丙戌（二十一日），命固山额真刘之源、佟图赖为定南将军，驻防宝庆；固山额真墨尔根侍卫李国翰为定西将军，驻防汉中。
丁亥（二十二日），命平西王吴三桂自锦州移镇汉中。
辛卯（二十六日），凤阳巡抚陈之龙奏：“自金逆之叛，沿海一带与舟山之寇止隔一水，故密差中军各将稽察奸细，擒到伪总督黄毓祺并家人袁五，搜获铜铸伪关防一颗、反诗一本；供出江北富党薛继周等、江南王觉生、钱谦益、许念元等，见在密咨拏缉’。得旨：“黄毓祺，着正法。其江北窝贼薛继周等、江南逆贼王觉生、钱谦益、许念元等，着马国柱严饬该管官访拏。袁五，着一并究拟”。
癸巳（二十八日），故明宗姓朱履祧讹言倡乱，被获伏诛。
闺四月乙未朔，湖川总督罗绣锦奏：“兴国逆贼刘大刀与伪总督鲍瑞玉合谋为乱，游击张国忠等分兵进剿，阵斩瑞玉；擒伪副将彭守轨、推官钱居清、同知钱应统等十人斩之，并获伪札、关防、马匹、器械”。
壬寅（初八日），湖广提督柯永盛奏：“伪总兵萧相国、伪都司徐云从於蕲水纠众倡乱，千总鄂效鹏等进剿，擒相国等”。
癸卯（初九日），以李国英为右副都御史，巡抚四川（由署巡抚总兵官迁）。
乙卯（二十一日），平西王吴三桂赴汉中戍守。
己未（二十五日），以迟日益为右副都御史，巡抚湖广（由右布政使迁）。
五月癸未（十九日），以朱延庆为右佥都御史，巡抚江西（由浙江嘉湖道参政迁）。
甲申（二十日），江南江西河南总督马国柱奏：官兵大破金逆，复九江、饶州等府。
丁亥（二十三日），命浙江总督移驻衢州。
秋七月庚寅（二十七日），浙江巡抚萧起元奏：“擒获衢州贼魁赵之超，招抚临安县贼渠高自生等千余人”。
八月癸巳朔，南赣巡抚刘武元奏：“江西逆赋金声桓、王得仁等拥众二十余万直犯赣界，围城三月；官兵誓死决战，杀贼万余，遗孽望风奔窜，重围顿解”。
己亥（初七日），浙闽总督陈锦奏：“海逆郑彩等连〈舟宗〉千余，盘踞长乐、连江等县；总统部臣陈泰、李率泰分兵夹击，尽驱出海，长、连二县次第恢复。又统师直入兴化，生擒贼渠伪总督顾世臣等十二人，斩之；兴化荡平”。
壬寅（初十日），授投诚唐通、左梦庚、郑芝龙、董学礼、许定国子尔安为一等精奇尼哈番，刘良佐为二等精奇尼哈番，刘泽清、李本深为三等精奇尼哈番，张天福、刘进忠为一等阿思哈尼哈番，张国柱为二等阿思哈尼哈番，张大元、赵之龙、李朝云、韩文、郑家栋、刘麟图、许得功为三等阿思哈尼哈番，余授职有差。
乙卯（二十三日），以张学圣为右佥都御史，巡抚福建（由浙江督粮道参议迁）。
九月壬戌朔，江西巡抚王志佐奏：“伪巡抚吴江、伪兵部尚书余应桂等久聚南康、湖口，党恶助逆；遣游击李文玉进剿，江等就擒”。命斩之。
壬申（十一日），命郑亲王济尔哈朗为定远大将军，统兵讨湖广逆贼李锦、马进忠。
己丑（二十八日），孔有德等班师。
冬十月壬寅（十一日），偏沅巡抚线缙奏：定南将军固山额真佟图赖复宝庆。
丙辰（二十五日），刘泽清句连曹县叛贼谋为不轨事觉，泽清并弟、侄及贼渠李洪基、李化鲸皆伏诛。
十一月甲子（初四日），江南江西河南总督马国柱奏：“广贼李成栋妄称惠国公，始踞南雄、继而句连峒蛮土寇号称百万，直犯赣城；抚臣刘武元、总兵官胡有陞大败之，成栋单骑走，斩首万余级，俘获无算”。得旨褎奖，从优叙赉。
丙寅（初六日），陕西巡抚黄尔性奏：“逆贼贺珍等谋欲渡江截漕，兴安总兵官任珍击走之，生擒贼渠李应全等，斩获无算”。下所司察叙。
十二月辛亥（二十一日），南赣巡抚刘武元奏：“副将刘伯禄等攻破鱼骨等寨，擒斩伪军门刘志谕并伪副将、参将、游击等二十余名；参将栗养志等攻破连花等寨，俘其伪滋阳王妃孔氏，并擒剿伪都督叶南枝等；游击鲍虎等又大败贼兵於土桥，擒斩伪军门刘飞等”。下所司察叙。
壬子（二十二日），江南江西河南总督马国柱奏：“副将杨捷等复都昌，生擒贼渠伪兵部尚书余应桂”。命斩之。
顺治六年己丑（一六四九）春正月壬戌（初三日），浙闽总督陈锦奏：‘福州总兵张应梦复罗源县，右路总兵马得功复永春、德化二县，擒伪总师颜昌儒等，平三百余寨”。
乙丑（初六日），江南江西河南总督马国柱奏：“舟山伪佥都严我公率知府许珖等投诚，兼献进剿机宜，愿充乡导”。下兵部议。
壬申（十三日），四川巡抚李国英奏：“伪逆李廷明犯剑州，章京项友功、黄世仁等往剿；至毛蛇沟、板桥坝等处，贼逆战，奋击大破之，追杀二十余里，生擒伪将三员，斩首二百余级”。
辛巳（二十二日），以金廷献为右佥都御史，巡抚偏沅（由御史迁）。
壬午（二十三日），征南大将军固山额真谭泰、固山额真何洛会等奏：“官兵於去年七月初十日薄南昌府城下，围困贼兵。至本年正月十八日，固山额真何洛会领护军参领喀尔他喇、署甲喇章京根特巴图鲁至城南，竖云梯进攻。十九日午後，蒙古固山兵先登，叛贼金声桓中二矢，投水死，仍磔屍示众；生擒王得仁，正法。贼党尽歼，南昌、九江、南康、瑞州、临江、袁州等府俱平”。下兵部察叙。
丙戌（二十七日），四川巡抚李国英奏：“叛将王基城旧部林时泰等，前杀基成来降；臣是以待之不疑，令分防中江、潼川、射洪等处。时泰等屡次乞粮，臣以非额设，未给；遂据城噪叛，杀死射洪知县杨于朝。臣遣副将曹纯忠、游击惠成杰等分兵攻剿，斩获无算，时泰等俱溃遁”。得旨：“林时泰，着严行剿捕，毋致逋诛”。
二月辛亥（二十二日），平西王吴三桂等奏：“伪王朱森釜、伪定远侯赵荣贵率贼万余犯阶州，臣等前後分击，杀贼七千有余，阵斩森釜、荣贵，获伪侯印一颗、伪总兵印十颗及马骡、金银等物”。下所司议叙。
戊午（二十九日），川湖总督罗绣锦奏：辰常总兵官马蛟麟剿张逆於黄茅田，大破之。
三月甲戌（十五日），川湖总督罗绣锦奏：“总兵官马蛟麟阵擒贼渠舒有朝等”。下部察叙。
戊寅（十九日），浙闽总督陈锦奏：“福清等二十县士民同心效死守城，忠义可嘉！请免本年丁徭，以示鼓励”。奏下部议。
辛巳（二十二日），江南江西河南总督马国柱奏：“楚贼突犯霍山，把总韩明秀、守备徐志高赴敌，死之”。
甲申（二十五日），征南大将军固山额真谭泰、何洛会等奏：“大兵至南安，侦逆贼李成栋窃据信丰、伪兖国公窃据南康；遣兵先破伪兖国公，歼除殆尽。继抵信丰，前後合围。逃出之人报云：‘贼谋夜遁，梅勒章京觉善等遂竖梯攻克其城。贼溃散渡河，署梅勒章京宜尔格德等督兵追剿，李成栋溺水死’。随令护军统领伊尔德等平定抚州、建昌两府，复破伪总兵杨奇盛兵二千有奇；擒斩渠魁，扑灭余孽，江西悉平”。下所司议叙。
丙戌（二十七日），平西王吴三桂等奏：“大兵抵秦，克复宜君、同官二县，击败逆贼王永强等，斩首七千余级，获驼马四百五十余匹”。下部察叙。
夏四月丙申（初八日），陕西巡抚黄尔性奏：“平西王吴三桂等克蒲县，诛逆寇王永强所设伪官，余党悉平”。
癸卯（十五日），福建巡按霍达奏：官兵复平和、诏安、漳平、宁洋四县。