六月庚戌，淮安关监督应办事宜，移交两江总督办理。癸丑，江南制造局拟建新厂，谕派铁良前往考求筹划。庚申，魏光焘等奏：部议筹饷条款，江苏省宁、苏两属酌量加提丁漕征数，每年可提银二十一万两。自光绪三十年上忙为始，照数解司，以备拨用。又臣等暨藩司以至各道府局员共报效银六万五千两，解存司库，听候部拨。又奏：苏省筹议整顿钱粮章程六条，核提年外增加漕价钱文章程二条，现办清查沙洲情形四条。恩寿奏：苏州苏经、苏纶丝、纱两厂，另招新商接办。又奏：疏浚徐六泾河工费由得占水利七县摊征。辛酉，恩寿奏苏州建造工艺局，以维贫民生计。魏光焘奏江北漕粮仍行海运。开浚武进等县运河，全工告竣。苏省设局铸造铜元流通。是月，端方奏请于苏州省城添设学务处。
七月壬辰，张謇在宿迁设立耀华玻璃公司，谕两江总督等饬属保护。戊戌，李兴锐署两江总督，胡廷干调江宁布政使。
八月丙辰，恩寿奏抵任清淮考察地方情形，及营务、河务、鼓铸铜元应整顿事宜。十一日，江苏留防军需第三十一案报销一百六十四万八千八十二两有奇。戊午，魏光焘奏现办江宁省城并各府、厅、州、县学堂大概情形。己未，魏光焘奏：“据在籍翰林院修撰张謇条陈盐业公司办法，拟变通盐法，设厂造盐。一切煎法、运法、销法由公司禀请盐政立案。查设法改良，试办一隅，无碍全局。似当尽穷变思通之义，以期补救。令张謇可就淮南吕四一垣试办，仍名同仁泰垣，毋庸别立公司名目。”得旨：如所请行。甲戌，江宁省城设立练兵学堂。
九月乙未，李兴锐、端方奏复：查明苏省各州、厅、县经征钱粮、漕米数目。戊戌，周馥署两江总督，未到任前端方暂署。效曾护江苏巡抚。癸卯，端方奏请裁撤江苏粮储道员缺。又奏苏省清查荒亩、定章招垦、切实筹办各情形。
十月乙巳朔，端方奏：苏属四府一州荒地不下二百余万亩，以镇江、苏州为最多，常州次之，松江、太仓为最少。拟定垦荒章程，分别官荒、民荒、土佃、客佃及缴价升科各条，俾化瘠为腴，增收田赋。己巳，端方奏：苏省二十九年份征收漕、白二粮本折实数及折漕等银，陆续解交江海关兑收候拨。
十一月辛巳，端方迁，陆元鼎署江苏巡抚。癸未，端方奏：于江宁水师学堂中挑选合格学生六名，由英国驻沪水师总兵分派各船学习，两年为限。学费于通州纱厂官本利息项下分年筹给。江海关道收款自三月一日起，遵商部议以三成存库，其余七成发庄生息。癸巳，端方奏：苏、松、常、镇、太各属选送学生六十八名，京口、江宁两驻防选送旗生四名，宁属各厅、州、县选送师范生五十二名，又三江师范学堂练习教员二十一名，一并咨送赴日学习速成师范。毕业回华，仍分派该厅、州、县充当教习。
十二月庚戌，黄建筦调江宁布政使。辛亥，政务处议：江安粮储道一缺，毋庸裁并。苏州府海防同知移驻太平洲，改为太平厅抚民同知。苏州府管粮通判移驻洞庭西山，改为靖湖厅抚民通判。青浦县主簿移驻黄渡，荆溪县主簿移驻梧桐山，拟请照准。得旨：如所议行。甲子，端方等奏：于苏州铸铜元，盈余项下自明年正月起拨银一千两做为南菁高等学堂常年经费。端方、效曾奏：无锡、金匮两县匪徒拆毁俟实、东林两学堂及崇安寺蒙学堂，米商抗捐罢市，已将匪犯拿缉惩办。丙寅，谕：“政务处奏，议复裁改漕运总督一折。江北地方辽阔，宜有重镇。顺治年间改设漕运总督，原兼管巡抚事。现在河运全停，着即改为江淮巡抚，以符名实而资治理。即以原驻地方为行省，江宁布政使所属之江、淮、扬、徐四府暨通、海两直隶州全归管理，仍着两江总督兼辖，以专责成。”周馥奏江南穷民过多，亟应广筹接济，拟请开办捐。丁卯，恩寿调江淮巡抚，陆元鼎为江苏巡抚。己巳，周馥奏，南洋海军，应照北洋合成一队，专派大员统御，以齐号令，而期整理。兹将南洋各兵舰归并现统北洋海军广东水师提督叶祖珪统御。
三十一年正月癸巳，铁良奏勘查江苏等省炮台、陆军水师武备学堂情形。甲午，谕江宁等府：当商额外息捐，恳请减免，着周馥体察情形，查明办理。庚子，恩寿奏：“江淮既设行省，拟恳仿照安徽、江西两省之例，巡抚兼提督衔节制各镇。并请于江淮巡抚关防内加刊兼提督衔字样，以符名实。”
二月癸丑，周馥奏：丹徒县属三十年份秋勘，剔荒征熟，拨款抚恤。至该县刁民藉荒闹漕，聚众千余，营勇弹压始散。署知县张绍棠已予撤任，乡董胥差私敛荒费，已饬县确拿惩治。戊辰，以上年丰收，周馥奏请暂开镇口及仙濠两处米禁。
三月乙亥，恩寿奏筹改江北实业学堂先行试办，以裕利源。庚寅，裁撤江淮巡抚，改淮扬镇总兵为江北提督。以潘万才署江北提督。效曾奏：以铜铅各价增涨，增铸当五铜元以资弥补。
四月丙午，刘永庆署江北提督。周馥奏请修补江宁城垣。壬子，以德兵舰突至海州测量，饬外部严诘德使。癸丑，周馥奏：上海船坞亟须整顿。以广东水师提督叶祖珪督察船坞事宜，副将吴应科总办船坞，洋员巴斯为船坞总办稽查。改照商坞办法，先将改办情形具陈。甲子，俄国逃舰六艘驰入吴淞，一律下旗听受约束。
五月壬辰，周馥奏选派员匠分赴英、德各厂，学习制造，以裕军储。
六月庚戌，周馥奏遵旨查明江宁等府当商息捐，系奏作赔款要需，暂难减免。辛亥，宝苏局铸当二十文黄铜元。己未，周馥奏江苏钱价大跌，请禁铜元进口。癸亥，吴淞三官堂炮台无烟药库天热自焚，计毁烧药八千余磅。甲子，两江遵照新章，于步兵之外试练炮、马、工程、辎重各科。周馥奏查办微山湖滩地缴价升科，并筹备徐防兵饷情形。又奏淮北甲辰纲加增新引，势难依限销完。拟请宽展限期，酌加引额为三十六万引，以为维持北鹾之计。下户部议。
七月辛巳，江南义赈彩票，商办期满，改归官办。戊戌，周馥奏：裁并江南各路防营，筹办征兵，拟先练成一镇及设督练公所。己亥，周馥奏淮南、鄂、湘、皖四岸以五十万引为比较。庚子，周馥奏拟酌拨江北练兵经费新筹之款八、九十万两。下练兵处、户部知。
八月丙午，谕：有人奏江苏征漕折价违例病民，请饬照市定价。谕周馥、陆元鼎查劾整顿。辛亥，拨内帑银三万两赈恤川沙、宝山、南汇、崇明等处被水灾民。谕赏银三万两急赈灾民。癸丑，周馥奏陈筹议淮南、北各场加增产额办理大概情形。甲寅，政子濮为江苏布玫使，恩铭为江宁布政使，袁树勋为江苏按察使，瑞澂为苏松太道。辛酉，谕责盛宣怀将沪宁铁路早为收回。癸亥，奏拨修筑金陵关租界经费。周馥奏请于江宁省城设立银行一所，并分设本省、外省各市。无论何处，官绅商民均准附股，但不收洋股。丁卯，张謇等创设上海大达轮步股份有限公司，准予立案。己巳，外务部与各国使臣改订修浚黄浦河道条款十二条。
九月辛卯，周馥奏：苏属沿海各厅县风潮为灾，恳予截拨新漕并附江南工赈捐输，汇劝接济。陆元鼎奏赈川沙等属潮灾。壬辰，新授江苏布政使濮子潼到任尚须时日，以陆钟琦暂署。丙申，周馥奏海州商务渐兴，拟请自开商埠。又海州绅商请行驶小轮。得旨：从之。
十月辛丑，整顿清淮警察。壬戌，改派唐绍仪督办宁沪铁路。丁卯，弛上海出口米禁。
十一月癸酉，周馥奏设江南筹款局。己卯，刘永庆奏改并漕督、淮扬两标各营，酌量存留。
十二月庚戌，周馥奏验改长江浅水江元新式快船，并拟续造三艘。辛亥，设江宁陆军小学堂。奏挑留调防永州常备左军六营九百人，余悉遣散。甲寅，以江南织造裁缺，应办物件分派苏、杭织办。工料银两，由江南筹拨分解。
三十二年正月乙亥，蠲缓宁属上元等三十三州县、苏属长洲等二十七州县上年被灾钱粮。甲申，陆元鼎奏遵旨筹办警察，并设立警察学堂以资练习。又奏设立仕学馆一所，派藩、臬两司为督办，候补道罗道长为监督。造就吏治人才，一年毕业。并附设法政学堂，增广学额，以期造成专门人才。又奏苏省开办游学预备科情形。癸巳，陈夔龙为江苏巡抚。丙申，朱家宝为江苏按察使。是月，设立卫生学堂。
二月丁未，继昌为江宁布政使。是月，练兵处议，江南要塞各标一律改为巡防队。