乙酉（十六日），柴大纪发盐埕桥。丙戌（十七日），次湾里溪。参将潘韬领兵三百人回郡城，奉提督黄仕简之令也。戊子（十八日），次鹿仔草，庄民陈宗器起义民随军。庚寅（二十日），次三苞竹。初，诸罗之陷，告养知县陈良翼陷于贼，几不免，诸罗人素德良翼，醵钱贿贼帅得脱，赴青浦庄；至是起义民应官军。武举人黄奠邦在双溪口，先受柴大纪密谕招义民；闻大兵至，乃起应官军。柴大纪顿三部竹，遣守备邱能成为先锋，探贼虚实。
初，林爽文委贼目蔡福、叶省守诸罗，而自率大众攻府城。其败归也，过诸罗，嘱蔡福、叶省死守。林爽文去，蔡福亦弃城，走保诸罗山，守城者仅数百人。邱能成领兵至，贼众皆遁。辛卯（二十一日），大纪领兵至田洋，望见城左右贼旗往来，麾炮击之，炮裂，有死者。师入城，周巡街市，民情皆欢跃。诸罗教谕江浩，城陷时得脱，至是招募义民回县署。斗六门巡检陈圣传闻复城，亦自斗六谋回县，在途遇贼，被害。柴大纪出屯北门外，分遣兵大搜贼党。官兵、义民皆争擒贼献功，获林老等八十余人。有三十余人皆良善，柴大纪欲并诛之。时陈良翼奉檄权知诸罗县事。城中父老遮道呼冤，良翼为之力请省释，而柴大纪既以获贼入告矣，执不听。良翼私纵之，从民愿也（后事发，良翼以未经据实通禀，罪应死；特诏原之。时柴大纪已伏法，其子皆得罪）。诸罗略定。
海坛镇总兵郝壮猷之往复凤山也，与柴大纪同日兴师。闻贼目据冈山，戒勿轻进，日行五里。戊子（十九日），次大湖。大湖在府城东南二十里，与冈山相望。贼人闻大兵至，伏冈山后。官兵侦之，往捕，望见东南密箐中旗帜飘飐，官兵列阵以待，无应者。师进，望见尘起，又列阵御之。日昃，恐为贼所算，退屯大湖。有报贼人将乘夜劫营者。夜将半，果有贼至，官兵大惊，枪炮齐发，达旦乃止。迟明，师进，见草寮数十间，郝壮猷命将士搜之，寂无一人，尽焚之，贼人忽自蔗林中大哗，官兵急退回大湖。于是贼人时出扰官兵，官兵拒之。官兵往捕贼，贼亦死拒。二月辛亥（十三日），顿师大湖二十有四日矣。
台湾道永福见黄仕简，请下令促进兵。仕简曰：“师老矣，轻进必有失，且令郝总兵回军缓图之”。永福曰：“师闻进尺，不闻退寸。今旋师，必为贼人所窥，知官兵不可恃。请饬同知杨廷理、知县王露发义民二千助战”。仕简从之。维时福宁游击延山亦领千总、把总、外委邱安国等十五员，兵千人至府城。仕简檄令以五百人留府，而以五百人赴大湖。又令游击郑嵩以台协水师兵三百人，并带提标金门征兵二百人，由海道至打鼓山登岸，绕攻凤山之南。军声大振。贼退据阿公店。官兵乘之，壬子（十四日）次冈山。贼退守桥仔头。乙卯（十七日），官兵次阿公店；贼退守水底寮。庚申（二十二日），郝壮猷复凤山（郝壮猷屯大湖，同知杨廷理禀报督抚，其略曰：“南路贼匪，势甚猖獗，竟敢不避大军，昼夜烧庄攻营，日甚一日。自前月十九日驻兵大湖；贼人日与郝镇大营挑战，对面埋锅造饭，肆无忌惮。本月初十夜，贼又入大湖街烧毁民房七十余间，男妇逃亡四散。十二日，贼又扑大营，有欲日夜酣战、以决雌雄之语。此近剿匪之实在情形也”。其禀至详，今附录于此）。
初，黄仕简抵台湾，征兵几五千人。及分往诸罗、凤山，郡城兵单。郡城东北布袋尾、旧社、本县庄各处奸民谢桧、陈建平侦知官兵易与，复竖旗聚众，剽掠乡民。官兵不能制。而任承恩又遣人自鹿港来府城告急，请援师。
维时总兵普吉保统领延平副将林天洛、兴化副将格绷额、水师提标守备陈士份、延平守备高守宗、建宁守备唐昌宗、千总、把总、外委三十三员，兵一千七百名至台湾府。仕简即檄普吉保以是兵赴北路，又檄副将徐鼎士领兵千人由淡水赴援鹿港。
二月己亥朔，普吉保发郡城。乙巳（初七日），次大埔林，闻贼众占聚斗六门，戒将士自石龟溪绕道，由边海北去。贼随出尾官兵。官兵疾走，失军装车十一辆。沿海村民遮普吉保，请回兵击贼，曰：“吾辈日夜望官兵，心图休息；今官兵见贼不击，且失车辆，贼轻官兵，吾辈其无噍类矣”！不听。于是乡民自纠众逐贼，夺回车辆过半。戊申（初十日），普吉保至鹿港。
鹿港自林凑等纠义民克复彰化，日出焚毁漳人庄舍。彰化县漳人庄凡数十营，林爽文倡乱，犹心恃两端，及数被义民蹂躏，从贼心益坚。有贼目陈泮、吴领者，林爽文南去，留守虎仔坑，护卫门户，益纠众为报复计。凡泉人庄舍，贼亦尽焚之。泉人皆携老幼至港避难。难民几万人，无所归，或时抢掠街市，官不能禁。任承恩至鹿港，有杨礼等十一人，白昼劫掠街市。承恩执之，割脚筋以惩。港民稍宁息。
正月庚辰（十一日），任承恩遣游击穆腾额、守备潘国材以兵五百攻南投，游击海亮以兵三百攻嵌顶，守备常万雄以兵三百攻北投；皆遇贼莫能进，退归鹿港。
壬午（十三日），林爽文自府城回大里杙。林爽文闻大兵四集，先与其众谋固巢穴。沿大里杙东南掘壕二千余丈，壕内垒土垣，以所劫枪炮列垣内。又于斗六门、庵古坑、集集埔、水沙连各要隘竖立木栅，以石筑墙，分众守之。勒派农民，每山田一亩，贼收其一而民得其九；水田一亩，民得其八而贼收其二。大里杙左右、猫雾拺一带，皆膏腴地；以是贼粮充牣。又绝山陂，遏山水不能下，沿海民田不能插种，斗米数百。招民赴贼巢就食。于是彰化之北大肚溪、乌日庄、九张犁、犁头店、沟仔墘、西大庄、新庄仔、草官田，彰化之南虎仔坑、林纪埔、万丹庄、嵌顶庄、浊水庄、南北投、田中央、竹仔寮，又自大里杙往诸罗之水沙连、他里雾、九芎林、庵古坑各处，皆贼巢也；纳贼粮，服贼役。其民皆于顶发外又留发一圈，以为识别。
贼目王芬，泉州人，守麻园庄。林爽文南下，留守巢穴。既闻泉州义民盛，心猜疑，不自安，私回麻园。义民纪春、蔡运世等闻之，围麻园，杀王芬。
林爽文既归，于是齐集各首目，再号令曰：“自今以后，各兄弟生同乐、死同归，有异心，天罚殛之”。贼目林里生扰鹿港，义民擒送任承恩斩之。林爽文望东哭，甚哀。又闻王作、陈苋等在竹堑被诛，杨振国、高文麟等械送内地，刘志贤亦被义民缉获，皆厚恤其家，更设场招僧道诵佛事，超度南路阵亡各贼首。
蔡福、叶省守诸罗，诸罗失，谋归大里杙。林爽文欲诛之，蔡福惧，乃守斗六门。
林爽文归大里杙，恐官兵进逼之，固守巢穴，计极周密。既闻官兵分守各路，兵势单，莫能进。乃遣奸僧西叶、心向、新法等至鹿仔港侦官兵虚实，欲大举寇鹿港。西叶、心向等至港，任承恩执而询之，得其情实，皆斩之。命都司马元勋、守备常万雄守埔心，以御虎仔坑贼；命游击海亮、穆腾额、都司张奉廷直进马鸣山札营堵御。