自序
　　属性：天地之道，生一气而判清浊，而清者轻而上升为天，浊者重而下降为地。天为阳，地为阴，乃为二仪。
　　阴阳之气，各分三品，多寡不同，故有三阴三阳之六气。然天非纯阳，而亦有三阴，地非纯
　　阴，而亦有三阳，故天地各有三阴三阳，总之以十二矣。
　　然天之阴阳者，寒暑燥湿风火也，地之阴阳者，木火土金水火也。金火不同其运，是故五行
　　彰矣。然天地气运，升降不以，阴阳相感，化生万物矣。其在天则气结成象，以为日月星辰也，在地则气化为形，以生人为万物也。
　　然人为万物之灵也，非天垂象，而莫能测矣。其我机理，归自然也，其非圣意，而宣悟玄玄
　　之理。故有祖圣伏牺占天望气，及视龙马灵龟，察其形象，而密解玄机，无不符其天理。乃以始为文本画卦，造六甲历纪命曰《太始天元册文》，垂示之于后人也。以诮神农，昭明其道，乃始令人食谷，以尝百药，而制《本草》矣。然后黄帝命其岐伯及鬼臾区，以发明太古灵文，宣陈造化之理，论其疾苦，以着《内经》焉。
　　凡此三皇三经，命曰三坟，通为教之本始，为万法宗源，诚为天之候也。若论愈病疾，济苦
　　保命防危，非斯圣典，则安得致之矣。然经之所论，玄机奥妙，旨趣幽深，习者卒无所悟，而悟得其意者鲜矣。完素愚诚，辄考圣经，撮其枢要，积而岁久，集就斯文，以分三卷，叙为九篇，勒成一部，乃号《内经运气要旨论》尔。乃以设图彰奥，绮贯纪倜，袭句注辞，而敷其言意。或可类推者，以例傍通，例成而陈精粹之文。诂训难明者，兼义释字音，以附之于后。虽言词鄙陋，所乘从俗，而庶览者曷为悟古圣之妙道矣。
　　河间刘守真谨序
　　序
　　属性：夫三皇设教，上帝垂慈，悯群生有困笃之疾，救黎庶有夭殇之厄。遂设运气，说太始之册文，开荥医鉴，彰太素之妙门。先圣既遗轨范，《素问》、《灵枢》二经，共为一十八卷，其理奥妙，披会难明。今有刘守真先生者，曾遇陈先生，服仙酒醉，觉得悟《素问》玄机，如越人遇长桑君，饮上池水，隔腹观病之说也。然先生谈《原病式》一卷，《宣明论》五卷，《要旨论》三卷。其《原病式》者，明病机之本，说六气病源。《宣明论》者，精要医方，五运六气用药，古往及今，渊奥妙旨，莫越于此也。《要旨论》者，《素问》隐微，天地大纪，人身通应，变化殊途，其理简易，其趣深幽，惟此经释，为龟镜者也。然九篇三卷者，犹后之学人，尚难明矣。宗素自幼习医术，酷好《素问》、《内经》、《玉册》灵文。以师事先生门下，粗得其意趣，释《要旨》语九篇，分作八卷，入式运气，载设图轮，开明五运六气，主客胜复，太过不及，淫邪反正。重释《天元玉册》、金匮灵文、《素问》、《灵枢》，撮其隐奥运气之旨也。主药当其岁，味当其气，性用燥净，力化浅深，四时主用，制胜扶弱，客主须安。一气失所，余遁更作，脏腑淫并，危败消亡。君臣佐使，明病标本，安危盛衰。若不知年之所加，气之盛衰，不可以为功矣。□若不推其《素问》，晓达玄机，天地有运气之升沉，人身有气血之流转，周天度数，营卫循环，通应人身，昼夜不息。
　　《素问》者，五太之名也。太者，大之极也。素者，形质洁白，非华绮之问也。《素问》
　　者，问答形质之始也，形质具而瘵由是明生。然启玄子诠注，朱书其文，间其理隐奥，习之者滥觞其说，遗而不解者，实其多矣。今将太古灵文，乃《素问》之关钥也，究其源流，发明解惑耳。后之学人，识天地之大纪，变化之殊邈。
　　妙哉《素问》，视如深渊，如迎浮云，莫穷其涯际，玄通隐奥，不可测量。若非刘氏，孰可
　　发明，用释玄机，敬资昭告。
　　平阳洪洞马宗素谨序
　　彰释玄机篇第一（新添）
　　属性：六元之数者，乃天真之一气也。言一气之用者，得之为神，失之则丧真，故知一气为天地万物神应之母也。是故玄一真人，传庚桑楚六衍之法也。
　　一衍之道，穷通混玄变化之真源也。二衍之神，晓了造化神明之法用也。三衍之气，明辨升降动静之精微也。四衍之天，知天道营运万象也，以政刚健之德也。五衍之地，知地之化生万物也，以政柔顺之德也。六衍之万物，衍万物者，可以明神气之变动，可以晓天地之逆从，然后可以知万物盛衰、吉凶征兆者哉。言万物者，天地上下，谓升降之中，神气不感，天地不交，道无体于万物，万物失诚于道。此者是六爻不通，三才不期，故有吉凶。故吉凶征兆之事，彰盛衰灾祥之化应也。是故天地上下，成临阴阳，左右成间，五运所加，六气所临，迁移有位，应期变化，无方布政。五运所加，其干六气，所临其支，支干相推，一岁之纪乃应。迁移有位，而分早晚之期，变化无方，以别盛衰之政。故圣人德以天地为心神，以阴阳为用，德与心政，神与用明，其道为万物化诚也。
　　五行生成数（旧经）
　　属性：昔天候灵龟，出于洛水，以负五行生成之数，于伏牺氏则其始也。或云此治画乃始于禹者，误也。然五气经彰，亦五行配合之道，因纪之，始出自《太始天元册文》。又，龙马出于洪河，以负九宫，数因而作，命曰《河图》尔。又，
　　灵龟出于洛水，以负五行生成之数，因而遂书，命曰《洛书》尔。皆因伏牺为真始也。后因圣帝命天师推究太古灵文，乃着《内经》，而已言其五行生成之数也。（新添）又，按《太古天元玉册》灵文曰∶“是故五行得位，水火木金土也，正于五方，表混沌之初分，上下清浊以定，乃成天地也。”二神，因万物之始生，分阴阳而立左右，辨清浊而分前后，故五行得位而变形，日月营运而化星。直中气之变，太虚澄净，黑气浮空，势乱如麻，遐尔一色，玄凝分扰，雨昏翳，寒资阴化，水始生也。寒湿交而生辰星，乃至阴之精感而化也，故水得其一数，故众水皆一体也。乃阴极而阳化也。寒极而热生，乃物极而反也。太虚昏翳，宛若轻尘，色散如丹，乍盈乍缩，炎光郁燠，燔灼销融，热资阳化，火始生也。寒热交而生煌阳光盛而生荧HT。又云水旺而生荧、煌，以火而少赤，不行火令，至阳精之化也。故得其火之二数者，应水中之火，石中之火也。景霁山昏，苍埃四合，山川如堵，鼓坼太虚，天地远，气散焉，口风阳化阴长，木始生也。燥风交而生岁星，阴阳和而水资，草木敷荣。故木得三数也，乃树木、竹木、草木也。气交之极，阳气复降，阴气复升，劲风爽气，远近烟浮，白如絮，遐迩皎洁，势郁声迅，木偃云腾，山川坚定，肃气凄清，燥热相交，而全始生也。阳气升，阴气降，水就润而生木，阴气升而阳气降，火就燥而生金，故知木为阳中之阴化，金为阴中之阳化。故金得四数，乃金银铜铁之类。言五者，铅草不禁于火也。燥气盛而生火，白云腾而雨降，泉出地中，湿热相搏，五伏之下，土始生也。四方备而生镇星，此火之子也。在五伏之下，而有五色之土者，清阳为天，浊阴为地，此乃坤正土，非火之子也，故阴土二而阳亦二也。四方备而阴精之内□感阳光而生五土，上感气而镇星也。故水一、火二、木三、金四、土五，轮其次也。其坤元之土，掌于四方，乃得之为成数也。水木金火，谓得土而成立。物过而出土之上，故有成数也。水一数，加土五成六，火二数，加土五成七，木三数，加土五成八，金四数，加土五成九，土备五方，无成数，亦得五也。是故天地五行生成之数者，四十五也，是故脉取四十五，为平脉也。凡人气血长短息数，皆生于四十五也。图载于后。五行∶金、木、水、火、土。十干∶甲、乙、丙、丁、戊、己、庚、辛、壬、癸。十二支∶子、丑、寅、卯、辰、巳、午、未、申、酉、戌、亥。