十四年，都御史邓璋奏：“土鲁蕃六次悔罪，请和入贡，合当随宜抚处。”兵部尚书王琼议称：“若终拒绝，不许来贡，恐非抚驭外夷之道。请将在京番使马黑麻等及哈密年例进贡夷使分为几运，伴送甘州，连存留在彼同起贡夷打发出关。见监夷人朵撒恰等俱准放回。”会题留中不出。后兵部伍疏：“甘肃去京往回万里，事久不决，必生他虞。徵调官军骚动边境，实非细故，早赐宸断。”上不答。邓璋见夷使久候，恐又生变。议差通事虎得山同夷人马黑麻赍谕番酋，以取抢去人畜为名，实欲慰安其心。正德十五年正月，本酋送还原抢镇抚程翥等五十九人，并遣使带马驼复来进贡。十六年五月，兵部再议得：“土鲁蕃酋听信奸夷虎仙等诳诱入寇，镇巡等官因将差来亲信头目朵撒恰等羁留不遣。节次卑辞祈请，近奉明旨放回，已足慰其想望。若遂许其通贡，恐彼悔悟未深，和好难久。”诏是之。通行阻回。
嘉靖元年二月，番酋又遣夷使将方物庆贺进贡。镇守衙门奏，行兵部。议得：“本酋祈请颇切，若复不纳，恐失制驭蛮夷来则不拒去则不追之道。”诏土鲁蕃并撒马儿罕等处差来夷使，着分定起数，陆续选委老成的当官员伴送来京。嘉靖二年，虎仙复论斩罪（死狱中）。王琼谪戊。彭泽以兵部尚书致仕。李昆起为兵部侍郎。陈九畴亦以荐起用，复为甘肃巡抚都御史。
时土鲁蕃复谋入寇，九畴得报。上疏曰：“照得总兵官武振病故，臣会同镇守太监董文忠议得前项走回夷人供报，番酋调集人马，要行夺取甘肃地方等情。虽系传闻之言，然据理原情，似为不虚。何则番酋听信往来进贡奸回之言，备知中国地方虚实强弱之情。恃彼雄长西域，前驱列国之势，其立马天山投鞭断河之意，盖勃郁于胸中久矣。往年，犯边所以未逞其志狼狈而归者，盖以来非其时。卧雪啮冰之贼，不能胜屋居火食之主，势使然也。今乃当吾趋麦堆场、糜谷栖亩、农人野处之际，卒忽而来，是将因粮于我坐困我边也。防范机宜曷可须臾少缓。乞敕兵部仍再速行陕西、延宁三处镇巡官，将各边游兵人马作急催促前来本边，听臣等分布，并力扞御。再敕户部议发内帑银十万余两，委官押运前来，籴买粮料草束，供助军饷。”后失拜烟答子米儿马黑麻皆论死。
三年，土鲁蕃酋大举入寇甘州。上命陕西、延宁镇巡官并庄浪副总兵鲁经各选调游骑官军，推委谋勇官员统领，前往肃州，听都御史陈九畴节制，相机战守。还差太监一员到彼监督军务。堪以总制大臣及提督总兵官上紧会官推举来看，户部只差能干郎中一员，量带银两，督理军饷，兵部尚书金献民推举兵部尚书致仕彭泽，总督漕运都御史李钺俱各历练老成，充总制官。署都督佥事杭雄、都督同知马永俱各久任边方，充总兵官。再照肃州孤悬绝域，贼势重大，比与寻常声息不同；各镇调集官军素无统属，若不假以事权，急难责其成效。合无查照各年旧例，镇巡以下官悉听节制。临阵之时，都指挥以下有不用命观望退缩，听以军法从事。各官合用符验关防旗牌书椽，若待本官奏请未免迟误，合行吏、礼、工三部照数拨给本官，庶便行事。上即命金献民兼都御史总制军务，杭雄着挂印充总兵官，提督军务，限三日内起程。命御用监太监张忠监督军务，并带犒劳银两及银牌、彩段、通事、天文生、医士同往，及赏参随人等官海员掌印银五两、布二疋，其余每人银三两、布二疋。
户部主事胡宗明差往督饷，奏称：“昨奉明旨，银两动支一十四万两，带运陕西布政司交割。及查先次支剩军饷银六万余两，押运军前应用，限三日内起程。切念夷虏之情叵测，而兵食之势相须，访得回夷围城，志在侵夺地方，比之往常肆掠大有不同。况近年各处地方灾伤，钱粮缺乏，虽主兵月粮每每拖欠。今又加以客兵数多，若非别为议处，彼中岂能支持古人云：“日费千金而后十万之师可举”，则今日领银一十四万两能给若干人勾用若干日，可以口计而指屈也。其布政司虽称有银六万余两，延今日久，恐别有支费。职备员本部司属，岂不知库藏空虚，用宜节缩。但今日事势甚大且急，万一至彼而饷乏，虽欲临期奏请，必至累月经旬，公私皆匮，战守两难，计出无从责将焉逭乞为再发银十万余两，一同领运前去。如夷势远遁，亦可作以后年例之数。再照前项银两系干钱粮，出纳必须逐一称对，装验明白，方免疏虞。仍乞稍宽限期数日，银两秤完即便前进，庶钱粮无虞，而缓急亦有备矣。”上从之。诏再给六万，听装鞘完备起程。