深者邪舍三阴，不能随卫气并出，或间日间二三日而作。病深者作愈迟。以疟邪有在经在腑在脏之别也。《己任编》云∶脏腑相接处，有虚界之募原。而虚界中，复有刚柔筋脉。其为某脏腑之筋，即为某脏腑之病，究之脏腑疟病，皆募原伏邪之气所迁移，间日间二三日，募原有远近耳。故邪传阳分，则作日早，邪陷阴分，则作日晏。经曰∶邪客风府，循膂而下，与卫气一日夜会于风府，日下一节，故其作晏，其出风府，日下一节，二十五日下至、骨。二十六日，入于脊内，注于伏膂，其气上行，九日出缺盆，其气日高，故作日乃益早。风府在项后，入发际一寸，项骨三节，脊骨二十一节，其二十四节下为尾、骨。邪自风府日下一节故发晚，二十五日至骨，二十六日邪复自后而前，入脊内注伏膂，循脊上行，无关节之阻，故九日出缺盆，其气日高，自阴就阳，邪日退，故作渐早。治者须从阴分提出阳分，作日早则易瘳。无汗欲使有汗，散邪为主而兼补。汗多欲令汗少，养正为主而兼散，尤必分经以论治。足太阳疟，腰痛头重，寒从背起，先寒后热，热止汗出，难已。
羌活黄芩汤加减。足少阳疟，身体解、，见人心惕然，热多，汗出甚，小柴胡汤加减。足阳明疟，头痛渴饮，洒淅寒甚，久乃热，热去汗出，竹叶石膏汤加减。足太阴疟，不嗜食，寒多善呕，热甚则渴，桂枝汤加减，参入建中汤。足少阴疟，腰痛脊强，口渴呕吐，寒从下起，热多寒少，病难已。桂枝人参白虎汤，后加鳖甲、牛膝。足厥阴疟，腰痛少腹满，小便不利，数便，先用三黄石膏汤，后用鳖甲牛膝汤加减。此论六经疟也。若邪深伏，则为五脏疟。如肺疟令人心寒，寒甚热，善惊。桂枝加芍药汤。心疟令人烦心。欲得清水，反寒多，不甚热。桂枝黄芩汤。肝疟令人色苍，面色青，太息，状若死。四逆汤。脾疟令人寒，腹中痛，热则肠鸣，鸣已汗出。小建中汤，橘皮散。肾疟令人洒洒然，腰脊痛，大便难、手足寒。归芍桂枝汤。其在腑则胃疟，令人善饥而不能食，食而支满腹大。二陈汤加枳壳、草果。既辨六经脏腑，更审六淫所伤轻重。如风疟脉浮大，春夏为多。感风而得，恶风自汗头痛，风为阳邪，故先热后寒。宜紫苏、川芎、白芷、姜皮等。寒疟脉紧盛，秋冬为多。乘凉浴水，感寒而成，恶寒无汗，寒为阴邪，故先寒后热。宜桂枝、生姜、浓朴、草果等。暑疟脉虚受暑，热炽烦冤，邪伤上焦肺气，发必寒轻热重，唇燥舌绛，渴喜冷冻饮料。盛暑发者，白虎汤，虚加人参、麦冬。秋凉伏暑发者，杏仁、贝母、花粉、黄芩、半夏、知母、青蒿等。湿疟脉濡缓，面浮身痛，脘闷不饥，呕恶，邪阻中焦脾络，发必寒重肢冷，舌白苔腻，喜热饮，大便不爽，忽秘忽溏，为湿结气痹。宜半夏、浓朴、白蔻、草果、薏苡、滑石、茯苓、通草。或胃苓汤去桂、草。其湿热交蒸阻气，泄热渗湿，审其重轻，切忌柴葛劫津。宜杏、朴、芩、夏、橘红、生姜、竹茹、麦冬、栝蒌、枳壳。瘅疟但热不寒，由阴气先伤，阳气独发，壮热少气烦冤，手足热，欲呕，邪内藏于心，外舍肌肉，令人消烁肌肉。宜甘寒生津。生地、麦冬、知母、竹叶、丹皮、杏仁、贝母、花粉、梨汁、蔗浆。盛暑发者，白虎汤。温疟脉如平人，但热不寒，骨节烦疼，时呕。《金匮》用桂枝白虎汤。
若温邪兼湿，宜半夏、杏仁、蔻仁、滑石，俱忌柴葛升举。牝疟多寒，《金匮》用蜀漆散。宜酌用二陈汤加姜、桂枝。牝疟邪伏于肾经气分。寒疟邪伏于胆经营分。若但寒不热，柴胡姜桂汤。
痰疟素脾虚多痰，疟热又能蒸痰，胸闷欲呕。热痰君贝母，佐以竹茹、橘红、栝蒌霜、茯苓皮。寒痰君白术，佐以半夏、陈皮、姜汁、苏子。食疟饮食生冷不节，致寒热较重，饥不思食，满闷腹疼。养胃汤减参术。瘴疟岭南气炎，感受山岚涧溪之毒，乍寒乍热，迷闷发狂，须祛瘴涤痰。平胃散加减。疫疟因染时邪，寒热成疟，其症沿门合境。达原饮、五瘟丹、不换金正气散。鬼疟夜发，为邪入血分，宜升散营中之邪。内补建中汤加升、柴、生首乌。脾虚者，补中益气汤。劳疟病久延虚，、羸气怯，因劳辄发，寒热模糊，最难调治。补中益气汤加牛膝、鳖甲、制首乌。疟母久病失调，邪入肝经，挟瘀血痰涎，胁下结块，宜疏通血络。用鳖甲、桃仁、蓬术、牡蛎，加金铃子、归须、延胡、桂枝、甲片，或鳖甲煎丸。虚人疟母，宜补剂兼疏散药。疟疾变痢，因暑湿迫注，失于解散，由经入腑，宜表里分消。用柴胡、半夏、黄芩、枳壳、陈皮、红曲、滑石、茯苓、炙甘草。连进大剂，以痢愈为度，疟亦止，此治诸疟之大概也。此外又有似疟非疟，同一恶寒发热，或寒热往来，最宜详辨脉症虚实，勿以阴阳内损之初症，误认疟邪，轻用表散。如小柴胡汤、祛疟饮之类。若脉症皆虚，即宜黄、建中汤、补中益气汤，升、柴少用。血虚发热者，逍遥散。盖阳虚则恶寒，阴虚则发热。凡伤寒后，及大病后、产后劳怯等症，俱有寒热往来，或一日一二发，俱宜作虚治。以疟之寒热有定时，杂症之寒热无定时为辨。论中治法有未备者，参观后论。
疟症论治
疟疾脉候
疟脉自弦，弦数多热，弦迟多寒，弦而浮大可吐，弦短伤食，弦滑多痰。微则为虚，代散者死，迟缓者愈。
《入门》曰∶卫虚则先寒，营虚则先热。表邪多则寒多，里邪多则热多，表里相半，则寒热相等。