贝勒虽恢复漳、泉诸邑；独海澄一县枕山依海，炮台坚牢，烟墩密布，帆船可援，因是屡攻未得下。多方诱降，而王秀奇等终不受招。忽成功以揭阳失利斩苏茂，而黄梧虽受铠甲之罚，于心终不安，乘其拨守海澄之便，于六月十一日遣心腹将赖玉（玉，平和人，投诚，官至泉州城守游击。甲寅从耿谋王进功，被提标五营所杀）密通总督李率泰，欲献海澄投诚。率泰转启贝勒，贝勒大善，檄提督马得功接应。玉回报梧，梧因说茂之族弟苏明曰：君知危乎？明曰：不知也。梧曰：本藩刻薄寡恩：百战之功，毫无厚赏；偶尔失利，悬首竿头。尔兄揭阳之败，实乃天意，今已被杀。尔能保其无事乎？明曰：如公所言，将奈何？梧曰：我已差人纳款于总督，公若不去，祸必旋至。为今之计，莫若相从投诚，方为上策也。明曰：公戏我耶？抑有实事耶？梧曰：尔不信，我免冠示尔。明见梧鬓发果剪，愕然曰：公毋乃太急乎？梧曰：提督差官昨夜到此，我已将印劄缴去，并当面剪两鬓示信。今乘王秀奇往厦之便，约今夜四鼓，马提督到便献城。迟则难于下手矣。明曰：果如是，吾当相从。但老母在厦，今若从公投诚，本藩岂肯干休？必然累及老母受刑，明诚千古罪人也！梧曰：智者达权，不可守经。公如不决，悔无及矣。明见梧左右雄壮，似欲相挟状，无奈许之。同梧回署，出其印劄，亦剪两鬓示信。乃诈为巡视城垣，勒兵以待。至五更，城外果报骑兵云集。左先锋镇后协康忠领众督御，被黄梧一刀砍落城下，遂同苏明开门迎降。提督总领旗刘进忠带领骑兵首先入城（进忠，后为潮州镇。甲寅从耿藩，丁巳投诚，磔于京师）分守四门。天曙，梧、明出见提督马得功，功厚礼相待。出令安民，而市肆不惊。飞报贝勒并总督李率泰，泰与贝勒各齎袍帽褂靴，令薙发以待。贝勒以既得海澄，则厦门可图，而收两岛无难事也。率泰亦云：海澄系成功储蓄粮饷之所，为金、厦门户。今黄梧既弃邪归正而献海澄，足孤其势。不日漳、泉会师，以合攻两岛，易易也。即将前欲封成功海澄公留下之印，会题授黄梧。命下，准授黄梧为海澄公，皂旗白钺。七月，设公标五营，驻漳州平海。梧荐施郎水务精熟，韬略兼优。若欲平海，当用此人。郎遂改名为琅。贝勒与率泰合疏保题施琅为同安副将，寻而擢为总兵。安插苏明于漳平。后以明母在海，调明入京，授精奇尼哈番内大臣。成功亦以明为梧所胁，非明本心，不杀其母，且月给以养之。
当其时，王秀奇之领兵张协，于晚间见黄梧出伏路之兵悉系贴身亲随，而且举动慌张，心甚疑之。遂乘潮落，差快哨往厦密禀王秀奇，说梧情状，患有外变，当速为备。秀奇接禀，业已三鼓，遂袖禀叩辕门，请见成功。功即遣甘煇、林胜、陈斌、陈鹏、黄安、杨祥诸镇，驾快哨飞入海澄，又令洪旭、马信、王秀奇、陈魁、张鸿德、林世用、刘国轩等驾赶缯船接应。甘煇舟师甫至海门，天色微明，见沿海人民奔窜，顿足曰：事不济矣！海澄必失。时张协等望圭屿一带航船而入，急招呼相救。煇令拢船，张协下船哭诉，请速救援五都土城。时土城内副将林明与领兵康熊闻海澄有变，坚壁守御。忽见满、汉齐至，进退维谷。忽闻甘煇来援，即开门接应。煇令林胜等分伏要道，令陈斌、陈鹏二镇列阵候敌，令林明、康熊搬运蓄储粮饷下船。既而洪旭大队亦至，议欲乘彼人心未定，进攻夺城。得功见海船如叶，又合土城余党，摇旗呐喊，似欲攻城之状；遂分遣精骑暨枪手据险堵御。旭与煇曰：土城器械、粮食既已搬尽，咫尺孤寨，守亦无益。不如乘其潮退，督兵出厦门，以图后举。煇曰：此论最当。黄梧之谋已久，非陡然献降。徒伤兵卒，无益于事。遂鸣金收军，下船回厦。得功见海船已去，亦分兵据守隘口，布伏防范。
煇等回厦见成功。功见土城粮饷搬尽，擢林明为右戎旗镇、康熊为左戎旗镇。又遣兵官张光启、兵都事黄璋下狱，以其扶同黄梧瞒借杨琦衣甲器械应点之罪；后又不能善为抚驭，反惊挟他，以致心惶叛去。
七月，成功令黄元、郭华栋二镇领本部将士下铜山，同张进协守。遂大会诸提镇参军商议曰：本藩正欲刻期北上，争衡吴越，只因海澄一失，遂尔中止。现今贝勒与总督咸提师驻漳，其省城必然空虚，不如乘南风直抵闽安，入取福州。若得福州，则漳、泉下游悉为我有。他若救应，疲于驰驱，是彼劳也。然后假一旅，从中截杀，必自乱矣。未知诸公以为何如？诸将曰：藩主神算，非诸将所能及。即以中提督甘煇为元帅，后提督万礼副之，统杜煇、陈斌、陈魁、林明、巴臣兴、林胜、蓝衍、魏其志、杨富、黄安、刘国轩、杨来嘉、郭义、蔡禄、蔡文等一十五镇，坐配大船四十只、快哨二十只，北上取闽安。煇至湄州，戴捷来迎。煇命捷为引导，进攻闽安。闽安守将见海航云集，不敢迎战而遁。煇得闽安，勒兵报捷。功以前提督黄廷率陈鹏、周全斌等守厦门，释张光启、黄璋仍掌事，洪旭同兄泰守金门，陈煇领熕船二十只泊南山边圭屿，以防海澄舟师之出。亲领王秀奇、林明、张英、萧泗、林雄、黄昭、萧拱宸等往闽安。值中权镇马信自舟山遁回，见成功，陈诉定海关出水师船五百只合攻。信与阮骏、陈六御、张鸿德等分熕与战，终日未分胜负。
是夜二更，南风大发，水师用火船纵焚。阮骏同陈六御、张鸿德咸阵亡焉。功大痛哭三将勇烈，令优恤其子。即将大队舟师入南台，夺据其桥，进围福州。分诸镇：东守乌龙江，以御泉、漳救援之师；西据洪塘水口，以截延、建上游粮米；北守连江北岭，以遏温、台接应之兵；惟南面近水不为备。拆毁东南隅一带房屋，竖栅，安置炮台，与乌楼相对。日夜攻打，轰声震天。时贝勒与总督之兵在漳州，城果空虚，兵民人等一时为之震动。仅有巡抚宜永贵在内，接闽安已破之报，正欲请兵防范，忽而楼船塞港，兵临城下；与城守副将田胜（河南人，善用标枪）督兵守御。又分一旅出守乌楼，以作犄角。但城大兵寡，乃会绅矜，按家甲，拣选民壮，日夜轮流守御。差人飞递贝勒、总督，回师救援。成功一时骤至，未知虚实，未敢临城。只调各镇安营，深沟树栅，以为久困计。每率众倚梯攻城，即被乌楼横炮击退。功集诸将议曰：乌楼乃系城中之犄角。不夺乌楼，此城难破。明日必须并力攻夺，方许收军。如退缩者，斩！是日，炮火不绝，合攻乌楼，楼悉崩坏，兵士生无二三，遂为成功所夺。
城内见乌楼已破，人心愈惶。独有巡抚旗鼓参将张国威请于宜永贵曰：威观在城诸将，只堪守城。至于田副将独自一人，焉能分身破敌。现有原任布政司周亮工与副将王进（进即王老虎）缘事在狱，宜调此二人出来计议，必有方略，庶其围可解也。贵曰：二人乃系钦犯，若纵之出，倘有他变，谁任其咎？国威曰：亮工、王进二人，忠心无二，威愿以全家四十三口保其无变。宜永贵见国威恳切，又当危急之际，即允其请，立召亮工、王进入辕门，许以立功赎罪。二人叩谢而出，致谢国威。威曰：今日之事，非市私恩。可速登城观敌，用计破之。亮工与王进忙登南楼。遥望毕，即回覆宜永贵曰：贼势方锐，未可与敌。虽乌楼被其所夺，料贼一时未敢临城。俟其稍懈，当出奇兵破之。宜永贵曰：何谓奇兵？亮工曰：遍观城外，营垒相连，难以骤破。独东南近水一角略尔疏防，可令王进带骑兵三百人、步卒一千五百人，偷过鼓山后，转出六通桥，冲杀南台，焚其船只。再令田胜领骑兵一百五十人、步兵五百人，伏南门；李武领骑兵一百五十人、步兵五百人，伏西门。遥观王进出兵，二处起伏冲杀。其余兵民守城者，悉令呐喊助威。破之必矣。遂戒严防守。
八月，贝勒知成功犯福州，与李率泰相议：一面拨梅勒章京阿格商统领骁骑救援福州，一面遣提督马得功带兵由云霄八尺门渡江袭取铜山，傚击魏救韩之法。
十六夜三更，宜永贵依亮工之计，令兵衔枚、马摘铃，开水部门而出。王进领兵从鼓山后绕转，天色微明，鸣螺喊杀。城上见王进兵出，遂发大炮，大声呐喊。西南二处，伏兵齐起。成功诸营不知兵从何处来，一时不及列阵，各慌忙奔窜，相争下船，乘潮而去。杀伤溺水，死者不计其数；旗帜器械，弃满山海。是日围解。成功出劄闽安，度势踞险，筑炮台围寨，并罗星塔亦筑土城，令诸镇轮流守御。功将大队舟师，移屯螺口江、定海凤埔。
九月初六日，马得功领兵至八尺门，排渡攻铜山。张进侦知，遣黄元、郭华栋统众来敌。得功屡挥军欲渡，悉被华栋等踞险攻击，死伤甚众。得功见其有备，遂抽师回。郭华栋报捷于成功。
十月，成功修表，遣太监刘九皋同内司镇中营副将江王振，航海从粤东龙门间道见永历，请会师恢复。擢右提督王秀奇为五军总督、中权镇马信为右提督。礼官陈宝钥（官至山东青登莱道）假托修茸船只，密载眷口，入泉州港投诚；以黄开泰为礼官（泰，戌举人。投诚，官至□□道）。原兵部侍郎王忠孝荐举同安殉难陈鼎之子陈永华有经济之才，成功用为参军。
十二月，成功督诸舟师犯罗源、宁德等县。诸将飞报贝勒，贝勒令阿格商、巴都、柯如良等率骑兵往援。