官兵首尾不相救。贵林、杨起麟、杭富、马大雄皆战死。又阵亡千总以下林玉得、杨振凤、李振明、苗承霖、刘文全、吴绍玠、姚瑞麟、刘凤腾、胥献珪、陈淮、孙文元、叶文郁、佘应标、任赞元、陈元生、汪应麟、陈邦材、陈洪猷等十八人。阵亡兵丁七百余人。而义民阵亡者亦不下百人。蔡攀龙、孙全谋等虽至诸罗，器械、粮饷，尽为贼有。贼势猖獗如旧。
有义民许品、黄凤者，随蔡攀龙进兵，至竹仔脚散失，逃回盐水港，言官兵已入城，副将蔡攀龙又带兵逐贼，接应余兵入城。佳里兴巡检邵宗尧闻其言，大喜，驰报捷音。而总督李侍尧亦信之，入告。乃越数日，竟不得诸罗音问。遣人探之，道路仍阻。始稍稍知官兵失机矣。有旨授柴大纪为参赞，赐号年长阿巴图鲁，赏其固守诸罗之功也。
八月庚申（二十五日），恒瑞至盐水港，闻官兵不利，贼势益张，众日往来攻扰盐水港、鹿仔草。乃以所带兵分五百人，檄游击刘越领之，防守鹿仔草。癸亥（二十八日），贼攻鹿仔草，陷之。
初，柴大纪以盐水港、鹿仔草为往来府城要路，遣游击杨起麟、邱能成分兵守。至诸罗被围久，撤盐水港、鹿仔草之兵随贵林等赴县城，惟董秉璨带老弱四百余人守鹿仔草，而盐水港亦唯守备黄象新带兵八百人守之。会恒瑞至盐水港，盐水港兵势稍振，贼益攻扰鹿仔草。
贼目叶省妻黄玉娘者，诸罗娼也，家月眉潭。叶省率众寇诸罗，黄玉娘往往为后殿。诸罗东门之战，叶省毙于炮，其下推黄玉娘为主，为叶省复仇。自贵林等援兵失利，乘势寇鹿仔草。守鹿仔草游击董秉灿与守备林士元分守南北栅。林士元守南栅，闻贼至，以火药实炮待之。既而见贼数十人呐喊，将近栅，林士元轻之，率兵出逐。贼皆伏密箐中，一时并起。林士元急收兵，闭栅，发大炮击之。黄玉娘为娼时，与鹿仔草亡赖子多往来；亡赖子闻黄玉娘至，私以水灌炮，炮不能发。贼人扳栅入，官兵皆溃回盐水港。阵亡千总张射斗，兵数十人。
先是恒瑞闻鹿仔草急，遣游击刘越带兵五百人协守。甫至而鹿仔草陷。恒瑞劾失守鹿仔草之罪，董秉灿、林士元、刘越等革职、镌级各有差。
甲子（二十九日），总兵梁朝桂统领杭州协领花沙布、佐领富昌、纠金保、防御伊克坦布、色成、都司杨拜飏、萧应得、骁骑校五人、千总、把总九人，杭乍驻防兵五百、广东绿营兵五百，自关帝厅赴盐水港。
先是恒瑞赴盐水港，请梁朝桂同行，会南路贼犯草店尾，官兵御之，阵亡千总徐日光。常青以南路贼方窥伺郡城，大营兵单，不欲遣朝桂行。至是添调满汉兵皆至，常青念盐水港贼众而官兵新败，恐恒瑞不能当，故遣朝桂。恒瑞既至盐水港，数日之内，贼焚劫附近民村树林、头后镇、上帝庙，又陷鹿仔草，盐水港一日数惊，而新店海口贼尤屡扰之。恒瑞令谢廷选领兵八百人守新店。或言宜进兵解诸罗围者，恒瑞曰：“今四面皆贼，不惟进不能解围，即欲退回郡城，其可得乎”？日致书常青告急。既闻梁朝桂带兵千人至，心乃稍安。
九月戊辰（初四日），贼犯盐水港，恒瑞率兵御之，侍卫富克精额中炮死。戊寅（十四日），贼复至，守备黄象新、萧应得、李自昌带兵击走之。恒瑞赏黄象新、萧应得、李自昌戴用花翎，以奖励之。辛巳（十七日），总兵普吉保领兵攻笨港，克之，退屯元长庄。
初，常青屡檄普吉保援诸罗。普吉保以兵单，且蓝元枚新卒，未可轻动。顷之，守备宋国兴率千总、把总十二人，漳州兵千名；游击夏承熙带千总、把总九人，兵千名；先后至鹿仔港。而广东总兵李化龙、参将张朝龙、守备刘光国、王德俊、余飞鸿、胡锳、千总以下二十一人，带广东兵二千，继至鹿仔港。兵势既振，恒瑞再檄普吉保令统兵援诸罗分贼势。上亦切责普吉保坐视诸罗受围，不能进取。而鹿港义民首林凑等又言兵有可进之机，不宜失事会。于是普吉保将兴师。九日丁卯（初三日），广东游击张会元、守备马得骢又带千把总十一人、兵千名至鹿仔港。会李化龙奉旨署水师提督，普吉保乃请李化龙驻鹿港，分广东兵六百人，令游击张会元领之，守马鸣山。己卯（十五日），普吉保部分诸将，以参将张朝龙领广东兵，以参将海亮领福建陆提兴协长福各营兵，以游击琢灵阿领浙江兵，以游击夏承熙领漳州兵。将弁七十余人，征兵五千，发鹿仔港。维时沿海麦仔寮各民庄尚为官守。于是普吉保由马鸣山兴师，沿海行。辛巳（十七日），至笨港。笨港为贼焚毁略尽，不能守，退屯元长庄。常青遣千总王国志、董国瑞带兵二百名，府城义民二千，赴盐水港；从恒瑞之请也。
壬午（十八日），泉州城守营游击张无咎带兵五百人至台湾。癸巳（二十九日），都司吴壮图带兵五百人至。初，总督李侍尧闻诸罗被围久，常青派大营兵赴援，几万人，围不解。恒瑞至盐水港，每称贼众兵单，不能进。因奏遣总兵郑国卿带兵三千人直渡盐水港。时上谕李侍尧在泉州招新兵补缺额，新兵大集。李侍尧即以所募新兵千五百人充是役。游击张无咎、吴壮图带兵至关帝厅。常青乃令赴盐水港。
十月辛丑（初七日），常青遣副将丁朝雄带兵二千人复东港。东港在凤山南四十里，滨海，为南路商舶出入要口。自凤山陷于贼，商舶不通者几月余。而东港最近竿林，各粤庄义民有事至郡城，皆道东港。六月以来，南路贼皆至南潭与大兵相持。至是竿林庄粤民纠众攻新园贼巢，乘势至东港。守港贼目张基光等回水底寮。义民首林成赴府城请发兵守东港，通粮道。
先是常青奏东港不通，粮道阻绝。总督李侍尧闻之，奏遣游击倪宾、守备查城带千总以下八人，兵千名复东港。至是常青分其半守鲲身，别遣副将丁朝雄统领革职参将那穆素重、革职守备黄乔等，带台协水师澎湖兵五百人往，倪宾、查城以新至兵五百人随之。又遣奉差到营守备林登云带台湾招募新兵五百人、并投诚守备庄锡舍随往备策应。辛丑（初七日），丁朝雄等至东港，闻近港有贼，不欲遽登岸；港民恳请，乃札营港口，与山猪毛义民通。常青奏赏曾中立同知职衔、罗前荫知府职衔，奉旨赏其招募山猪毛义民之功也。
十月丙午（十二日），驻守淡水副将徐鼎士、淡水同知徐梦麟，自大甲进兵，攻大肚溪，克之。初，徐鼎士率兵自艋舺移驻大甲，同知徐梦麟亦招义民驻焉。贼目何有志等屡次来犯，官兵、义民击走之。九月戊寅（十四日），都司敏禄、守备陈峰毫带外委五人、兵千人继至。兵势益振。徐鼎士等上书守鹿仔港总兵李化龙，请定期会攻大肚贼巢；久无定议。于是贼围诸罗急，其牛骂头、乌日、沙辘、大肚各贼庄精壮者大半赴南路，大甲义民皆言兵有可进之机。于是徐鼎士、徐梦麟等决意进兵。十月庚子（初六日），徐鼎士部分将弁，留守备陈峰毫守大甲，即分兵六队并进。副将徐鼎士、都司敏禄、守备潘国材领兵千人，分三队由沿海青埔西路进；同知徐梦麟率义民从之。游击吴秀、都司朱龙章、千总袁良禧领兵千人，分三队由岸里社、社皮东路进；浙人寿同春率义民从之。辛丑（初七日），都司敏禄、守备潘国材分兵攻猪篙庄、沙辘庄，克之。甲辰（初十日），焚麻园庄。丙午（十二日），官兵攻大肚，贼目何有志遁走，官兵克大肚。鹿港之师不至。徐鼎士等退守牛骂头。