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嘉靖二十一年，毛伯温为兵部尚书。会廷臣议，上防边二十四事，军令一新。言官建议，请核实新军、京军及内府力士匠役，以裕国储。伯温因上亢滥当革者二十余条。凡锦衣、腾骧诸卫，御马、内官、尚膳诸监，素为中贵盘踞者，尽在革中。帝称善，立命清汰。宿弊尽厘。(《毛伯温传》。
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隆庆四年，大学士高拱请增置兵部侍郎一员，以储总督之选。由侍郎而总督，由总督而本兵，中外更番，边材自裕。(《高拱传》。)
万历十一年，张学颜为兵部尚书。时方兴内操，选内竖二千人，杂厮养训练，发太仆寺马三千给之。学颜执不与马，又请停内操，皆不听。其年秋，车驾自山陵还。学颜上疏曰：“皇上恭奉圣母，扶辇前驱，拜祀陵园，考卜寿域。六军将士十余万，部伍齐肃。惟内操随驾军士，进止自恣。前至凉水河，喧争无纪律，奔逸冲突，上动天颜。今车驾巳还，犹未解散。谨遵旧制：‘营军随驾郊祀，始受甲于内库，事毕，即还宫中。惟长随内侍许佩弓矢。’又律：‘不系宿卫军士；持寸刃入宫殿门者，绞；入皇城门者，戍边卫。’祖宗防微弭乱之意，甚深且远。今皇城内，披甲、乘马、持锋刃，科道不得纠巡，臣部不得检阅。又招集厮养仆隶，出入禁苑。万一骤起邪心，朋谋倡乱。哗于内，则外臣不敢入。哗于夜，则外兵不及知。哗于都城白昼，则曰天子亲兵也。驱之莫肯散，捕之不敢撄。正德中，西城练兵之事，可鉴也。”疏入，贾不能用。(《张学颜传》。
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万历之末，以兵事亟，复增设二侍郎，以祁伯裕、王在晋任之，而召张鹤鸣为左侍郎。鹤鸣等并卧家园不赴。及辽阳破，右侍郎张经世督援师出关，部中遂无侍郎。帝乃克期命兵部马上督催，鹤鸣等始履任。(《鹤鸣传》。
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崇祯十三年正月，召陈新甲为兵部尚书。自弘治初，贾俊后，乙榜无至尚书者。兵事方亟，诸大臣避中枢，故新甲得为之。(《陈新甲传》。)
十五年，给事中李清疏：“外之边才，散于推官等官；内之边才，散于京卿等衙门；而总以兵部为聚薮。诚于推知内Ａ３枢曹，或因扞虏御寇修城练兵着有成效者，擢之；使枢曹数十员果富于储，是边方兵备之才，于此一大聚矣。又于京卿内觅佐枢，或从见任、或从废弃、或从内迁之藩臬郡守确有强干者，拔之；使侍郎数员咸精于兵，是边方督抚之才，于此一大聚矣。盖兵部真边才之专门，而京卿则备边才之一途也。乞敕吏、兵二部，合志殚虑，以聚才枢部，使天下才智之士，鼓舞奔走于斯。遇有边方督抚及兵备员缺，无虑乏才补用。欲实收边才之效，不若力行先臣高拱之言为善也。(《春明梦余录》。
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兵部四司
洪武元年，设兵部郎中、员外、主事。六年，分属部三：总部，驾部，职方部。十三年，增库部。二十二年，改总部为司马部。二十九年，改为武选、职方、车驾、武库四司。设郎中一人，员外郎一人，主事二人。(《职官志》。
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弘治中，陈恺为武选司主事，历升郎中。武选繁剧，怨丛、势轧。恺一意奉公，私谒不行，一时武选称得人。本部长官举荐，谓恺可胜方岳之任。(《通典》。)
刘大夏调职方郎中，明习兵事，所奏覆昔当上意。尚书倚之如左右手。汪直好边功，以安南黎灏败于老挝，欲乘间取之；言于帝，索永乐间讨安南故牍。大夏弗予，密告尚书余子俊曰：“兵衅一开，西南立糜烂矣。”事得寝。(《刘大夏传》。
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嘉靖初，郑晓为职方主事，日披故牍，尽知天下厄塞，士马虚实、强弱之数。倚书金献民属撰《九边圆志》，人争传写之。(《郑晓传》。)
二十八年，开马市于大同、宣府。兵部主事杨继盛奏言十不可、五谬，贬狄道典史。已而谙达数入寇，帝思继盛言，四迁至员外郎。继盛抵任甫三月，草奏劾严嵩十大罪、五奸。疏入，帝怒，诏下狱，旋弃市。(《杨继盛传》。
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隆庆初，大学士高拱言：“兵者，专门之学，非素习不可应卒。储养本兵，当自兵部司属始。宜慎选司属，多得智谋材力晓畅军旅者，久而任之，勿迁他曹。他日边方兵备督抚之选，皆于是取之。更各取边地之人，以备司属，如铨司分省故事；则题覆情形，可无扞格。并重其赏罚，以鼓励之。”(《高拱传》。
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崇祯十七年三月，兵部主事金铉巡视皇城，闻大同陷，疏言：“宣大，京师北门。大同陷则宜府危，宣府危则大事去矣。请急撤回监觎杜勋，专任巡抚朱之冯？勋二心偾事。臣之冯忠恳，(校点者案：《明史》无“臣”字。
)可属大事。”不报。(《金铉传》。)
协理京督戎政
景泰元年，始设提督团营，命兵部尚书于谦兼倾之；后罢。成化三年，复设。率以本部尚书或都御史兼之。(《职官志》。)
正德十一年，尚书王琼奏：“给事翟瓒言：‘十二团营请查照景泰、天顺、成化等年事例，添设或尚书、侍郎、都御史一员为总提督，会同操练，不妨以他务。’但查前项事例，于谦、马文升、刘大夏等俱以本部倚书不妨部事提督，王越以左都御史不妨院事提督。今欲添设一员专管提督，事体重大，伏乞圣裁。”得旨：“提督官不必添设。”(《明臣奏议》。
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嘉靖二十年，始命刘天和辍部务，另给开防，专理戎政。二十九年，以总督京营戎政之印畀仇鸾，而改设本部侍郎协理戎政，不给关防。(《职官志》。)
隆庆元年，帝以京营事重，改协理为阅视，以左都御史曹邦辅任之。已，从恭顺侯吴继爵言：复改阅视为提督。(《曹邦辅传》。)
四年正月，罢京营总督，分设三大将，以侯、伯充总兵官。寻改提督，又用三文臣，亦称提督。九月，以文武六提督遇事各持意见，旬月不决。给事中温纯言其弊，乃罢之，仍设总理、协理二员。(《三编》。
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万历八年十月，兵部尚书杨兆协理京营。因有诏协理归本部侍郎带管，兆遂疏辞协理，因裁之。(《明纪》。)
天启初，坟设协理一人，寻革。崇祯二年，复增一人，以庶吉士刘之纶为兵部侍郎，充之。(《职官志》。)○南京兵部
宣德十年，黄福为南京兵部尚书，始加参赞机务衔。(《三编》。文彬按：《明史黄福》传“宣德七年，福以户部尚书改官南京。明年，兼掌南京兵部。英宗即位，加少保，参赞南京机务。’故《三编》系之宣德十年。《职官志》及《续通典》皆云；“参赞机务自宜德八年黄福始。”盖沿《明史稿》，以兼掌兵部之年为参赞机务也。
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福参赞时，尝坐守备李隆侧。杨士奇寄声曰：“岂有孤卿而旁坐者？”福曰：“焉有少保而赞守备者耶？”卒不变。然隆待稻甚恭，公退，发邓推福上坐。福亦不辞。(《黄福传》。
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初，参赞之任不专属兵部。自成化中薛远，继以陈俊，遂为定制。(《陈俊传》。)