鲁王知国安杀清源，恐闽发兵问罪，遂抽师令国维西御。起礼部尚书余煌兼兵部尚书，代国维督师江上。因此江上之师单弱（余煌字武贞，浙江山阴人。天启乙丑状元。入史馆，直言忤时，以礼部尚书假归；弘光屡征不起。贝勒世子平浙时，整衣冠欲死；为义师郑咸一救之，劝其共事鲁王）。
五月，招抚经略洪承畴、黄熙胤接芝龙复书，遂启贝勒。贝勒挥南北岸军齐进，用火炮攻方国安营垒。适国安食，一炮击碎其席，并厨灶无有完者。安叹曰：此天夺吾食也！又见北岸兵势强盛，于五月二十七夜与马士英、阮大铖潜劫鲁王而南。次日，诸帅闻知，各溃散。郑遵谦移资入海，独王之仁一军不动。国维与之仁相议抽兵五千，分守各营。之仁泣曰：坏天下事者，方荆国也（国安封荆国公）！北岸屯师数十万，倏然而渡，孤军何以迎敌？之仁有舡可入海。公兵无舡，速自为计。国维不得已，乃进旅追扈鲁王。王为国安、士英所困，欲挟入关献功。适守者病，王得脱，遇张明振、张斌卿，安于普陀寺。明振等船泊穿山港，后被总兵张杰同援剿总兵王之纲所击，始扬帆遁入舟山。登海舶，闻国维至黄石岩，傅维遏防四邑。维提师行，凡欲过之桥，业为国安断矣，不得进。
六月，贝勒师将至绍兴。督师余煌放城中妇女，出匿山谷。正衣冠，北向叩首，出东门渡东桥，赴水死。陈函煇、郑之尹、王思任、吴存鲁、陈潜夫、叶汝衡、高岱等皆死之。张国维闻义乌破，众劝维入山。维曰：误天下者，文山、叠山也！一死而已。报贝勒师至七里寺，国维正衣寇，南向再拜曰：臣力竭矣！作绝命诗曰：艰难百战戴吾君，拒敌辞唐气励云。时去仍为朱氏鬼，精灵尝傍孝陵坟。从容赴园池死。兴国公王之仁载其妻、妾、二子、二妇、幼女、诸孙，尽沈于蛟门下；捧所封敕印，北向再拜，投之水。独至松江，峨冠登岸，百姓骇愕聚观。之仁从容入见内院洪承畴，自称：仁系前朝太师，不肯身泛波涛。愿来投公，死于明处。劝薙发，不从。于二十四日慷慨就刑。
七月，贝勒、张存仁统满、汉平服绍兴诸处，有原吏部尚书商周祚、兵部尚书邵转忠、太仆寺卿姜一洪、兵科给事中谢秦宗等薙发投诚。惟阁部朱大典据金华府，贝勒用元真勾合红衣炮攻击。十六早，城破，大典同其子万化纵火自焚死。师至衢州，永丰伯张鹏翼守衢州，部将秦应科为内应，鹏翼战死；乐安王、楚王、晋平王、督学御史王景亮、知府伍经正、推官邓岩忠、署江山知县方召皆被杀。马士英、阮大铖、方国安、方逢年等拥兵数千，疏请入关。隆武以其罪大，不许。走台州，韩代追之，总兵叶承恩、李发叩马迎降。士英计穷，遁入台州山寺为僧。阮大铖、方逢年同新建伯王业大、总兵陈学贯、任和、高犹龙、黄明卿、高懋明、徐大锦、邵思绩等皆薙发投诚。徐而士英被获，同总兵赵体元解至，与刑部尚书苏壮，贝勒俱令随内院办事。
守关将施天福等接芝龙密谕，遂声言乏饷枵腹，难以御敌，尽撤兵四溃。掠至建宁，按院郑为虹与科道黄大鹏闭城，发仓库犒赏，欢声而去，一郡得全。
八月十三日，挂征南大将军印贝勒罗托、总督闽浙张存仁、抚院佟国鼐统满汉，从衢州拔营平闽。师次渔梁，郭曦、陈秀献仙霞关，贝勒从容渡岭。郑为虹按浦城，百姓请降。虹曰：不可。再请，虹执决不可。众背虹献城，拥为虹见贝勒。令之跪，虹仰天大笑，不屈。贝勒嘉其从容节操，不忍害，劝其薙发。为虹曰：负国不忠，辱身不孝，忠孝俱亏，生我何为？宁求速死，发不可薙也。明日复令见，责其输饷；虹曰：清白吏何处得金？百姓争欲代输，虹以民穷财尽答之。大骂，夺刀自刺胸膛见杀（虹字天生，江都人，癸未进士，百姓哀之，为立祠）。时有民谣曰：峻峭仙霞路，逍遥军马过。将军爱百姓，拱手奉山河（将军，指郑芝龙也）。
隆武知仙霞失守，芝龙又去，独立无靠，遂决意幸赣。于八月二十一日启行，从者惟何吾驺、郭维经、朱继祚、黄鸣俊而已。二十三日，贝勒至延平，知府王士和缢死。询土人，知隆武由汀州欲遁江右，遂遣总兵李成栋领师追之。贝勒提大师至福州。礼部尚书曹学佺（字能始，乙未进士，福州人）奔鼓山，向佛前问休咎。甫拜下，见绳一条。佺急取袖之，驰回家。将书案四，立改为棺。整衣寇题壁云：生前一管笔，死后一条绳！投笔自缢。通政使马思理缢死，侯官县贡生元纶不食死，闽县民赵节拜辞父母自缢，指挥使胡上琛饮药死，一妾同死（琛字库公，福州人），齐巽不屈被杀（字望子；时有八闽齐望子，金鸡第一声之称）永福武举赵子章死。
贝勒入城，安民毕，遣韩代、提督赵国祚、总兵孟全胜、王之刚、副将杨佐、王进功、王邦俊等领兵平兴化、泉、漳等府。守兴、泉总兵陈天榜、茅一经，薙发投诚，守漳总兵刘文谦同黄光煇、武刚伯陈秀、靖安伯郭禧、亦薙发投诚。独安平为郑芝龙所踞（安平即安海），军威甚盛，船只齐备，不肯投顺。
有原巡抚刘中藻，乘贝勒全师入闽，起兵破庆元县，声势大振。萧起元同提督陈雄，知会张存仁，仁飞檄驻防总兵马得功、副将李荣、杨虎，合副将袁仲等星驰进剿。中藻率总兵叶司孔等列阵三十余里迎敌，我师奋勇杀胜，追至城下，闭门固守。得功传令，乘其未备攻城，城上矢石如雨。杨虎、袁仲分头夺上城，生擒叶司孔，中藻自缢。
黄斌卿乘潮犯宁都东门江口，张杰亲督副将常进功、参将阎进功，自巳至酉，大战未分胜负。后因副将李让被杰阵杀，遂败遁。韩代驰报，贝勒遣投诚兵部尚书郭必昌持书招之（昌字太徽，己丑进士，泉之晋江人），其略曰：吾所以重将军者，以将军能立唐藩也。人臣事主，苟有可为，必竭其力。力尽不胜天，则投明而事，乘时建功，此豪杰事也。若将军不辅主，吾何用将军哉？且两粤未平，令铸闽粤总督印以相待。吾欲见将军者，商地方故也。芝龙得书大喜，厚待必昌，遣员同必昌进降表。其子成功劝曰：吾父总握重权，未可轻为转念。以儿细度，闽粤之地，不比北方得任意驰驱，若凭高恃险，设伏以御，虽有百万，恐一旦亦难飞过。然后收拾人心，以固其本。大开海道，兴贩各港，以足其饷。然后选将练兵，号召天下，进取不难矣。龙曰：稚子妄谈！不知天时时势。夫以天堑之隔，四镇雄兵，且不能拒敌，何况偏安一隅。倘画虎不成，岂不类狗乎？成功曰：吾父所见者大概，未曾细料机宜；天时、地利，有不同耳。清朝兵马虽盛，亦不能长驱而进。我朝委系无人，文臣弄权，一旦冰裂瓦解，酿成煤山之惨。故得其天时，排闼直入，剪除凶丑，以承大统。迨至南都，非长江失恃，细察其故，君实非戡乱之君，臣多庸禄之臣，遂使天下英雄饮恨，天堑难凭也。吾父若藉其崎岖、扼其险要，则地利尚存，人心可收也。龙曰：识时务为俊杰。今招我重我，就之必礼我。苟与争锋，一旦失利，摇尾乞怜，那时追悔莫及。竖子渺视，慎毋多谈！成功见龙不从，牵其衣，跪哭曰：夫虎不可离山、鱼不可脱渊；离山则失其威，脱渊则登时困杀。吾父当三思而行！龙见成功语繁，厌听拂袖而起。成功出，适遇鸿逵于途，告以始末。逵壮之。功遂密带一旅，遁金门。鸿逵入，芝龙语及成功少年狂妄轻躁，不识时务始末。
鸿逵曰：夫人生天地间，如朝露耳！能建功立业，垂名异世，则亦时不可失也。吾兄当国难之际，位极人臣，苟时事不可为，则弟亦不敢虚鼓唇舌。况兄尚带甲数十万，舳舻塞海，饷粮充足，辅其君以号召天下，豪杰自当响应。何必委身于人？此弟深为兄所不取也！芝龙曰：吾弟所言，眼前之事，非长远计耳。甲申之变，天下鼎沸，亦秦失其鹿，故清朝得而逐之，业已三分有二。若以小丈夫之气，振一旅而敌天下兵，恐亦不量力也。不如乘其招我，全军归诚。正弃暗投明，择主而事，古来豪杰亦往往有行之者。清朝正未必忍相弃耳！鸿逵曰：既吾兄志决，亦不可不为之虑。芝龙曰：人以诚心待我，我即以诚心应之，何疑焉？吾弟静听，俟吾单骑往会贝勒；看他如何相待，再作商量。鸿逵曰：吾兄已有成算，弟亦将奈何？惟有洗耳听佳音耳！龙令李业师、周继武等挑选好汉盔甲鲜明者五百人随从，刻日往省面贝勒。又差往金门，寻成功同行。功不从，上书有从来父教子以忠，未闻教子以贰。今吾父不听儿言，后倘有不测，儿只有缟素而已之句。芝龙见之，嗤其狂悖。即唤季子渡同行。