卷十四。
夏四月初八日（甲子），广东总督卢崇峻疏报官兵屡破海寇，贼首李荣往下四府海面奔逃；严督在事各官。追捕务获。下部察叙。
二十日（丙子），广东总督卢崇峻疏报香山县知县姚启圣招抚蜑寇黄起德等四千余人。下部察叙。
二十二日（戊寅），福建总督李率泰疏报铜山抢大林等出没海滨，提督王进功、施琅标下将弁率师进剿，各有斩获。下部察叙。
五月十七日（壬寅），以故遵义侯郑鸣骏子郑缵成袭爵。
卷十五。
秋七月十三日（丁酉），正黄旗精奇尼哈番郑世袭疏言：『微巨悔罪归诚，乞赐母子完聚』。得旨：『郑芝龙罪大正法，因将伊妻收养；郑世袭知伊父之罪既经投诚，其母颜氏着给伊完聚』。
十五日（己亥），平南王尚可喜疏报；『广东饶平总兵官吴六奇，老疾不能供职』。上念吴六奇有投诚防汛功，命其子吴启丰以副将管广东饶平总兵官事。
八月十八日（辛未），兵部议叙康熙二年进取金门厦门、康熙三年攻克铜山等处捷功，命加靖南王耿继茂俸银一千两，赏海澄公黄梧大蟒、貂裘、鞍辔等物，加黄顺等二十人为左都督，施琅等六人为右都督，陈斌等十一人为都督同知，黄英等十一人为都督佥事；总兵杨富以进援中伤、落水复出，授拜他喇布勒哈番，准袭二次；各将士加等授职有差。
兵部题：『精奇尼哈番苏明呈请外补，请旨定夺』。得旨：『苏明先以投诚之功，给与精奇尼哈番，又授为散秩大臣，宠眷已极；且凡内用之人以外用者，皆系特颁谕旨简用，未有自行奏请之例。今求外用，向部中递呈，殊为不合！着议处具奏』。
九月初六月（己丑），福建总督李率泰疏报水师右路总兵官杜永和连破海寇，擒斩伪将乌角车等。下部知之。
卷十六。
冬十月二十八日（庚辰），浙江总督赵廷臣疏报郑逆下伪左都督李英自澎湖率众投诚。下部议叙。
十一月二十日（壬寅），授郑逆下投诚伪左都督朱英为左都督，伪都督佥事翁贵、金兴、黄荣、刘进、伪总兵陈绮、朱忠、张朝紘并都督佥事，伪副将吴宏、刘雄、伪参将朱显龙、伪游击刘扬等如其原衔；并给全俸，赏赉有差。
十二月初九日（庚申），兵部议授海逆张煌言下投诚伪左都督阮美、周家政以副将职衔；得旨：『阮美、周家政率众倡先劾顺着以总兵官用』。
二十八日（己卯），兵部议覆广东镇海将军王国光奏报「郑逆贼夥向泊铜山、炫钟等处，复驾船七十余只冲入甲子所港口挽泊」一疏，得旨：『设立水师提督总兵官等，原为防御海寇。今福建铜山、炫钟等处贼船挽泊，提镇官等并未带领官兵扑剿；至贼船飘往广东，并未跟踪追杀，又不预檄广东各官在前截杀。後贼船直冲入甲子所港口挽泊，广东水师各官亦未迎截。如此，则设立水师提督何用？以後贼船再至，提镇官如不亲领兵扑灭，贼遁不跟踪追剿及不预檄附近省分截杀，仍沿旧习，若罔闻知，定行治罪』。
卷十七。
康熙五年
康熙五年（一六六六、丙午）春正月二十六（丁未），福建总督李率泰遗疏言：『闽海余氛远窜台湾，奉旨撤兵，与兵休息，洵为至计。惟是将众兵繁，若撤之太骤，不无惊惶；太迟，又恐贻患。目下当安反侧之心，日久务防难制之势。红毛夹板船虽已回国，然而往来频仍，异时恐生衅端。闽省兵马钱粮专望协饷，倘若外解不周，即有意外之虞。至数年以来，海禁甚严，迁移之民尽失故业；宜略宽界限，俾获耕渔，稍苏残喘』。得旨：『李率泰原以才能，蒙世祖章皇帝特简浙闽总督。自任总督以来，克副简任之意：殚力报劾，剿抚贼寇，多建功绩。且忠清素着，正资调度料理；今以久任岩疆，积劳病殒，深可悯恻！应得恤典，着察例具奏。余着该部议奏』。
二十八日（丁酉），以原任江西总督张朝璘为福建总督。
二月二十五日（丙丁），改授海上投诚左都督郑世袭为精奇尼哈番、游击傅鼎为阿达哈哈番，并给全俸。
二十九日（庚辰），以平广东碣石卫逆贼苏利功，增给平南王尚可喜俸银一千两。