明前监臣徐孚远至自交趾。
孚远字闇公，几社六子之一。避难入岛，奉明主命使安南，为交趾所得；欲要以臣礼见，孚远不屈而还（有“交趾摘锦”传于世）。成功怒，遂禁商船，不许往交趾贸易。
戊戌、十五年（明永历十二年）春、三月，成功筑演武亭练兵。
亭在厦门港院东，澳仔岭之交，成功筑以操练军士。以石狮重五百斤为的，力能举者拨入左右虎卫亲军；皆戴铁面、着铁裙，执斩马大刀，并戴弓箭，号曰“铁人”。
成功命其将左武卫林胜督兵南下攻许龙，破之。
许龙为南阳巨盗，出没反覆，负固不服；成功命林胜合左右〔虎〕卫之兵攻之。师至，港水忽涨，胜等直入，龙率众遁；获其辎重、船只，焚其巢穴。澄海守将刘进忠迎降。
夏、五月，成功大举兵，图江南。
初，永历己丑开科于粤东，诏各勋镇考送诸生赴试。成功遂送生员叶后诏、洪初辟（原文开辟）等十余人，令洪志高赍本诣行在；舟至潮阳，遭风飘散，十余人不得达。独志高至粤，诏为兵部职方司监；命成功以〔舟〕师直抵南都。成功承旨，至是议欲大举直攻袭南京。诸将请曰：‘南京地远城坚，非数万人不可，不如近取为得计’；成功曰：‘入据长江，则江南半壁皆吾囊中物矣’！乃以黄廷为前提督、洪旭为兵官、郑泰为户官，留守厦门；而自率甘辉等北上。甲士十七万、铁人八千、战船八千扬帆而进，号八十万。
六月，成功徇浙江，平阳、瑞安诸县皆降。
成功兵至浙江，平阳守将车任暹、瑞安守将艾诚祥降。七月，师次羊山，为暴风飘没八千余人，次子从军溺焉；泊滃州修理战舰。九月，至象山（原文常山）；知县令父老赍羊酒犒师，命勿攻。十月，至台州港；后冲镇刘进忠叛入海门，遂令攻之，弃城而走。
己亥、十六年（明永历十三年）春、正月，成功军驻沙关。
夏、五月，明主在永昌。
成功军至崇明。
成功次崇明，诸将请先取之以为老营；不听。乃遣监纪刘澄密通江南提督马进宝；进宝有思明之心，密与成功通。
六月，成功破瓜州，寻克镇江府。
成功舟至焦山，谓诸将曰：‘瓜镇为金陵门户，须先破之’；乃授诸将机宜。值南风盛发，各率所部进据瓜州上流。十六日，自督亲军及甘辉等将直捣其栅，操江军门朱衣佐、城守左云龙率满骑兵迎战。阵方交，成功挥军大进，右武卫周全斌率步骑浮水先登，直冲其阵；身中五矢，气益厉。诸军继之，衣佐等兵大溃，杀云龙于桥下，衣佐被擒，瓜州遂为所陷；成功命援剿左镇刘猷守之，以柯平为江防同知。见朱衣佐，欲用之；以有母在，哀恳求归，成功给资脯纵之。二十日，成功移兵趋镇江，总督管效忠率满、汉军夹击，奋力死战；成功亲督诸军，效忠大败，仅以身免，积尸填河。知府戴可进等开门出降，成功令周全斌守之；属邑皆下。又令张煌言督戎政杨朝栋招抚江南、袁起振招抚江北；于是太平、宁国、滁、和、徽、池诸郡县俱欲降成功，即杭州及九江等处亦有密谋归成功给札欲为内应者。
秋、七月，成功进逼南京。
瓜镇既破，甘辉进谓成功曰：‘瓜镇南北咽喉，但坐镇此，断瓜州，则山东之师不得下；据北固，则两浙之路不得通：南都不劳而定矣’！成功不听。将进兵，甘辉又请陆路而行，以为‘乘破竹之势，一鼓可下，或破其附近州县以绝援兵，则南京势孤，自必难守；若欲由水路，恐风信稽迟，援兵四集，又费工力’。时诸将（原文为众）多以从水路为利便，成功遂率兵扬帆，直指南都；传檄有‘六月兴师，敢云趋利！十年养锐，正欲待时’之语。
成功遥祭明太祖高皇帝孝陵。
成功由凤仪门登岸，屯兵岳庙山；望祭明太祖孝陵，再拜恸哭，哀动三军，诸将士无不感奋。
成功遣蔡政、高绵祖会江南提督马进宝师。
进宝心恋明朝，密有通款；成功师次崇明时，曾遣刘澄赍密函通之。至是，遣蔡政等前往，订其帅师来会。
成功列营围南京，副将梁化凤率师击败之。
成功师迫南京，甘辉进曰：‘兵贵神速，宜急攻城，乘其势未定而拔之；不然，彼缓兵毕集，难以攻取，君必悔之’！成功不听；乃列营围之。方下令示期攻城，会援兵至，有千骑迫前锋营，为余新击败，成功遂轻敌无备。城上兵觇其军懈，是夜副将梁化凤由凤仪门穴城十余道，率兵从街房中毁墙而进，复迫余新营；众不及甲，仓皇出拒，副将董拱中、萧拱柱死焉，余新被擒。成功闻警，使〔翁〕天佑驰援，已无及矣。南京于是尽出骑兵列于城下，成功自督亲军击退。既而援兵云集，四面合攻。成功督诸将接战，累败；麾军退，登船而渡；水师击楫追之，成功令黄安御之，沉其数船，追兵乃止。成功于是徐渡诸军，而趋镇江。是役也，甘辉且战且走，单骑驰骋，人不敢近，马踬被擒；入金陵，戟手骂，不屈；遂幽之，徐使人说降；辉怒骂，求速死，数日水浆不入口，乃引出斩之，神色不变；悬其首于市，青蝇不敢附，军士以为忠义所感，函而葬之。时五军张英、亲军林胜、陈魁、提督万礼、总镇蓝衍、魏标、卜世用、洪复、户官潘赓钟、仪卫吴赐等皆阵亡。
成功攻崇明，不克；遣蔡政往北京议和。
是月四日，成功回师至吴淞港；使蔡政往见马进宝，商酌入京议和事宜。八日，至崇明；十一日，攻城，崩裂数十丈，守将梁化凤固守不下。周全斌以为孤城狭隘，得之无益；适马进宝差中军同蔡政劝成功退师以待奏请，徐观和局成否。从之；仍遣蔡政往北京。
九月，成功回厦门。
成功既回，建忠臣庙祠死事诸人，以甘辉为第一，入哭尽哀；曰：‘吾早从将军之言，不至此’！以女妻其子孟煜，厚恤其家。
冬、十二月，蔡政自北京还。
政至京，特赐一品袍褂；命回江南，与督抚、提督会议。甫出京，有人言劾成功无礼，请系来使；驰檄追捕。政闻之，即昼夜兼程，由间道奔回。既至，成功嘉其才智，亲酌酒劳之，礼待有加；始知和议不成、系同安侯于狱、逮马进宝入京问罪及遣满州将军达素督兵三省会剿之由。
庚子、十七年（明永历十四年）夏、四月，成功改右提督马信为提督亲军骁骑镇。
成功闻达素将合兵攻厦门，令各镇官兵眷口搬住金门，命英兵镇陈瑞同户官郑泰保护。
五月，满州将军达素合兵攻厦门；及郑成功战于海上，达素败绩。
帝以江南既定，乃命达素及总督李率泰大搜两岛。五月，部份满、汉军大船出漳州、小船出同安，檄广东投诚许龙等引兵来会。成功以陈鹏督诸军守高崎，遏同安；郑泰出浯州，遏广东；自勒诸部，据海门。初十黎明，漳船乘风迫海门，成功使五府陈尧策令诸战舰按兵不动，俟其齐出击之；呼吸间，兵船乍至，诸战舰奉令莫敢先动，闽安侯周瑞先为漳船击破，与陈尧策皆死焉。继攻陈辉船，辉发火药烧之，满兵跃退，且战且却。成功自驾八桨板船，往来视师。向午，潮涌风发，乃亲率巨舰冲之；郑泰自浯屿引兵合攻，北兵大败，尸积遍海。有满兵数百弃船上圭屿，马信亲招降之，夜溺诸海。是日，同安船趋高崎，陈鹏约降，饬所部勿动，欲为内应；于是诸兵未及岸，涉水争先。鹏部将陈蟒不与谋，曰：‘事急矣！当决一死战’；麾其属过船，与殿兵镇陈璋合攻击之，北兵披靡，蹈海死者十七八（原文为人），首领吕哈唎被擒，满兵被杀者一千六百余人。成功收鹏诛之，以蟒代其职。