八月乙丑，命赈聚宝门外军民被水者，户给米一石；漂房舍者倍之，溺死者户三石。戊辰，改应天府知府为府尹。秩正三品，赐银印，设府丞一人、治中一人、通判二人，以兰以权为府尹。乙酉，中书省臣言：“在京军储仓二十处，收粮六百余万石，每仓设官三员，请增设京畿漕运司官，专督其事。”从之。是月，京师开乡试。
九月戊子，京师城隍庙成。庚寅，以兵部郎中程昱为本部尚书。辛卯，户部奏：“赏军用布，其数甚多，请令浙西四府秋粮内收布三十万匹。”上曰：“松江乃产布之地，止令一府输纳，以便其民，余征米如故。”庚子，以起居注杨训文为礼部尚书；岳州府知府蒋恩德为户部尚书；湖广荆州分省赞理刘大昕为刑部尚书。召山东行省参政安然、浙江行省参政安庆为工部尚书；广西行省参政商嵩为吏部尚书。庚戌，户部奏广苏、松等府官民田租不及六斗者，请输京仓；六斗以上者，输镇江、瓜州仓。”上令租之重者，于本处仓收贮，余皆令输入京。
十月丙辰，赐直隶郡县孤独老疾者布，人一匹。
十一月甲午；以开封府知府宋冕为户部尚书。乙卯，以吏部尚书王兴福为西安府知府；调刑部尚书郎本中为吏部尚书。
十二月戊午，宥松江盗钱鹤皋余党。初，鹤皋作乱伏诛，其党株连不已。至是复逮至百五十四人，法皆当死。上曰：“贼首既诛，此胁从者俱贷其死，谪戍兰州。”甲子，凤台门军营火，延烧民舍及武德卫军器局甲杖。乙丑，以吏部尚书商暠为侍御史；邵武府知府周时中为吏部尚书。
四年二月丁卯，命改铸大中洪武通宝大钱为小钱。先是，宝源局所铸新钱，皆铸京字于其背，其后多不铸，民间以二等大钱无京字者不行使。故命改铸为小钱以便之。戊辰，诏免镇江今年田租。己巳，建奉先殿成。癸酉，上谓中书省臣曰：“临濠为朕兴王之地，今置中都，宜以傍近州县通水路漕运者隶之。”于是省臣议以寿、邳、徐、宿、颖、息、光、六安、信阳九州，五河、怀远、定远、中立、蒙城、霍丘、英山、宿迁、睢宁、砀山、灵壁、颖上、泰和、固始、光山、丰、沛、萧一十八县，悉隶中都。壬午，京师火燔军民庐舍。
闰三月庚午，应天府奏，核实关厢军民官吏人户，凡二万七千一百五十九。民二万一千五百六十七户、军一千八百九十六户、公侯族属一千一百九十七户、官吏二千四百九十九户。壬午，以陈修为吏部尚书。置泰州守御千户所。
四月甲申，以礼部侍郎秦文绎为户部尚书。壬辰，置京城金川、太平二门千户所。辛丑，五色云见。以秀才丁士梅为苏州府知府、童榷为扬州府知府，俱赐冠带。
五月丁巳，以起居注孙用为常州府知府、给事中萧惟一为扬州府知府。俱赐冠带衣靴。辛酉，以廉润为松江府知府。乙亥，免两浙秋粮。戊寅，改礼部尚书杨训文为户部尚书。辛酉，应天府江宁县进白兔。
八月丙戌，徙应天卫治于江浦。甲午，诏免扬州、淮安、泰州今年田租。乙亥，擢中书省左司郎中海渊为户部尚书。
九月庚午，以吴懋为苏州府知府、高义为淮安府知府。丁酉，赏在京及濠、梁等卫将士六万五千九百余人，凡文绮百六十匹、白金四十万七千一百两有奇。戊寅，江宁县人入役内库，盗用珊瑚、珠罗、斛香，于法当死。上以细民贪利无知，命杖之。库官失觉察者，亦杖而罢其职。
十月，修筑京师城。
十一月癸亥，京师大军仓火。兴化卫指挥佥事李春发宋时人冢，盗黄金等物。有司以闻。上命罪之如律，仍追所盗物，殪瘗其骸，立木刻其事于墓左，以为民戒。壬申，中书省奏“直隶淮安等府屯田，凡官给牛种者，请十税五；自备者，十税三。”诏且勿征，三年后亩收租一斗。
十二月壬午，改高邮守御千户所为高邮卫。置扬州卫。壬辰，诏沿江芦场听军民樵采，敢有侵占者，坐其罪。癸巳，礼部奏：“镇江等府民有饲官鹅，瘠者例当罪之，而责其值。”上不许，曰：“以微物而厉民，岂为政之体乎？”戊戌，置横海卫。改水军卫为水军左、右二卫。
五年二月辛巳，命两淮都转运盐使司移通、泰等州批验所于仪真县。仍疏浚运河，以便商旅。壬辰，京师火，燔龙江、鹰扬二卫军士庐舍、仓粮、兵器。癸巳，京师火，燔广武、西安、天长三卫军士庐舍、仓粮、兵器，男女有死伤者。甲午，京师国子街、虹桥、广洋卫并火，燔军民庐舍，人有死伤者。
三月戊申朔，应天府言：“运输官物，悉投在京之民，其力甚劳。”上谕省臣曰：“京师之民，自开国以来，皆其供亿，劳费倍于外郡。今天下太平，正当休养之，岂可重扰耶？凡有差役，宜悉免之。”丙辰，工部侍郎黄肃为本部尚书。庚申，以礼部主事魏观为苏州府知府。癸亥，以张遇林为应天府府尹。
四月丁亥，赐京民盐，户七斤。
五月，骁骑、羽林、江阴诸卫火，燔庐舍及官仓，死者凡十人。
六月己丑，赐京民绢，户一匹。命羽林卫指挥使毛骧、於显、指挥同知袁义等领兵捕逐苏、松、温、台州濒海诸郡倭寇。
七月辛酉，苏州府崇明县、通州海门县大雨潮涌，漂民庐舍。壬戌残，京师风雨地震。是月，苏州府崇明县水灾。诏有司毋征其税，恐所报有未尽，令尽报免之。
八月，赐仪真千户所军士三百余人钱八十五万四千有奇。庚申，通州海门县水灾，诏免其租。
十月乙亥，复置龙虎卫于浦子口。是月，蠲应天，镇江等府秋粮。
十二月丙午，以兴化卫并为钟山卫；天长卫并为定远卫；振武卫并兴武卫；和阳卫并神策卫；通州、吴兴三卫并龙骧卫。寻复设和阳、神策二卫。
十二月甲申，修浚京师城濠。丙戌，京师定远等卫火，延烧营舍及军器局兵仗。
六年正月已酉，置上元诸县寒桥等三十七处巡检司。
二月丙戌，苏州府崇明县为海潮淹没，民饥。诏有司赈之，计户四千四百八十二，赈米五千九百二十石有奇。戊子，改群牧监为太仆寺，秩如旧。始定养马之法，命应天、镇江等府民养马江北，以便水草，一户养马一匹。江南民十一户养马一匹。官给善马为种，率三牝马置一牡马。每百匹马一群，群设群头、群副掌之。牝马岁课—驹。牧饲不如法．至缺驹、损毙者，责偿之。其牧地择旁近水草丰旷之地，春时牧放游牝，秋冬而入。寺官以时巡行群牧，视马肥瘠而劝惩之。命增筑国子学舍。时上以国学天下英才会聚，四方来学者益众，充溢斋舍。命礼部经理增筑学舍凡百余间。发松江、嘉兴民夫二万，开上海县胡家港，自海口至漕泾一千二百余丈，阔二十丈，以通海船。庚子，左迁工部侍郎王虎为苏州府知府。以颜希哲为户部尚书。是月，以牛谅为礼部尚书。
三月乙巳，武德卫火。赈军士千一百余人，寡妇百八十余人米，人一石。乙卯，升苏州府知府魏观为四川行省参政。未行，命仍知苏州。己未，金吾后各卫火，延烧太平门军士庐舍。
四月甲戌，诏以苏州府粮十二万石由海道运赴定辽、十万石运赴北平，以时方用兵辽左及迤北故也。是月，赐六合县安置鞑鞑夏布，人二匹。
五月戊辰；以李敏为工部尚书。是月，应天府江宁县、镇江府丹徒县、常州府江阴、无锡二县、淮安府沭阳县、苏州府长洲县、扬州府属邑并雨雹。
六月辛未，赏京卫军士九万余人米，各三石。乙酉，以浙江按察司副使孙克义为刑部尚书。己丑，以户部郎中吕熙为尚书。
七月庚戌，以户部尚书吕熙为吏部尚书。丙辰，以兵部尚书乐韶凤为翰林侍讲学士；邢部尚书孙克义、四川行省参政刘仁，俱为兵部尚书；四川行省参政刘惟谦为刑部尚书、吏部尚书詹同为翰林学士承旨，仍兼吏部尚书。癸亥，常州吕城巡检司盘获民无路引者，送法司论罪。问之，其人以祖母病笃，远出求医急，故无验。上闻之曰：“此人情可矜，勿罪，释之。”甲子，苏州府属县民饥。诏以官粮贷之，计户五万九千五百九十六，来者减其半值；贷者秋成还官。
八月乙酉，建历代帝王庙于京师。辛卯，以镇江府知府周时中为两淮都转运盐使司副使。