诸军驻高邮，奉阁部令箭云：左兵顺流而下，邳宿道即督一应军器、钱粮至浦口会剿。午刻奉令箭云：北兵南面，诸军不必赴泗，速回扬州听调。晡后，复奉令箭云：盱眙告急，邳宿道可督诸军至天长接应。棐臣谓诸将曰：阁部方寸乱矣。岂有千里之程，朝许之饷而一日三调者乎！惊急频仍，扬城必有内变。吾等第当坚守，相机而进。诸军唯唯否否，计无所出，偶语而散。
十一日，公至天长，檄召诸将救援盯眙；单骑当先，不避风雨。忽报盱眙已降，泗州降将侯方严全军败没，浮桥亦陷。公一日一夜，冒雨拖泥奔至扬州，尚未得食；城中哄传许定国领大兵至，欲尽歼高氏以绝冤对。且云：出自公口。十四日五鼓，高兵斩关夺门而出，悉奔泰州；牲畜舟楫，为之一空。
十五日，移泗诸军尚屯高邮，黄日芳檄防河兵至，适见北来艅艎挂帆江上，蜂拥而来。问之，则刘鹤洲、田百源之勤王师也。棐臣以刘有前隙，遂移屯高邮湖。
是日，有北使至高邮，自称前庚辰进士陈某，云湖广人、又云江西人；僚属无识其面者。捧三函，内一函封题如前；一函题曰某王令旨，仰总河都御史等开拆；一函题曰某王令旨，巡抚淮安都御史某开拆。职方郎中黄日芳等叹之，辨论种种。使者以三罪罪我曰：尔君藁葬城隅，汝辈听其凌夷草士，竟不发丧，一罪也。吾国为汝国报仇，汝辈擅立福藩世子，二罪也。吾国为汝君发丧归葬，为汝国歼除劲敌，罔知报谢，亦无一介行李往来，三罪也。日芳等云：先帝变起仓卒，诸臣料理不及；重顿发丧，已差大臣左懋第等恭伸款谢。使者曰：土地、山川，皆吾国之余也；些须玉帛，何足挂齿！今奉天讨罪，以有道伐无道，何说之辞！日芳等辞以主帅不在，徐当另议。彼亦不留，驰骋北去。
十六日，北氛日极；黄日芳檄川将胡尚友、韩尚谅各领本部札营茱萸湾，以为声援。应廷吉帅诸军来会，屯瓦窖铺，以为犄角。是日，田、刘撤兵回淮安矣。
十七日，移泗诸军驻瓦窖铺，何刚率忠贯营兵来会。时方至午食，北哨陡至，射倒棐臣家丁；众大骇愕，诸君执三眼枪逐之。既退，复奔邵伯镇，遇胡、韩二将兵，斩首七级。适南风大作，诸军复退邵伯胡卢家嘴地方屯札。
十八日，城守毖严。公檄各镇援兵，无一至者；前锋镇移军天灵洲矣。午刻，公檄黄日芳驻邵伯镇，即为汛地；秦士奇副之。黄铉趱粮未回，以东省未任监军道孙芝秀署督粮道事，应廷吉副之，驻邵伯镇，转运粮储；胡、韩二将，往来护送。
十九日，公檄何刚督所部兵入城守卫；刘肇基率所部兵亦至，遂共入城。城陷日，刚以弓弦自经死。
二十日，北兵以大炮未至，屯斑竹园。骁将押住单骑劫营，夺马一疋、斩首一级而还；公赏以蟒纱一袭、白金百两。
二十一日，甘肃镇李栖凤、监军道高岐凤帅所部兵四千人至，梁以樟、应廷吉、张襻、施凤仪并礼贤馆诸生俱入城守卫。
二十二日，李、高有异志，将欲劫公以应北兵。公正色拒之曰：此吾死所也。公等何为？如欲富贵，请各自便。前北兵谴我降人，百计说公，初犹令马旗鼓往来陈说；是日，止令隔河而语。词后，有北人来，亦不容矣。李、高见公志不可夺，遂于二鼓拔营而出，并带护饷用将胡尚友、韩尚谅诸兵北去。公恐生内变，亦听之，不禁也。自此备御单弱，饷不可继，城不可守矣。
二十三日，漏下二鼓，公谓棐臣曰：移泗饷银约二十万、军器火药十万并诸粮米，俱君首尾，弃之可惜。诸将非君至，当靳不与；可夤夜出城，陆续转运，以济缓急。又云：吾自觉愦愦，以后急务便宜行之，不必关白于我。事竣日，汇报可也。棐臣曰：廷吉现守南门，若何！公曰：以施诚庵代之。于是，缒城而下。城陷日，诚庵走至钞关门，皆中流矢毙。
北兵未集时，刘肇基等请乘不备，背城一战。公曰：锐气不可轻试；且养全锋，以待其毙。不知坐失事机。及北兵从泗州运红衣炮至，一鼓而下，肇基率所部四百人巷战而死。
川兵既去，护饷无人。二十三日，游击韩飞护运粮七百石至杨子桥，遂为北兵所掠；杀死捎水数人，焚毁略尽。
二十四日，北兵试炮，飞至郡堂，弹重十斤四两；满城惶怖。知府济宁任民育吉服危坐城中；城破，死之，眷属俱投井中。同知曲从直并其子拔贡生某分守东门，皆死之。
旧城西门地形卑下，城外高阜俯瞰城下，势若建瓴。且为兴化李官祖茔，树木阴翳，由外达内，绝无阻隔；枝干回互，势少得出。诸将屡以为言，公以李氏荫木，不忍伐也；且言诸将以此地为险，吾自守之。二十四日夜，炮落雉堞二堵，二小卒缘墙而上；城上鼎沸，势遂不支。
周志畏以少年两榜，莅事江都，颇立崖岸。遂与高营将士不协，时被窘辱；百计谢事，以难其请。适江右罗伏龙至，遂以水土不服议调，而以伏龙代之。罗受事三月，羽檄交驰，周仍不去；公因勒新旧县令一同守城。城破日，周、罗死之，家口无一免者。缙绅故大司马张伯鲸、督修重城同知王缵爵、运使扬振兴与难。