那知桓玄虽死，诸桓各窜，桓谦匿沮泽中，桓振匿华容浦，各集余党，伺隙而动。探得东军未至，城内无备，乘夜来袭，逆党在内者从而应之，斩关而入，江陵复陷，王腾之等皆遇害。
桓振见帝于行宫，跃马横戈，直至阶下，瞋目向帝曰：“臣门户何负国家，而屠灭若是？”帝弟德文下座谓曰：“此岂我兄弟意耶？”振欲杀帝。桓谦苦止之，乃下马敛容，再拜而出。
明日遂奉玺绶还帝曰：“主上法尧禅舜，今楚祚不终，复归于晋矣。”复晋年号，振为都督大将军、荆州刺史；谦为侍中左卫将军，招集旧旅，附者四应。无忌等间江陵复陷，大怒，星夜进兵，攻桓谦于马头，破之。欲乘胜势，即趣江陵。道规止之曰：“兵法屈伸有时，不可轻进。诸桓世居西楚，群小竭力，桓振勇冠三军，难与争锋。今桓谦败，彼益致死于我，未易克也。且暂息兵养锐，徐以计策縻之，庶无一失。”无忌曰：“残寇遗孽，一举可荡，君何怯焉？”遂进兵。桓振逆战于灵溪，分兵为左右翼，中军严守不动，及战急，亲率敢死士八百，从中冲出，忽下马，各执短刀奋砍，东军不能支，遂大败，死者千余人。无忌等仍退保寻阳，上笺请罪。
先是，裕命敬宣为诸军后援，敬宣缮甲治兵，聚粮蓄财，日夜不怠，故无忌等虽败退，赖以复振。停兵数旬，复自寻阳西上。至夏口，有兵守险不得前。时振遣其将冯该扼东岸，盂山图据鲁山城，桓仙客守候月垒，众合万人，水陆相援，毅与道规分兵向之，毅攻鲁山城，道规攻偃月垒，无忌以中军遏于中流，自辰至午，二城皆溃，生擒山图、仙客，进薄东岸，冯该之师亦溃。先是毅恐江陵难下，致书于南阳太守鲁宗之曰：“贼徒虽败，尚据坚城，请举南阳之兵以袭其后，首尾共击，庶易成功。”宗之遂进兵，击冯该于柞溪，斩之。振闻宗之兵将至，谓桓谦曰：“东军来攻，兄暂坚守，勿与交锋，俟吾先破南阳之兵，然后归而击之。”说罢，潜师以出。毅探得振不在城，进兵围之，昼夜攻击，将士肉薄而登，谦不能拒，遂弃城走。桓振方与宗之相持，知城中危急，引军还救，而城已陷。宗之追击，振军亦溃逃于涢川，刘怀肃追新之。桓谦、桓蔚、何澹之俱奔秦，于是何无忌奉帝先还，毅及道规留屯夏口，经理荆、襄。甲午，帝至建康，百官诣阙待罪，诏令复职，大赦改元，惟桓氏一族不赦，以桓冲忠于王室，特宥其一孙继后。
却说殷仲文以丧乱之后，朝廷音乐未备，言于裕，请修治之。裕曰：“今不暇治，且性所不解。”仲文曰：“好之自解。”裕曰：“正以解则好之，故不求解耳。”仲文惭退。朝廷论建义功，进封裕为豫章郡公，毅为南平郡公，无忌为安城郡公，各领本职如故。余有功者，封赏有差。先是毅尝为北府从事，人或以雄杰许之。敬宣曰：“不然，夫非常之才，自有调度，岂得便以此君为人豪耶？此君外宽而内忌，自伐而尚人，若一旦遭遇，亦当以陵上取祸耳。”毅闻而恨之。至是裕以敬宣为江州刺史，毅言于裕曰：“敬宣不豫建义，猛将劳臣，方须叙报，如敬宣之比，宣令在后，若君不忘生平，正可为员外常侍耳。前日授郡，已为过优，今复命为江州，尤用骇惋。”敬宣闻而惧，因辞不就，乃迁为宣城内史。夏四月，裕请归藩，诏改授裕都督荆、司等十六州诸军事，移镇京口。
先是桓玄受禅，王谧为司徒，亲解安帝玺绶奉于玄。及领扬州，诸臣皆以为太优，毅尤不服。一日，帝赐宴朝堂，百僚皆集，论以重镇大臣，俨居首座。毅愤然作色曰：“前逆玄倡乱，天位下移，今幸王室重兴，吾侪得为大晋之臣，不至稽首贼廷，其荣多矣。”因问谧曰：“未识帝之玺绶今在何处？”谧默然，汗流夹背，惶愧无地，勉强终席而散。归至家，郁郁以死。临殁，请解扬州之任授裕。而毅不欲裕入辅政，议以谢混代之。遣尚书皮沈至京口告裕。沈先见刘穆之，具道朝议，穆之伪起如厕，密报裕曰：“皮沈之言，不可从也。”及沈见裕，裕令且退，呼穆之问之，穆之曰：“晋政久失，天命已移。明公兴复皇祚，勋高位重，今日形势，岂得居谦，常为守藩之将耶？刘、孟诸公，与公俱起布衣，共立大义，以取富贵，事有前后，故一时相推，非委体心服，宿定臣主之分也。力敌势均，终相吞噬。扬州根本所系，不可假人。前者以授王谧，事出权宜，今若复以他授，便尔受制于人。一失权柄，无由可得。今朝议如此，宜相酬答，必云在我，措辞又难。唯应云：“神州治本，宰辅至重。此事既大，非可悬论，便暂入朝，共尽同异。’公至京邑，彼此必不敢越公而授余人矣。”裕从之，使皮沈先返，己即表请入朝。朝廷共谕其意，即征裕领扬州，彔尚书事。
裕至建康，百僚无不畏服。一日，裕集群臣议曰：“自古安内者必攘外，昔南燕、后秦，利我有内难，侵夺我疆土。今内难虽平，而南乡等郡，尚为秦据，宿豫以北，尚为燕有，吾欲伐之，二者孰先？”朱龄石进曰：“后秦姚兴，颇慕仁义，以礼结之，其地自还。燕自慕容德亡后，子超嗣位，国内日乱可一举灭之。此时兵力未足，宜有待也。”裕从之，遣使修好于秦，且求南乡等郡，秦王兴许之。群臣咸以为不可，兴曰：“天下之善一也。刘裕拔起细微，能讨桓玄，兴复晋室，内厘庶政，外修封疆，吾何惜数郡，不以成其美乎？”因割南乡十二郡归于晋，于是秦、晋和好，终兴之世，裕不加伐。
却说南燕王慕容德，始仕于秦，为张掖太守。母公孙氏，兄慕容纳，皆居张掖。淮南之役，德从行坚入寇，留金刀与母别。谓母曰：“乱离之世，别易会难，母见金刀，如见儿也。”后同慕容垂举兵叛秦，秦收其兄纳及诸子，皆杀之，公孙氏以老获免。纳妻段氏方娠，系狱未决，段氏在狱，终日悲啼。一狱吏私语之曰：“夫人匆忧，吾当救汝出狱，与太夫人逃往他乡便了。”段氏曰：“尔系何人，乃能救我？”狱吏曰：“我姓呼延，名平，夫人家旧吏也。念故主之恩，愿挈家同往，以避此难。”段氏感谢。平先移家城外，接取公孙氏同往，然后乘间窃段氏出狱，逃于羌中。段氏受了惊恐，到未数日，即生一子，取名曰超。超年十岁，而公孙氏病。临卒，以金刀授超曰：“汝得东归，当以此刀还汝叔也。”超尝佩之，及姚氏代秦，平以其母子迁长安。俄而平卒，遗一女，段氏即娶为超妇。超既长，日夜思东归，恐为秦人所彔，乃佯狂、行乞以自污，人皆贱之。东平公符绍遇之途，奇其貌，询之，乃慕容超也。言于秦王兴曰：“慕容超姿干奇伟，殆非真狂。宜微加官爵以系之，勿使逃于他国。”兴乃召见之。超呆立不跪，左右命之拜，乃拜。与之语，故为谬对，或问而不答。兴笑曰：“妍皮不裹痴骨，徒妄语耳。”乃斥不用。
一日，超行长安市中，见有卖卜者，东人口声，向之问卜。卜者问其姓名，曰：“慕容超。”卜者熟视良久，舍卜，招之僻处，问曰：“子果慕客超耶？”曰：“然。”卜者笑曰：“吾觅子久矣！不意今日得遇，子于夜静来晤，吾有密事语子，万勿爽约。”超心讶之，别去。等至更深，来诣卜所。卜者迎门以候，见之大喜，邀入座定，乃语之曰：“吾实告子，我非卜者，乃南燕右丞吴辩也。奉燕王之命，特来访君。今既获见，便请同往，稍迟，恐有泄漏，不能脱身矣。”超因是不敢告其母、妻，辄随辩走，在路交易姓名，并无阻碍。
不一日，到了燕界，地方官先行奏知，燕王德闻其至，大喜，遣骑三百迎之。超至广固见德，以金刀献上。德见之，悲不自胜，与超相对恸哭。即封超为北海王，赐衣服车马无数，朝夕命侍左右，使参国政。盖德无子，欲以超为嗣也。越二载，德不豫，立超为太子。及卒，遗诏慕容钟，段宏为左右相，辅太子登极。
超既即位，厌为大臣所制，乃出钟宏等于外，引用私人公孙五楼等，内参政事。尚书令封孚谏曰：“钟，国之旧臣；宏，外戚重望，正应参翼百揆。今钟等出藩，五楼在内，臣窃未安。”超不听，于是佞幸日进，刑赏任意，朝政渐乱。
一日，念及母妻，惨然下泪。五楼曰：“陛下不乐者，得毋以太后在秦，未获侍奉乎？”超曰：“然。”五楼曰：“何不通使于秦，以重赂结之，启请太后归国也？”超曰：“谁堪使者？”五楼曰：“中书今韩范，与秦王有旧，若使之往，必得如志。”超乃遣范至秦，请归母妻。秦王兴曰：“昔符氏之败，太乐诸妓，皆入于燕。燕肯称藩送妓，或送吴口千人，乃可得也。”范归复命。超与群臣议之，段晖曰：“陛下嗣守社稷，不宜以私亲之故，辄降尊号。且太乐先代遗音，不可与也，不如掠吴口与之。”张华曰：“不可，侵掠邻邦，兵连祸结，此既能往，彼亦能来，非国家之福。陛下慈亲在念，岂可靳惜虚名，不为之降屈乎？”超乃遣范复聘于秦，称藩奉表，兴谓范曰：“联归燕主家属必矣。然今天时尚热，当俟秋凉，然后送归。”亦令韦宗聘于燕。宗至广固，欲令燕王北面受诏。段晖曰：“大燕七圣重光，奈何一日屈节？”超曰：“我为太后屈，愿诸卿勿复言。”遂北面拜跪如仪，复献太乐妓一百二十人于秦。秦乃还其母妻。超帅百官迎于马耳关，母子相见，悲喜交集。于是备法驾，具仪卫，亲自引导，迎入广固，尊母段氏为皇太后，立妻呼延氏为皇后，大赦国中。
是冬，汝水竭，河冻皆合，而渑水不冰。超问左右曰：“渑水何独不冰？”墨臣李宣曰：“良由带京城，近日月也。”超大悦，赐朝服一具。时祀南郊，有兽突至坛前，如鼠而赤，大如马。众方惊异。须臾大风扬沙，昼晦如夜，羽仪帷幄皆裂。超惧，以问太史令成公绥，绥曰：“此由陛下信任奸佞，刑政失均所致。”超乃黜公孙五楼。俄而五楼献美女十名，皆吴人，善歌舞。超大悦，复任五楼如故。一日临朝，谓群臣曰：“南人皆善音乐，今太乐不备，吾欲掠吴儿以补其数，谁堪当此任者？”群臣莫应，斛谷提、公孙归请曰：“愿得三千骑，保为陛下掠取之。”超喜，乃命斛谷提寇晋宿豫，拔其城，大掠而去。又命公孙归进寇济南，掠取千余人以献。超简男女二千五百，付太乐教之，重赏二人。