且巡抚驻扎台湾祗有半年，除去白犬、澎湖、安平等口守风，合来往程途计之，已在一月；除南、北路巡查往返程途，又须一月有余；又除台湾〔府〕文武试、台北府文武试合计，约须二月有余；而台南赴台北考试往返程途又须二十余日，若遇大甲诸溪水涨，则又难以日计。是巡抚舍通省应办之事而不办；仅来台湾代巡道办一试事；因大失小，殊不合算‘等语，自系实在情形。且该抚从前会经奏明台事俟办有成效，徐议督、抚分驻之局；李鸿章覆奏摺内亦有办有成效，再议督、抚轮住之局。现时台地应办各事渐已次第举办，该抚所称遵照旧章轮赴台湾巡查一节，应如所请办理。惟督、抚有统辖全省之权、整顿吏治之责，于一切筹防、筹饷诸务呼应较灵；应责成督、抚轮赴分驻，以一事权而资得力。如台湾遇紧要事件，自应立时驰往；即遇无事之际，亦不必拘定隔年一次，并毋庸限以每年冬春驻台、夏秋驻省之期。应令随时斟酌情形，轮流前往；不得临时互相推诿，亦不得日久视为具文。丁日昌所称将军、提督轮赴台湾之处，应请毋庸置议。
至台湾各海口防务及中外交涉事件，向由福州将军、闽浙总督、福建巡抚会同办理；臣等前于“议覆巡抚移扎台湾”摺内奏请均归巡抚管理，奉旨允行在案。现如督、抚轮住台湾，应仍由将军、督、抚会办。至总督节制台湾之权与整顿省、台吏治，吏部查：’总督、巡抚均有统辖全省之权，今经总理各国事务衙门议准巡抚毋庸限以每年冬春驻台、夏秋驻省，应令随时斟酌情形轮流前往，不得随时互相推诿‘等语；所有整顿省、台吏治，总督、巡抚均应仍照旧例办理。至台湾府、台北府文武各试，礼部查：’台湾学政事宜，向归台湾〔道〕兼管；雍正五年，改归巡台御史。乾隆十七年，复改归台湾道；其达部事件，仍呈福建学政转咨。嗣于光绪元年，据办理台湾等处海防事务大臣沈葆桢奏：“福建巡抚移驻台湾，请将台属考试统归抚主政，咨达事件亦迳由巡抚办理”；经臣部议准在案。今该前抚奏请遵照旧章隔年轮赴台湾巡查，既经总理各国事务衙门议令督、抚轮流赴台，并不拘定年限；则轮应岁、科考试之时，未必适值巡抚渡台之日。所有台湾文场考试，自应改照旧章仍归台湾道办理；其达部事件，并照旧呈由福建学政转咨，以专责成而符体制‘。兵部查：’文武事同一律，所有台湾文场考试既经礼部议令改照旧章，其武场考试亦应仍归台湾道办理；其咨部事件，并由该道呈送福建学政辖咨以符旧制。再，闽浙总督、福建巡抚现既随时轮流赴台，所有前经改设台地武职营制暨移改抚标游击等官有无另行酌改之处，应由该督、抚体察情形；奏明办理‘。其余台湾现办各事及一切未尽事宜，仍应由该将军、督、抚等体察情形，擘画尽善；并请饬下南、北洋大臣等统筹全局妥议具奏，候旨施行。
所有臣等会议缘由，谨缮摺具陈，伏乞皇太后、皇上圣鉴。再，此摺系总理各国事务衙门主稿，会同吏、礼、兵等部办理；合并声明。谨奏请旨。
光绪四年六月初十日，军机大臣奉旨：’依议。钦此‘。
光绪五年
军机大臣寄两江总督等上谕（三月二十八日）
总理各国事务衙门奏日本梗阻琉球入贡情形摺（闰三月初五日）
总理各国事务衙门奏美统领调处琉球事摺（七月二十一日）
总理各国事务衙门奏美统领格兰忒在日本商办琉球事情摺（八月初五日）
军机大臣寄两江总督等上谕（三月二十八日）
军机大臣密寄两江总督沈、署两江总督江苏巡抚吴：
光绪五年三月二十八日，奉上谕：’沈葆桢奏：接出使日本大臣来信，该国废琉球为县等语。琉球外属中国，日本竟敢阻其入贡，夷为郡县，狡焉思启；情殊叵测！亟应妥为备豫，力图自强，以固藩篱。着沈葆桢、吴元柄将南洋防守事宜悉心区画，实力筹办；固不可稍涉张皇，亦不得稍存大意。并着随时探明该国情形，密速具奏。将此由五百里各密谕知之。钦此‘。遵旨寄信前来。
总理各国事务衙门奏日本梗阻琉球入贡情形摺（闰三月初五日）
臣奕等跪奏：为接据出使日本大臣电报现在日本梗阻琉球入贡情形恭摺密陈，仰祈圣鉴事。
窃臣衙门前于上月十九日将出使日本大臣何如璋等叠次与日本办诘阻梗琉球入贡一案大概情形，密摺具奏；奉旨：’依议‘，钦此。当即密咨该大臣并南、北洋大臣遵照在案。嗣于上月二十七日据何如璋等电报内开：’东松田至球，举动未详；十三日，大政官示：废球为县。此事如何因应？请示遵！余俟缄呈‘等语。臣等查何如璋等前屡函述日本派其内务大丞松田往球，欲废藩为郡县，何如璋见其内务卿，据称必无他事。又见其外务卿阻之，据称既经派出，非所能阻；两国议妥，即可撤回。何如璋等告以事无可商，即将告归。又开派出驻华使臣户玑，此案结局必在中国等因。其时虽有废球之说，尚未有废球明文；今据何如璋电报，是派往琉球之人既去，而其国又以废球之事公然宣示，其不顾情理，殊属已甚！何如璋见此情形，恐以事无可商，祗可回华。所称如何因应者，欲取决臣衙门以定行止也。臣等再四揣度：琉球与日本逼处，国小而弱，日本久已觊觎；其所以历久图存者，末尝不赖中国维持之力。现在中国局势未能长驾远驭，日本岂不知之；乃废球一事，一面宣示国中、一面仍派使臣来华，是其国亦尚有顾忌中国之意。从前台湾一案，日本兵驻番社，即遗使臣大久保利通来京辩论。此次举动，大略相同；或者如台案故智办理，亦未可知。