明年（己亥）五月，复出崇明入江。抵京口、夺瓜洲、围镇江，大军分五路叠垒而阵。成功令周麾传炮，金鼓震作，与江声相沸腾；士卒皆下马殊死战。郡中惧，走降相继；属邑皆下。部将甘辉进曰：“断瓜洲，则山东之师可扼；据北固，则两浙之路不通。但须坐镇于此，南都可不劳而定也”。弗纳。竟薄金陵，至观音门。已而登陆，屯岳庙山；轻敌不备，纵酒为欢。煌言与辉并苦谏，以严城师老，猝不得拔，必生中变；复不纳。久之，大军由仪凤门穴城出，衔枚疾走，直捣中坚；别以骑兵数万绕出山后，夹攻之。遂大溃，诸将北走不相顾。甘辉以数骑奔江口，被执死之。成功急麾兵退，以舟遯。及崇明，攻之不下；弃而归。冬十月还岛，痛哭甘辉而后入；曰：“试从其言不及此”！令立庙旌其忠。时煌言先已自领所部由芜湖进取徽、宁诸路也。
庚子夏，王师进讨，以广东降将为导；大小数阵，杀伤相当。洎战海上，我军不谙海性，晕眩不能成列；成功手自搴旗。风吼涛涌，我军退，多陷于淖。将军达素者自杀。
辛丑，成功议夺台湾。台湾强富为四省之要，袤延三千里。初，芝龙与群盔出没其间，后为红夷所踞。成功自江南败归，势渐蹙；亟思拓地。三月，以百艘泊澎湖，次鹿耳门。向维水浅沙胶，必纡折数四始拢岸；至是，潮水骤涨高丈余，扬帆直达。夷人惊怖莫措，遂克赤嵌城，进逼王城。城为荷兰所居，久不下。冬十月，我朝弃芝龙于柴市，郑氏子孙之在京者无少长皆伏法。十二月，成功悉力攻荷兰城，曰：“斯为先人故土，所志在城；余仍以归汝”！荷兰乃出降。成功既克台湾，即以安平镇名之；制法律、定职官、兴学校、修武备，大起池馆，延纳名流。以赤嵌城为承天府，县曰天兴、万年。成功扰乱海疆，迄于僭立，凡十七载。康熙元年（壬寅）五月，卒；年三十有九。台人以其弟袭为代。
时长子经出守厦门；讣至，经自称“招讨大将军”，嗣立。我帅靖南王耿继茂、总督李率泰遣人持书招之，经请如朝鲜例；不报。是冬，台人谋奉袭拒经。经领兵克之，遂入台。癸未，永明王终；而经犹奉永历之号。既而，王师南征逼两岛，两岛之民烂焉。
至七年（戊申），诏大臣明珠、蔡毓荣赴漳，檄兴化知府慕天颜往抚之；经仍以朝鲜事例为请。后吴三桂据滇、黔、巴蜀以叛，耿精忠亦以闽叛。精忠先与经交恶，常从漳、泉间相劫杀；旋复和。王师屡出，剿抚并加，不逊。十四年（乙卯），经据有泉、潮、漳、韶、惠、汀、兴、邵八郡地。又三年，安溪乡官李光地以蜡书上剿寇事宜。寻王师战于龙虎山，斩首四千级，掳获千二百人，亡溺者以万数。
及二十年（辛酉）六月，经卒。长子克■〈臧上土下〉嗣，伪称监国，实非郑氏出；经母董即收杀之，以次子克塽嗣。诸地侵削，两岛亦覆；仅守台湾以处。
越二年夏，王师发铜山，抵澎湖。澎湖水故咸，师至味忽甘。鏖战十数阵，战舰被焚者数百，甲士死伤者无算。克塽势不支，决计纳款；遣其将刘国昌、冯锡珪等赍延平王招讨大将军金印各一、公侯伯及将军都督银印五，籍土地、户口、府库、军实诣军门降。时康熙二十二年癸亥秋七月也。克塽入都，归汉军，授公爵。郑氏自成功迄此凡三世，窃据三十八年。自是，海宇悉平。
“摭遗”曰：澎湖之水，于郑氏亦异矣哉！水涨则兴，水甘则亡。成功内寇，于岳庙卜；有羽士以珓词示之曰：“青海到门宏大业，白波回味起重城”。噫！即此僭随机数十年，亦神乎其兆矣。台湾旧无城，惟红毛城在西南角，为荷兰所居；郑氏之故宫在焉。国朝因之，特设郡县。北园及海会寺，皆其别馆，以留待宾客者。澎湖为台海门户，鹿耳门则台湾海之咽喉也。当成功时，有辽王之后术桂者称宁静王，渡海来依；驻澎湖口。既败，术桂以王印授塽，投缳死。其妾五人袁氏、王氏、秀姑、荷姐、梅姐，俱从缢。塽既投诚受爵，于庚辰春乞归葬其祖与父；许之。于是成功及经之丧，得归葬南安。
“摭遗”补曰：台湾自生民来，不通上国。迨崇祯时，芝龙为盗，始屯聚于此；既而受前明招抚之命，又弃之。及丙戌芝龙降于我朝，其子成功不从，聚其故部，据有厦门、金门二岛，以侵轶中土。己亥大举，自江宁败归，始取台湾定为老巢，而往来二岛间为窥衅计。
壬寅，成功殁；其诸将如施烺、黄梧等先已降于我。至二岛既平，成功子经遁入台湾；兵不及万、船不满百，势稍衰。康熙十有二年，三藩难作，靖南王耿精忠反于福建；次年，始乞师于郑氏。台人大喜，亟渡海而西。闽中故皆郑氏恩旧，精忠之海澄总兵赵得胜首约同官刘国轩等皆附于经；精忠始惧。经遣人说精忠借漳、泉二府以治兵，精忠难之。经怒，遽取泉州，南取广之潮州。次年，又败漳州；精忠大惧。吴三桂累为精忠请，令画枫亭之界守之；然不获成。至十六三桂令尚之信割惠州赂经，重申盟。然郑氏不旋踵取汀州，复大振；精忠势失，乃归朝。至十六年，王师收复邵武、兴此、漳、泉之地；经遁入厦门。其潮州守将刘进忠亦出降，经遂弃惠州去。明年春，郑氏复出，沿海洲堡连下十数处。时其骁将曰刘国轩、曰吴淑、曰何佑，而国轩尤竞。于是总督郎廷相檄调官军四路合剿，大战兼旬；提督段应举战于祖山，大败，奔入海澄。国轩取平和，还围海澄；断堑环桩，飞鸟莫能度。沿海之士，从者如云。至夏六月，海澄食尽。城陷，应举自缢死之；官军失陷三万余丁、马万余匹。国轩乘胜，复下漳平、长泰、同安，略取南安、惠安、安溪、永春、德化诸邑。
秋七月，围泉州，号称十万。至九月，始解泉州围而力致漳州；郑氏乃大会二十八镇兵为十九寨，列烽相望。国轩以十七镇精兵三万军于西，吴淑、何佑以十一镇精兵二万军于南，请与大兵战于龙虎、蜈蚣二山之间，声势寖大。官军中馁，累战不利。久之，恃胜兵骄；而制军姚启圣善调度，密饬诸将出不意奋击之，连破十六营，士卒死伤以万计。国轩泅水遁，奔还海澄；官军遂复长泰、同安。是冬议抚，制军遣中书舍人张雄入厦门说之；经不从。既而，用间言散郑氏大将及五镇兵。十九年正月，官军逼海坛，郑氏戈船将朱天贵叛降；即用之，尽破水师十九寨。国轩茫然失恃，遂弃海澄入厦门。追兵逼之，国轩复弃厦门、金门，奉经入台湾。其时成功之妻董氏尚在堂，数经曰：“汝父之业衰矣。汝辈不才之子，其更无往也”！初，闽人当成功之世，内输官赋、外又竭应郑氏之饷，岁以为常。奸民因而盗窃，日出事滋。于是有迁界之议：定沿海之界而迁之域内，出界者死。被迁之民，流离荡析，又尽失海上鱼蜃之利，而闽益贫。已而耿、郑之乱交作，杀掠所至，不知谁兵。闽中驻一王、一贝子、一公、一伯，将军都统以下各开幕府。所将皆禁旅，无所得居，则以民屋居之；无所得器械，即以屋中之器械供之；无所得役，即以屋中之民役之。朋淫其妻女、系其老幼，喑哑叱咤；稍不如意，棰楚横至，日有死者。加以饥馑，而民之存者寡矣。及郑氏奔入海澄，耿精忠奉诏入京，界始复开，而民困少苏。时郑经有嬖人施亥者，制军密招之，令擒经以自归；事泄。会经死，嗣子克塽年少，其行人傅为霖通于我将，联续顺公沉瑞以覆郑氏。续顺公者，先为明将，名志祥，自辽左来归；已有“恭顺”、“怀顺”、“智顺”三王之号，故号以“续顺”。其后镇闽，移粤。耿逆时，并其军，迁之饶平。郑氏攻饶平而获之，遂以入台。乃与官军通，密纠十一镇同日发难。