十月，秦阳平公融等攻寿阳；癸酉，克之，执平虏将军徐元喜等。胡彬闻寿阳陷，退保硖石，融进攻之。秦卫将军梁成等率众五万屯于洛涧，栅淮以遏东兵。谢石、谢玄等去洛涧二十五里而军。惮成不敢进。胡彬粮尽，潜遣使告石等：“今贼盛粮尽，恐不复见大军。”秦人获之，送于阳平公融。融驰使白秦王坚曰：“贼少易擒，但恐逃去，宜速赴之！”坚乃留大军于项城，引轻骑八千，兼道赴融于寿阳。遣尚书朱序来说谢石等，以为：“强弱异势，不如速降。”序私谓石等曰：“若秦百万之众尽至，诚难与为敌。今乘军未集，宜速击之；若败其前锋，彼已夺气，可遂破也。”石闻坚在寿阳，甚惧，欲不战以老秦师。琰劝石从序言。
十一月，谢玄遣广陵相刘牢之帅精兵五千赴洛涧，未至十里，梁成阻涧为阵以待之。牢之直前渡水，击成，大破之，斩成及弋阳太守王咏；又分兵断其归津，秦步骑争赴淮水，死者万五千人，执秦扬州刺史王显等，尽收其器械军实。于是谢石等水陆继进。秦王坚与阳平公融登寿阳城望之，见晋兵部阵严整，又望八公山上草木，皆以为晋兵，顾谓融曰：“此亦劲敌，何谓弱也！”怃然始有惧色。
秦兵逼肥水而阵，晋兵不得渡。谢玄遣使谓阳平公融曰：“君悬军深入，而置陈逼水，此持久之计，非欲速战者。若移阵少却，使晋兵得渡，以决胜负，不亦善乎！”秦诸将皆曰：“我众彼寡，不如遏之，使不得上，可以万全。”坚曰：“但引兵少却，使之半渡，我以铁骑蹙而杀之，蔑不胜矣！”融亦以为然，遂麾使却。秦兵遂退，不可复止。谢玄、谢琰、桓伊等引兵渡水击之。融驰骑略阵，欲以率退者，马倒为晋兵所杀，秦兵遂溃。玄等乘胜追击，至于青冈，秦兵大败，自相蹈藉而死者，蔽野塞川。其走者，闻风声鹤唳，皆以为晋兵将至，昼夜不敢息，草行露宿，重以饥冻，死者什七八。初，秦兵少却，朱序在阵后呼曰，“秦兵败矣！”众遂大奔。因与张天锡、徐元喜皆来奔。获秦王坚所乘云母车。复取寿阳，执其淮南太守郭褒。坚中流矢，单骑走至淮北，饥甚，民有进壶飧豚髀者，坚食之，赐帛十匹，绵十斤，辞曰：“陛下厌苦安乐，自取危困。安有子饲其父而望报者！”坚谓张夫人曰：“吾何面目复治天下乎！”是时，诸军皆溃，惟慕容垂所将三万人独全，坚以千余骑赴之。垂亲党多劝垂杀坚，垂皆不从，悉以兵授坚。谢安得驿书，知秦兵已败，时方与客围棋，摄书置床上，了无喜色，围棋如故。客问之，徐答曰：“小儿辈便已破贼。”既罢，还内，过户限，不觉履齿之折。
庚申，诏卫将军谢安劳旋师于金城。丁亥，谢石等归建康，得秦乐工，能习旧声，始备金石之乐。乙未，以张天锡为散骑常侍，朱序为琅邪内史。
十二月庚午，大赦。以谢石为尚书令。
谢安婿王国宝，坦之之子，安恶其为人，每抑而不用，以为尚书郎。国宝自以望族，故事惟作吏部，不为余曹，固辞不拜，由是怨安。国宝从妹为会稽王道子妃，帝与道子皆嗜酒，狎昵邪谄，国宝乃谮安于道子，使离间之于帝。安功名既盛，险波求进之徒，多毁短安，帝由是稍疏忌之。初开酒禁，增民税米，口五石，诏诸将分途进取。
九年正月辛亥，渴建平等四陵。是月，鹰扬将军刘牢之攻秦谯城，拔之。
二月辛巳，使持节都督荆、江、梁、宁、益、交、广七州渚军事、车骑将军、荆州刺史丰城宣穆公桓冲卒。以梁郡太守桓石民代之。
三月，进卫将军谢安为太保。
四月己卯，增置太学百人。
六月癸丑朔，崇德太后褚氏崩。
七月戊戌，遣司空高密王纯之修谒洛阳五陵。己酉，葬康献皇后于崇平陵。
八月戊寅，司空郗惜卒。诏谢玄出屯彭城，经略中原，玄帅诸军堰吕梁水，树栅，立七埭为派，拥二岸之流，以利运漕。又进伐青州，故谓之青州派。
九月甲午，加太保谢安大都督扬、江、荆、司、豫、徐、兖、青、冀、幽、并、梁、益、雍、凉十五州诸军事。
十月己丑，大赦。中书侍郎车胤上表议立明堂辟雍。前荥阳太守习凿齿卒。
十年正月甲午，谒诸陵。尚书令谢石以学校陵迟，上疏请复国学于太庙之南。
四月，会稽王道子与太保安有隙，安欲避之。会秦王坚遣使求救，诏太保安率众救秦。帝自行西池宴群臣饯安，赋诗者五十八人。
甲子，太保安发自石头，出镇广陵之步丘，筑垒曰新城而居之。
六月，苻坚太子弘自长安来奔。
七月，大旱，井渎皆竭。太官共膳，皆资天泉池。
太保安有疾，求还，诏许之。遣侍中慰劳。八月，安至建康。丁酉，使持节侍、中书监、大都督十五州诸军事、太保谢安卒。以琅邪王道子领扬州刺史、录尚书、都督中外诸军事；以尚书令谢石为卫将军。
十月丁亥，论淮肥功，追封谢安庐陵郡公。
十一年正月乙酉，谒诸陵。
三月，大赦。
四月癸巳，以陆纳为尚书左仆射，谯王恬为尚书右仆射。
六月乙卯，地震。
八月甲午，封孔靖之为奉圣亭侯，奉宣尼祀，立宣尼庙，在故丹阳郡城前。
是岁，辽东表送孙盛《魏晋春秋》三十卷。
十二年正月乙巳，以朱序为青、兖二州刺史，镇淮阴。丁未，大赦。
四月戊辰，尊夫人李氏为皇太妃。
六月，束帛聘处士戴逵、龚玄之。
八月辛巳，立皇子德宗为皇太子。大赦。甲辰，海西公奕薨于吴。
九月戊子，复新宁王遵还为武陵王。
初，帝既亲政事，威权已出，有人主之量。已而溺于酒色，委事于琅邪王道子，道子亦嗜酒，日又与帝以酣歌为事。又崇尚浮屠，穷奢极费。所亲呢者，皆蚶姆、僧尼。左右近习，争弄权柄，交通请托，贿赂公行，官赏滥杂，刑狱谬乱。陆纳望宫阙叹曰：“好家居，纤儿欲撞坏之耶！”
十三年正月，康乐献武公谢玄卒。
四月戊午，朱序为都督司、雍、梁、秦四州诸军事，以谯王恬代为青、兖二州刺史。
十二月庚子，尚书令南康公谢石卒。车胤为护军将军。
十四年正月癸亥，诏淮南所获俘虏付诸作部者皆放遣，男女自相配匹，赐百日廪。其没为军实者，悉赎出之。襄阳、淮南浇沃之地，各立一县以居之。龙骧将军刘牢之讨彭城妖贼刘黎于皇邱，平之。
二月，扶南来贡。
四月甲辰，彭城王弘之卒。
六月，会稽王道子移扬州，治于东第。
七月，旱。
九月甲午，以尚书左仆射陆纳为尚书令。
十一月，会稽王道子势倾内外，远近奔凑，帝渐不平，然犹外加优崇。侍中王国宝以谗佞有宠于道子，煽动朝众，讽八坐，启道子宜进位丞相、扬州牧，假黄钺，加殊礼。扩军将军车胤曰：“此乃成王所以尊周公。今主上当阳，相王岂得为周公！”乃称疾，不署疏奏，帝大怒，而嘉胤有守。
十五年正月乙亥，青、兖二州刺史谯王恬卒。
二月辛巳，以中书令王恭督青、兖、幽、并、冀五州诸军事，青、兖二州刺史。
三月戊辰，大赦。
九月，以侍中王国宝为中书令，俄兼中领军。丁未，以吴郡太守王殉为尚书仆射。
十六年正月，诏徐广校秘阁四库书，凡三万六千卷。
二月庚申，改筑太庙。
九月，新庙成。癸未，以尚书右仆射王瑚为左仆射，太子詹事谢琰为右仆射。
十月，新作朱雀门。
十一月，护军将军桓伊卒。
十七年正月乙巳朔，大赦，除逋租宿债。
六月癸卯，京师地震。甲寅，涛水入石头，毁大航。
八月，新作东宫，徙左卫营。
九月，除南郡公桓玄义兴太守。
十一月，以黄门郎殷仲堪为荆州刺史。自秋不雨，至于十二月。
十八年正月癸卯，地震。
二月乙未，地震。
南郡公桓玄负其才地，以雄豪自处，朝廷疑而不用，年二十三，始拜太子洗马。玄尝诣琅邪王道子，值其酣醉，张目谓坐客曰：“桓温晚涂欲作贼，云何？”玄伏地流汗不能起，由是益不自安，常切齿于道子。玄在江陵，仲堪敬惮之。征虏参军豫章胡藩过江陵，见仲堪曰：“桓玄志趣不常，每快快于失职，节下崇待太过，非将来之计也！”
十九年六月壬午，追尊会稽王太妃郑氏为简文皇太后。
七月，徐州大水，伤秋稼，遣使振恤之。
八月己巳，尊皇太妃李氏为皇太后，宫日崇训。