。
2.外受表邪，肺胃郁热，咽痛较剧（如急性扁桃腺炎等），用上方枳实三豆银翘散加桔梗、甘草。
3.大头瘟，风温犯肺，三阳经郁热，致颜面漫肿发红，头痛寒热，脉数，舌红。治宜清热泻火，疏风解毒。用三豆汤加味（黑豆、绿豆、红饭豆、淡豆豉、生石膏、桑叶、银花、连翘、紫草、焦楂、僵蚕、虫蜕、淡竹叶）。
4.痄腮，一般由风温病毒所致者，症见发热，一侧或两侧腮腺肿胀疼痛，拒按，舌红，脉数。治宜疏风清热。方用三豆饮加味（黑豆、绿豆、淡豆豉、银花、荆芥、连翘、夏枯花、僵蚕、板兰根）。
5.风热所致其他疾患，如荨麻疹、急性过敏性疾病、过敏性紫斑、天泡疮、漆疮、急性蜂窝组织炎等，各病表现虽然不同，但病因均多为风热，火毒阳邪外侵，肺胃郁热，病位反映均在皮肤、肌肉。肺主皮毛，胃主肌肉，故均可用枳实三豆银翘散加减治之。
（三）用于其他方面
1.小儿高热惊风，症由高热伤津，肝失濡养，热极生风所致者，用黑豆、绿豆、淡豆豉加钩藤、僵蚕、虫蜕、竹茹。
2.酒糟鼻初起，多因肺胃郁热所致，可用枳实三豆银翘散治之。
3.妇女更年期综合征，虚烦，自汗，低热，血压波动，脉弦或沉弦，证属肝肾阴虚，津液不足者，可用黑豆、绿豆、淡豆豉加山萸肉、果杞、五味子、乌梅、桔络、竹茹、冰糖。
如属胆热痰滞，烦躁，失眠者，可用栀豉温胆汤加黑豆、绿豆、桔络、菖蒲、远志。
如属肝阴虚较重者，用三豆汤与生脉散合方服用（黑豆、绿豆、红饭豆、太子参、麦冬、淮枣皮、乌梅、冰糖）。
4.小儿遗尿，属肝旺脾虚者，用黑豆、绿豆、扁豆、淮山药、莲子、乌梅、冰糖。
5.小儿腹泻后，脾弱肝旺，饮食不为肌肤，形体消瘦，性怪喜哭，证属肝脾失调，治宜调和肝脾，用黑豆、绿豆、扁豆、桑叶、乌梅、冰糖、竹茹、灯心治之。
6.多发性疖疮，属风火湿热者，治宜清热解毒，祛风利湿，用黑豆、绿豆、红饭豆、桑叶、荆芥、银花、连翘、僵蚕、牛蒡子、蝉蜕、甘草。
7.预防流感，可用黑豆、绿豆、淡豆豉、桑叶、乌梅、银花、连翘、冰糖。
8.预防麻疹，可用黑豆、绿豆、红饭豆、紫草、银花、甘草。
9.食物过敏，周身发痒，奇痒难耐者，用枳实三豆银翘散治之。
1O.药物过敏，或药物中毒，用黑豆、绿豆、红饭豆、防风、甘草治之。
三豆汤及其加减方的临床运用，范围甚广。总之，大凡急性、热性，津液亏损等疾患。均可在三豆汤的基础上加减使用。