秋七月丁卯（初八日），命内大臣达素为安南将军，同固山额真索洪、护军统领赖塔等统领官兵征剿‘海逆’郑成功。
戊辰（初九日），故明废宗朱义盛谋反，并其党舒瑛、张定之、李勇士、李赞美、谭武周、陈国辅、魏名观、徐介石俱伏诛。
丙子（十七日），‘海寇’犯江南省城。
庚辰（二十一日），漕运总督亢得时闻‘海寇’入犯江宁，出师高邮，自溺死。
壬午（二十三日），授伪德安侯狄三品为抒诚侯、伪总兵冯万保为都督同知，以擒伪王冯双礼来献故也。
八月己丑朔，江南总督郎廷佐奏：“海寇自陷镇江，势愈猖獗。於六月二十六日偪犯江宁，城大兵单，难於守御。幸贵州凯旋梅勒章京噶褚哈、马尔赛等统满兵从荆州乘船回京，闻贼犯江宁，星夜疾抵江宁。臣同驻防昂邦章京喀喀木、梅勒章京噶褚哈等密商，乘贼船尚未齐集，当先击其先到之船。喀喀木、噶褚哈等发满兵乘船二十艘，於六月三十日两路出剿，击败贼众，斩级颇多，获船二十艘、印二颗。至七月十二日，逆渠郑成功亲拥战舰数千、贼众十余万登陆，攻犯江宁。城外连下八十三营，络绎不绝；安设大炮地雷、密布云梯、复造木栅，思欲久困。又於上江、下江以及江北等处分布贼艘，阻截要路。臣与喀喀木等昼夜固守，以待援兵协剿。至七月十五日，苏松水师总兵官梁化凤亲统马步官兵三千余名至江宁；又抚臣蒋国柱调发苏松提督标下游击徐登第领马步兵三百名、金山营参将张国俊领马步兵一千名、水师右营守备王大成领马步兵一百五十名、驻防杭州协领牙他里等领官兵五百名，俱抵江宁。臣等公议：贼今分兵偪城，立三营於仪凤、锺阜二门外，当先击之。随於七月二十三日派满兵堵贼诸营，防其应援；遂发总督、提督两标绿营官兵并梁化凤标营官兵，从仪凤、锺阜二门出剿。贼踞木栅，并力迎敌，我军各将领奋不顾身，冒险先登。鏖战良久，阵擒伪总统余新，并斩伪总兵二员，击死贼众无算。至晚收军，臣等又公议：满洲绿旗官兵悉出击贼；恐城内空虚，留臣守城。其喀喀木、噶褚哈、马尔赛、梁化凤等由陆路进，汉兵提督管效忠、协领扎尔布、巴图鲁、费雅住巴图鲁、臣标副将冯武卿等由水路进。各统官兵，次日五鼓齐出；贼已离营屯紮高山，摆设挨牌火炮，列阵迎敌。我兵自下仰攻，鏖战多时，贼始大败；生擒伪提督甘辉并伪总兵等官，阵斩贼众不计其数，烧毁贼艘五百余只，余孽顺流败遁。喀喀木、噶褚哈等复领水、陆两路官兵疾追至镇江瓜州，诸贼闻风，乘舟而遁。大军於二十八日回江宁”。得旨：“据奏满、汉官兵奋勇，水陆并进，擒剿逆寇甚多，克奏大捷，深可喜悦！着该部从优议叙具奏”。
癸巳（初五日），命固山额真刘之源为镇海大将军，同梅勒章京张元勳、周继新领官属兵丁驻防镇江。
以蔡士英为兵部左侍郎兼左副都御史，总督漕运、巡抚凤阳（原任漕运总督）；调宜永贵为兵部左侍郎兼右副都御史，提督操江、巡抚安徽（由福建巡抚调）。
甲午（初六日），四川巡抚高民瞻奏：“臣统率弁兵进取成都，逆贼闻风逃遁；追至新津河，阵斩及溺死无算。伪官俱缴印投诚，川西底定”。命所司察叙。
丙申（初八日），经略大学士洪承畴奏：“安南国都将太傅宗国公武公恣遣使纳款”。报闻。
庚子（十二日），安南将军固山额真明安达礼等奏：“臣等自荆州赴援江宁，八月初七日至荻港，闻贼乘船千余艘赴江宁，泊三山峡。随分兵前进，至旧县地方，伪都督杨文英等於扬子江港口迎战。我兵击败之，擒斩伪副将一，获船只、器械甚多”。下所司议叙。
甲辰（十六日），江宁巡抚蒋国柱奏：“逆寇郑成功自江宁败遁南下，复犯崇明；游击刘国玉等击败之，贼俱南遁”。下所司察叙。
乙卯（二十七日），逮江宁巡抚蒋国柱至京勘问；以海贼犯京口，国柱同提督管效忠败绩也。
九月己未朔，江宁巡抚蒋国柱奏：“镇江失守时，文官知府戴可进等六员、武官副将高谦等十四员皆失身从逆，独巡江营守备罗明昇守谭家洲阵亡，应从优恤”。下所司察议。
庚申（初二日），免浙江台州府四年至十二年寇劫仓库税粮。
壬戌（初四日），川陕总督李国英奏：“收复嘉定一路，招降伪将军杨国明、总兵武国用，各州县伪官皆缴印投诚”。
冬十月丁酉（初十日），江南苏松巡按马腾陞奏：“前因京口夫守，特遣固山额真驻防镇江，诚虑之周也。而臣窃以为有不便者三：镇江之民疮痍未复，传闻大军驻紮，惶惧窜徙。若果兵临，势必侵扰，民何能安？且恐满兵骄悍成习，即号令有不能施：不便者一。以重兵驻防京口者，御海寇也。必须修备战艘、练习水师；此非满兵所长：不便者二。用兵之道，将有号令、兵有纪律；事权归一，兵力自优。何必设此无统摄之满兵株守一城，以虚糜兵饷？不便者三。臣为要地起见，为万民请命，不得不为皇上痛陈之”。得旨：“京口要地，向因防兵单弱，致海逆入寇失陷；故特遣满兵驻防。马腾陞乃云‘未能御寇，辄先扰民’。前贼至之日，镇江阖城从贼，理应诛戮；免其追究，已属法外之仁。今遣兵驻防，原以为民；何为反云扰民？征剿寇盗、平定地方，皆满兵之力；何云满兵骄悍成习？设防之兵，当水陆兼备；江宁大捷，亦由陆兵力战败贼。何云非满兵所长？驻防之兵，该固山额真自能统摄；如有寇警，该固山额真自当相机堵剿。何云无统摄之满兵株守一城，虚糜兵饷？镇江原有绿旗兵不能御贼，地方文官不能以一失加贼；马腾陞身为巡方，远避他府！今乃借口为地方起见，妄行条奏，沽名市恩；且马腾陞系何国之人？乃称满兵骄悍成习，是何意见？着作速明白回奏”。
己酉（二十二日），谕吏、兵二部：“云南远徼重地，久遭寇乱，民罹水火，朕心不忍。故特遣大军，用行吊伐。今新经平定，必文武各官同心料理，始能休养残黎、辑宁疆圉。至统辖文武军民，尤不可以乏人；前已有旨命平西王吴三桂移镇云南。今思该藩忠勤素着、练达有为，足胜此任。当兹地方初定之时，凡该省文武官贤否甄别举劾、民间利害因革兴除及兵部钱粮一切事务，俱暂着该藩总管奏请施行。内外各该衙门不得掣肘，庶责任既专、事权归一，文武同心，共图策励，事无遗误，地方早享昇平，称朕戡乱柔远至意。俟数年後，该省大定，仍照旧令各官管理。其应行事宜，尔等即行议奏”。
庚戌（二十三日），经略洪承畴以目疾乞休。得旨：“卿久任岩疆，劳绩茂着。今滇、黔初辟，正资弹压料理。览奏，目昏衰老，深轸朕怀！特准解任，回京调理”。
十一月丙戌（二十九日），平西王吴三桂等奏：“大军取沅江，阵歼土司那松、伪将军高应凤等”。下所司议叙。
十二月己丑（初三日），江南江西总督郎廷佐奏：“伪总督陈九思乘海寇内犯，率党金晓等攻劫浮梁等处；我军击败之，九思投诚”。
丙午（二十日），两广总督李栖凤奏：安南都统使莫敬耀投诚。
辛亥（二十五日），以击败‘海寇’功，授苏松水师总兵官梁化凤三等阿达哈哈番，仍加左都督、太子太保。
壬子（二十六日），谕兵部：“靖南王耿继茂，久镇东粤，劳绩素着。今又自请移镇、效力疆埸，忠志可嘉！着移驻广西。广西提督线国安，着带领所统兵士来京另用”。
顺治十七年庚子（一六六○）春正月庚申（初四日），论江南、浙江失陷城池各官罪，江南提督马逢知等解任、罚俸有差。
二月丙戌朔，平西王吴三桂奏：“伪侯吴子圣、伯廖鱼、陈建、将军杨武、杨国明、刘启明、总兵郝承裔等，各率所部投诚”。
戊子（初三日），平西王吴三桂奏：官兵大破贼於普洱。下所司察叙。
三月辛未（十六日），兵部以‘海寇’攻陷镇江，巡抚蒋国柱、提督管效忠等败绩遁走，分别定议。奏上，得旨：“蒋国柱免死，革职，与本王下为奴；管效忠免死，革提督并世职，鞭一百，发包衣下辛者库为奴：俱籍没家产。协领费雅柱巴图鲁、扎尔布巴图鲁俱革世职，立绞，籍没。牛录章京喀福纳、查都、拖辉、布颜、希佛讷俱革职，免死，鞭一百，籍没为奴”。
甲戌（十九日），以袁懋功为兵部左侍郎兼右副都御史，巡抚云南兼建昌毕节等处地方。
己卯（二十四日），吏、兵二部会奏：“据驻防江宁总管喀喀木等咨称：‘操江巡抚朱衣助於失陷瓜州後降贼，遣家人朱镇等四人持号布至江宁接取家口’。今研审朱衣助，供云：‘原领兵赴援瓜州，与贼对敌；兵败被擒，後复逃回’。但衣助身膺巡抚重任，不能固守地方，以致失陷城池；虽旋即逃回，亦难辞咎。应革职，送刑部议罪”。得旨：“朱衣助情罪未经审明，止据本人口供；草率具奏，甚属不合！着再行严加详审，确议具奏”。
壬午（二十七日），川陕总督李国英奏：“官兵进剿下川东贼寇，生擒伪总兵谭益，阵斩伪总兵陈贵策、高鹤鸣、伪监军道王文锦、张耀等，余党悉平”。