文员
澎湖旧隶台湾县，止设巡检一员。雍正五年移驻道员案内，以澎湖缺最紧要，巡检职微，不足胜任，始改设通判；逮余甫三任，而巡检姓名已多泯灭。余为考索得十有二人，历四十有三稔，为备录以传于后。至通判，则近而易知，故纪载加详云。
巡检
姚法唐，河南祥符吏员，康熙二十三年任。
朱缙，浙江钱塘吏员，康熙二十七年任。
胡腾凤，江南含山吏员，康熙二十三年任。
林开彦，直隶抚宁吏员，康熙三十五年任。
李慧仁，直隶安肃吏员，康熙四十一年任。
耿瑚，河南柘城吏员，康熙四十五年任。
陆监，顺天吏员，康熙四十七年任。
乔杰，陕山吏员，康熙五十二年任。
李振宗，浙江吏员，康熙五十八年任。
朱唯章，顺天宛平吏员，雍正元年任。
郑奎聚，顺天通州吏员，雍正四年任。
罗开勋，湖广吏员，雍正四年任。
通判
王仁，字子芳，号松亭，顺天大兴人。由吏员，捐考职。经历运粮有功，议叙授漳州府通判。于雍正六年五月调任。
梁樟，字子章，号驳庵，陕西西安府咸阳县人。由康熙辛丑科进士，初任长泰县，调长汀县。于雍正九年正月升任。
周于仁，字纯哉，号仙山，又号龙溪，四川潼川府安岳县人。由康熙戊子科举人，初任永春县，调将乐县。于雍正十一年八月升任。
曹显庚，字西长，号星哉，浙江嘉兴府石门县人。由监生加捐，选授泉州府通判。于乾隆元年二月调任。
胡格，字寿平，号勖夫，湖广武昌府江夏县人。由康熙丁酉科举人，初任泰宁县，调诏安县，再调同安县，三调晋江县。于乾隆三年八月二十二日署任。乾隆四年保举行取，乾隆五年十月十八日离任。
王鹗，字药岩，号瞻飞，江南昆山县人。由监生加捐，选授泉州府通判。于乾隆五年十月到任。
陆鹤，字西溟，号敬齐，浙江嘉兴府海盐县籍，杭州府海宁县人。由康熙丁酉科举人，初任宁波府奉化县教谕卓异，升授福建连江县知县，调诸罗县，升泉州府通判。乾隆八年调补澎湖，于本年六月十二日到任。
武员
澎湖属水师提督管辖，设副将一，左右二营游击各一、守备〔各〕一、千总各二、把总各四；兵二千名，哨船三十六只。
副将
詹六奇，漳州府漳浦县人。康熙二十三年任。
张旺，陕西人。康熙二十八年任。
王国兴，陕西人。康熙三十年任。
尚宣，陕西长武县人。康熙三十四年任。
陈国任，陕西人。康熙三十七年任。
王三元，陕西甘州卫人。康熙三十九年任。
赵烜，陕西人。康熙四十三年任。
叶国鼎，福州府闽县人。康熙四十六年任。
张进，漳州府人。康熙四十九年十二月任。
朱杰，字伟伯，顺天府宛平县人。康熙五十四年任。
许云，漳州府人。康熙五十六年任。
蓝廷珍，漳州府漳浦县人。康熙五十七年任。
罗光干，陕西人。康熙五十七年任。
戴宪宗，浙江绍兴府人。康熙六十一年任。
陈伦炯，泉州府同安县人。雍正元年三月任。
董方，泉州府人。雍正三年任。