四月壬午，琦善等奏攻破扬州城外贼营木垒、土城。嘉奖。甲申，以英人火轮船至江宁南岸，与贼交接，命退出江口。移徐州粮台于宿迁。丙戌，谕江苏等被贼各省广置义冢掩埋尸骸。辛卯，命李僡、慧成应援徐州。戊戌，设苏州军需总局。命怡良饬汰，收集江苏各营溃兵，另募充补。李德麟署狼山镇总兵。辛丑，命哈芬、张祥河妥速办捐，济解徐、宿粮台饷项。癸卯，免江苏商米关税。许乃钊请将苏、松、常、镇、太四府一州按亩捐输，抵作上忙钱粮。
五月丙午，命奕经扼驻徐州一带。丙辰，调直隶、山西两省额设营马五千匹赴江南军营备用。戊午，命福济统留防扬州湾头官兵。陈启迈办粮台。麟桂署江宁布政使。己未，贼船由江宁上驶，安庆复陷。甲子，命周天爵扼守徐州。丁卯，谕江、浙、豫筹接济大营军饷。是月，河复决砀山兵三堡。
六月戊寅，以进攻扬州调度失宜，夺琦善职，仍留任。己丑，严谕琦善、向荣迅速赴江宁、镇江、扬州。乙未，和春暂署江南提督。庚子，饬催广东续募红单船驶往江南助剿。
七月辛亥，命李僡筹款拨济徐州粮台。甲寅，谕江南军饷由各省径行解往。文煜为江宁布政使。倪良耀降，陈启迈为江苏布政使。戊午，琦善奏，攻剿扬州北门等兵三千五十九名，西门兵二千七百三十四名。己未，周天爵奏准拨淮北票盐十万引，招商认贩，运皖督销。辛酉，允以上海关税拨济充江南军需。甲子，长臻奏，江南河标存马步兵一千一百九名。庚午，释余万清于狱，命效力江南军营。
八月己卯，谕江苏漕粮尾数折价解部。己丑，户部奏：淮南盐法请变通酌办。江苏上海、嘉定匪徒滋事。乙未，向荣请苏省充饷漕米折银转运，并苏、常捐局仿八折收捐。下户部妥速议。江苏上海匪徒滋事，戕署知县袁祖德。谕怡良等捕治之。庚子，准苏将各属捐项典本及各州县收捐银钱，并征存漕米折银，均充军饷。辛丑，川沙、嘉定，匪徒滋事，失守。壬寅，土匪陷上海、川沙四厅县。
九月丁未，剿办松江等府属土匪，复青浦、宝山、嘉定。仍饬许乃钊督克川沙、南汇等城。戊申，以军务未竣，允缓办丰北大工。自是六年，河漫流丰沛，如故。甲寅，复江苏南汇县城。庚午，复江苏川沙厅城。
十月壬申朔，江南河道总督杨以增奏，复堵丰工，上年借拨银一百八十万两。戊子，谕催许乃钊迅复上海。庚寅，吉尔杭阿署江苏按察使。辛卯，命福济催运淮北票盐。壬辰，怡良等奏：淮南盐务拟请改办就场征税，并江路不靖，改道运销。下户部速议。
十一月乙巳，调赴江南等处马二千数百匹，候军务完竣，再酌量议裁。丙午，谕江南、江北士民，如能破贼克城，歼擒逆首，倡义之人优予爵赏，余破格施恩，应完钱粮免征三年。庚申，命和春由徐州进剿。乙丑，命筹江苏新漕海运。是月，蠲减江苏川沙等四十三厅州县被扰、被水地方额赋。展缓两淮富安等十四场灶地水灾新旧额赋。
十二月壬申，福济奏安徽军饷支绌，请将淮北应征正杂盐课，尽数拨解。允之。乙亥，以江南逆匪肆出滋扰，向荣未能急攻金陵，上严旨督责之。丙戌，杨以增请提淮安府属新漕，接济兵食。交户部查议。设江南大营粮台总局于苏州。辛卯，浚江苏白茆等河港，移建石闸。壬辰，杨能格署江宁布政使。丁酉，杨以增兼署漕运总督。
四年正月癸卯，谕催叶名琛选调拖罟快蟹船只，速赴江南协剿。己酉，怡良奏淮盐现办旧场征课、难依限如额及尽征尽解情形。交户部议。壬子，麟桂为江苏布致使。己未，谕淮北盐务仍归福济经理，实力督销。辛酉，琦善收复扬州，进攻瓜州。甲子，谕：上海围攻数日，洋人掣肘，何竟无策？着怡良督饬进攻。吴其泰为江苏按察使。己巳，以办团出力，得保危城，免江苏六合县一年钱、漕。加增学额，以绅董堵剿出力。
二月己卯，许乃钊奏江苏接济金陵军饷未能悬定。谕切责之。谕怡良等：上海连日获胜，何以围攻未能歼灭，且以洋人掣肘为词。着赶紧克复。戊子，以贼氛逼近徐州，扰及永城、夏邑，谕琦善等拨兵会剿。丙申，怡良奏，俄罗斯船复至上海，即行回驶。是月，赈江苏邳州等五州县被水灾民。
三月辛丑，命前江南河督潘锡恩办理宁国等属防剿事宜。甲辰，杨以增奏请饬扬、徐、海三属迅收已征钱漕、盐课，解江北大营，接济军饷。允之。吉尔杭阿为江苏布政使。怡良等奏：苏、松等属漕米势难起运，请仍照部议改收折色。又奏苏、松等属采买海运章程。交户部议。丁未，以守城出力，永广江苏六合县学额二名。庚戌，允江苏漕粮改办折色，采购米石，迅运天津。辛亥，许乃钊为江苏巡抚。戊午，允杨能格署江宁布政使。辛酉，许乃钊奏：英人烧毁上海官兵营盘，设法羁縻。谕：不可滋生事端，督吴健彰等设法控制。壬戌，劝谕绅董筹办。以扬州各属逢灾赈，去年本有一文愿之法，无论绅民商贾均行出捐，以救暂时之急。本年逆氛不靖，各乡绅富大约皆捐军需，各村镇自行团练防堵，所费又属不少，为时过久，未便再令续捐，令摊只捐大行铺户，不令住户捐厘，以纾民力。
四月辛未，谕徐州兵勇由徐州支应，宿迁防兵归文煜支应。己卯，移宿迁粮台于扬州。
五月辛酉，向荣奏花旗国船到江宁，初七日回驶昆山。
六月戊辰朔，拨淮安关银四万两解往南河工需。向荣、怡良等奏：淮南盐引滞销，请免奏销。又淮北盐引滞销，请停减代纳淮南盐课。均交部议。庚辰，命吉尔杭阿为江苏巡抚、陶恩培为江苏布政使。以英、美兵船往镇江、江宁，与逆匪相见，并阻挠围攻上海，显违成约。谕叶名琛向英、美、法各使晓以利害，责守成约，不得任意游驶。甲申，苏松太道吴建彰通夷养贼，革职拿问。裁江南河库、道库大使员缺。雷以諴奏江苏海口新淤滩口招垦升科。戊子，江苏海、通白粮扫数运津。
七月戊午，谕叶名琛饬红单等船迅赴江南。
闰七月丙子，江宁将军苏布通阿奏收集驻防兵丁，随营攻剿。允之。贼窜扰江苏东坝，官军击退之。丁丑，命托明阿为钦差大臣，督办扬州军务。庚辰，江南将军克复高淳县城，东坝肃清。乙未，调福建兵一千名赴江南军营。丙申，江南军克太平及江宁镇。江南大军克复金陵、镇江等处，连战皆捷。
八月戊戌，谕叶名琛等筹解江南军营饷需。己亥，以苏省浮收勒折、漕务日坏，谕邵灿往苏州认真督催。戊午，谕怡良等拨淮北盐课接济安徽军营。
九月戊寅，赏雷以諴三品顶戴，为江苏布政使，仍留扬州军营帮办军务。丙戌，以邵灿等奏，谕责成署江宁布政使。何俊督办淮安行钞铸钱捐事宜。戊子，怡良等奏淮北癸丑新纲开办章程，并停办坝盐官运。交户部议。
十月甲辰，谕淮北开纲征课各事宜，责成怡良办理，并令福济、袁甲三督饬严拿私贩，筹划疏销。戊午，和春等奏：“淮北盐课专资军饷，请无庸拨解河工。”交户部速议。
十一月丁卯，谕广东、江西筹济江南大营军饷。是月，展缓两淮富安等十四场被水灶地新旧额赋。
十二月戊戌，谕江苏巡抚吉尔杭阿：上海城垣未攻克，佛兰西提督辣尼尔犁毁贼炮堤，是该夷与逆匪衅隙已成，该抚务饬兵克日进攻，限年内攻克。己酉，以江南军营饷项支绌，谕怡良等于江南浒墅关税及闽省海关税银每月各拨二万两。是月，缓征江苏川抄等五十一厅州县本年漕粮，给江苏邳州等五州县并徐州等二卫被水灾民口粮有差。
五年正月甲戌，命怡良整顿淮北盐务，福济协同督销。丙子，命恰良等迅拨淮北盐课接济江苏扬营军饷。
三月甲戌，以户部奏，谕江苏速解海运经费。戊子，浙江、江苏海运漕船在石岛被劫，谕搜剿洋匪并妥护漕船。
四月甲辰，命丁忧在籍侍郎潘曾莹办理江苏团练事宜。
五月戊辰，崇恩请饬江南水师挑选战船，至石岛押护漕船。允之。壬午，展江南乙卯科文武乡试至戊午科归并举行。是月，蠲免江苏横浦等场被贼灶户额赋。
七月己巳，江南水陆官军击贼，大胜之，克复芜湖。
九月甲子，缓塞丰北决口。乙丑，催广东增雇红单船赴江南协剿。