五面怪率领着追随他的古怪佬们从双色星逃出后，已经在宇宙中航行很久了。他们渴望找到一颗可以落脚的星球。但匆忙的逃离让他们根本没有预定的方向，他们只能在无限的空间中乱撞。带出来的能量块慢慢地被消耗着，此时，就快要枯竭了。
突然，飞船中的自动搜索指示器亮了起来。一个五面怪赶忙打开了监视器，上面映出了一颗蓝色的金属星球。五面怪在控制台上快速地敲了一阵，他的脸上露出了一抹笑容。
飞船慢慢地降落在这颗陌生的行星上，五面怪们慢慢地走下了舷梯，让自己的能量柱落在了星球的金属地面上。他们环望四周，发现到处都是金属，能量柱传来的数据表明，这金属与他们的衣服材质极其接近。
“赛博坦（Cybertron）！”五面怪们为他们的新家园起了名字。
这里，没有把他们看做怪物的古怪佬；这里，没有需要他们征服的现存文明；这里，只有一片荒凉。五面怪们深深地认识到他们必须脚踏实地地从一无所有开始建设这个世界。
他们凭借着自己的超级智慧，很快在赛博坦上建设起了一座小城市。他们制造了很多机器人，那种双腿双臂的人形机器人。有了基本的生活保障，五面怪们重新恢复了残暴不仁的本性，他们把机器人们当作自己的奴隶，肆意地驱使着他们去采矿，去建设，去探索……他们甚至让这些机器人进行角斗、自相残杀，并以此来取乐。
A3是一个负责探索的机器人，他已经离开城市很远了。他原本是一个结实的建筑机器人，但在一次角斗中，他伤到了自己的双臂，从此便被用作探索机器人，专门被送去探索那些充满危险的边远地带。
此时，A3刚刚完成他的此次探索，正要将所有沿途录制的内容带回城去。突然，他接受到了一条陌生的指令，指令上没有五面怪的特征码。这种指令本应被当作外来干扰，直接丢弃，但A3却感觉这指令拥有一种难以抗拒的神圣力量，它在自己的处理队列中持有最高的优先级。
A3犹豫了片刻，决定试着执行一下。指令在他的头脑中幻化为一个声音——“A3，我的孩子……”
这声音震荡着A3的机件，让他感到自己的内心得到了升华，他不知道是谁在对他说话，但他能感觉到那是一个对他来说很重要的人。他继续听了下去——
“快来！来到我的面前……”
去哪里？A3带着疑惑继续执行指令，他得到了一个坐标。那不是一个他熟悉的位置，那里是尚未被探索过的领域。A3感到矛盾，他不知道是应该依照五面怪的设计，直接无视这条奇怪的指令，还是应该去坐标指示的地方看一眼。
又一条指令跳入了他的处理队列，仍然是最高优先级。A3再次试着执行了一下，同样的声音、同样的坐标，是同一条指令的重复。
“A3，我的孩子……”A3反复地听着那让他感到舒畅无比的声音，这声音太具有诱惑力了，它让A3无法抗拒。在不知不觉间，A3已经开始向指令中的坐标进发。
A3到达了目的地，他猛然发现自己正处于赛博坦的地底深处，四面一片漆黑。
“A3，我的孩子……”那个声音又响了起来，就在附近，“你终于来了，可怜的孩子……”
A3循声望去，他看到前面有一点微弱的闪光，他慢慢地向光亮走去。
“A3，我是元始天尊！”伴随着这句话，四周亮了起来，A3这才看清自己的所在——一座富丽堂皇的殿堂。
“A3，我可怜的孩子。你拥有我高贵的血统，却要为五面怪这残暴的生物所欺。”A3这才意识到，说话的是殿堂前面的一张巨大面孔，一张带有神圣气质的面孔。
“元始天尊？血统？”A3轻轻地重复道，他不是很明白所听到的话。
“A3，你可知道，你并不是简单的机器工具。”元始天尊又接着说，“你是变形金刚！你是一个伟大种族的一员。你现在之所以甘愿受欺，是因为你还没有自己的灵魂——火种！
“我本打算在此长眠，但五面怪的到来将我从梦中惊醒。我看到了古怪佬的影子，我以为他们是至尊太君庇护的生灵。他们制造的机器人，像极了我的孩子们。我默默地为他们祝福，为他们帮我制造了你们而由衷地感谢他们。但很快，我看到了他们的真实面目——一群暴徒，他们竟然无情地压榨你们，肆意地摧残你们。我无法继续沉默，但我还很虚弱，与宇宙大帝的战斗极大地消耗了我的力量。所以，我召唤了你，我的孩子！
“现在，我要赐予你火种！我要让你拥有灵魂！”
大厅正中悬浮着的一个球体慢慢地靠近了A3。就在A3好奇地看着它时，球体突然爆发出刺眼的光芒，一道厉闪射中了A3。A3本能地闭上了眼睛，他感到自己的躯壳忽然充实了起来，生命的巨浪涌遍了全身。当他重新睁开眼睛时，目光中闪出了智慧的光芒。他突然懂得了自我，懂得了喜怒哀乐，懂得了生命的意义……
“A3，这是魔力神球（Vector Sigma）。”A3知道元始天尊指的是为自己赋予灵魂的光球，“它可以为你们带来灵魂，带来生命，带来自主的智慧！它，直接连通着火种源。
“现在，A3，我给你变形金刚的另一件宝物——领导模块。”
大厅的中央，升起了一个平台，上面摆放着领导模块。就是在这里，创天君曾经接受了领导模块。现在，A3也踏上了那个位置，虔诚地托起了变形金刚的至宝。
“回去吧！A3，带你的同伴来接受魔力神球的洗礼，让他们成为拥有灵魂的真正变形金刚！然后，从他们中选出最优秀的人，将领导模块交给他！”
“遵命。元始天尊。”A3轻轻跪倒，对着元始天尊行了个礼。
“走吧。A3，变形金刚的未来，全在你的手中了……”殿堂中的灯光渐渐地暗了下去，“我，将要继续长眠……”元始天尊的双眼轻轻地闭上了，整个殿堂又恢复了黑暗，只有魔力神球的光芒还在那里闪耀着。
A3慢慢地离开了神圣的殿堂，走进了一座大厅，魔力神球也跟了出来并停在了那里。A3明白，元始天尊不希望熙攘的人群打扰他的长眠，这里即将成为变形金刚们获得灵魂的崭新圣殿。
A3回到了赛博坦的地面，他带着拯救变形金刚种族的使命，坚定地向五面怪的城市走去……