〔四月〕庚申，福建新倭自长乐登岸，流劫福清等处。总兵官刘显、俞大猷合兵邀击于遮浪，歼之。平海倭引舟出海，把总许朝光以轻舟抄之，斩首四十九级；贼乃尽焚其舟，还屯平海。
丁卯，副总兵戚继光督浙兵至福建，与总兵刘显、俞大猷夹攻原犯兴化倭贼于平海卫，大破，平之；斩首二千二百余级、火焚刃伤及堕崖溺水死者无算，纵所掠男妇三千余人，复得卫所印十五颗。自是，福州以南诸寇悉平。
〔乙亥〕，巡按广东御史陈道基以正月间潮、惠二府倭患闻，乞速命督、抚诸臣调兵分剿。诏总督都御史张臬严督各官调集汉、达官军协力剿灭以靖地方，毋怠！
〔五月庚辰〕，按福建御史李邦珍以二月中福建倭寇攻陷宁德、平海城及都指挥欧阳深死状闻，因言’破平海者乃闽之南境贼，其初自福清等处登岸；破宁德者乃北境贼，其初自福宁登岸：皆闽中大患——而南贼尤剧。已经累次调兵剿捕，而总兵俞大猷赴援濡滞、游击何本源等私掣回戍兵，致忠将陷没、地方失守。乞明示赏罚，以昭劝惩‘。上从部议，令张臬、谭纶严督刘显等协力剿之，刻期荡平；大猷姑戴罪自效，本源下巡按御史逮治。欧阳深赐棺殓银五十两，荫一子为世袭指挥佥事；仍立祠祀之。
〔六月庚戌〕，巡按御史李邦珍勘上福建剿平旧倭状：’先是，贼两破宁德城，屯据横屿。屿去县十余里，四面皆水；路险隘，不便深入。故官军与贼相守逾年，莫敢决一战者。四十一年七月，总督尚书胡宗宪檄浙江参将戚继光部浙兵七千余人援之；令军中人持草一束，填河而进。遂大破贼巢，平之；生擒九十余人、斩首二千六百余级、焚溺死者无算，夺被掳三千七百余人、印二颗。乘胜剿福清牛田寇，又破之；追至兴化，同副使汪道昆等用火夹攻贼营，焚斩几尽。捷闻，下邦珍勘实‘。兵部覆：’诸臣赏宜从重；宗宪虽去任，仍当优录‘。上命赏宗宪银二十两、彩币二袭。升继光署都督佥事，升都指挥戴冲霄二级，道昆及浙江监军副使王春泽、把总等官吴惟忠等一十九人各一级；仍与福建副使等官金立敬等四人各赏银有差。是日，浙江巡抚赵炳然亦报福建余贼于四月中流入浙江界，官军迎战于连屿、陡桥、石坪等处败之，斩首百余级；既而新倭百余人亦犯石坪，我军乘胜追剿，无一生还者。疏下，兵部议覆；得旨：’炳然督剿倭寇一月两捷，赏银四十两、彩币二袭；宜益用心饬备，以副委任‘。
〔七月壬辰〕，巡抚福建都御史谭纶以四月中平海大捷闻，言’贼自兴化破城后，乘胜攻陷平海据之。我兵方议大征，会长乐县新倭自福清渡江，谋趋平海合营；总兵俞大猷、刘显遮之于途，擒斩几尽，余党俱遁入海。平海贼闻之，始惧，欲逃；为官军所扼，不得出，乃移营渚林迤南。时副总兵戚继光自浙江应调至，臣素知其勇略，使领中军；显左军，大猷右军。及战，继光先进薄贼巢，左、右营继之，四面合围；因风纵火，贼死战皆灼烂，巢中积尸及溜，无一人得脱者‘。因叙诸臣功，以继光居首，显、大猷次之，募兵督战如副使汪道昆、参议万民英又次之，先驱陷阵如把总胡守仁等又次之，邀贼助阵加义士许朝光、刘文敬又次之；而二司、府、县等官万衣等之给饷、纪功、屯兵、分守，均宜叙录。至于江西巡抚胡松、南赣巡抚陆稳、浙江巡抚赵炳然调兵赴援之功，亦不可泯；而原任巡抚游震得指授于去任之日、参政翁时器效死于戴罪之时，劳绩并着，固不当以昔之过而尽掩其功也’。疏下，兵部议覆；得旨：‘天地、宗庙垂佑，八闽底宁；各官协谋戮力，功实可嘉！纶升右副都御史，巡抚如故；继光署都督同知，仍荫一子为锦衣卫正千户：各赏银三十两、纻丝二表里。显于祖职上升二级，与大猷各赏银二十两、纻丝一表里。道昆升一级，民英升俸一级，守仁等二十一人各升二级；朝光、文敬各授原籍所镇抚，仍与守仁等各赏银十两。炳然、松稳各三十两、二表里，衣等十二人各五十两。震得令按臣详勘前后功罪以闻，时器仍逮京从公问拟’。
〔九月丙申〕，故海寇王直余党洪迪珍降，伏诛。迪珍，漳州人。初，与直通番。后直败，其部下残倭乃依迪珍往来南澳、浯屿间；惧官军诛之，声言听抚而剽掠如故。至是势穷，率其子文宗自诣福建海道副使邵楩所，愿立功自效。总督都御史张臬收下狱，驰疏以闻；诏即地斩之。
〔十月〕辛亥，福建巡抚谭纶条陈防海善后事宜。兵部覆行其五事：‘一、复水寨。旧制，自福宁南下达漳、泉，置水寨五，以扼外洋；法甚周悉。今宜复旧，以烽火门、南日山、浯屿三〈舟宗〉为正宗，铜山、小埕二〈舟宗〉为游兵。寨设把总一员领之，而为之分信地、明斥堠、严会哨、殿功罪，使总核有经，坐收实效。一、处兵将。副总兵戚继光宜擢为总兵，镇守全闽；仍增设坐营都司一员、把总二员，充其任使。其原设三路参将，悉宜改为守备。总兵官俞大猷宜复还伸威营，与南赣军门事权为一，在福建止备汀、漳二府山寇。一、处客兵。福建所募浙兵列为二班，班各九千人。上班者以七月初一日为始，用防秋汛，至十月散回；下班者以十月初一日为始，赴戍所防春汛，至六月终散回。更番迭上，岁以为常；不得变乱行伍，违误戍期。一、团练主兵。各县额设民兵，宜汰其老弱，尽以精悍者充补。仍分为二部：一属本县掌印官训练防守，一属巡捕官赴府团操。每府委武职一人，统督该府掌印官监督；兵备道以时阅视，别其勤惰而赏罚之。一、申明职守。沿海及腹里府州县与卫所同住一城及卫所自住一城者，若遇攻围不能固守，卫所掌印、捕盗官俱照守边将帅失陷城寨律，斩；其府州县捕盗、掌印官送部，降级别用。自今宜申明职守，着为定例’。上命兵部同三法司详拟失陷城池罪例以闻，余如所议。……吏部亦覆论二事：‘一、重监督。大将临戎，非素所同心文官与之终始，则临事矛盾，成算有乖。今升级副使汪道昆本监戚继光军，宜即升为本司按察使，与继光共理兵务。一、举贤能。参议金浙、运同刘汝顺、同知刘宗寅久居闽地，习其土俗；遇有升迁，请即于本省推补’。……诏俱允行。
·〔嘉靖四十三年二月戊午〕，福建总兵戚继光追击仙游县残倭，大破之。时闽中旧倭略平，余党复纠新倭万余攻仙游县城，围之三月。继光引兵驰赴之，大战城下；贼败，趋同安。继光麾兵追至王仓泙，斩首数百级，坠崖谷死者无算；余众尚数千，奔漳浦县之蔡丕岭。继光分其兵为五哨，身自持短兵，徒跣缘崖，披荆棘而上，迫垒；贼伏发，继光气愈厉，督各哨兵入贼巢，殊死战，擒斩又数百人。于是，闽寇悉平；其残寇得脱者流入广东界，掠鱼舟入海。
〔三月己未〕，广东官军击潮州倭寇，破之。……
〔四月丁丑〕，福建巡抚都御史谭纶以王仓泙、蔡丕岭捷闻，诏先赏纶与总兵戚继光银、币，其余有功者俟勘至并叙。
〔六月〕辛卯，广东官军大破倭寇于惠州海丰县。倭初自福建流入广东，会两广、南赣各军门征调汉、土兵大集，乘其初至，急击之。贼惧，悉奔崎沙、甲子等澳，夺渔舟入海；遇暴风，舟皆覆溺，得脱者仅二千余人，留屯海丰金锡都。总兵俞大猷帅官军四面围之，相守且二月。贼食尽，欲走；报效副总兵汤克宽伏兵大埔察窖口以待之。贼至伏发，贼乃大惊扰；克宽斩其枭帅三人。参将王诏等兵继进，贼遂大溃；擒斩千二百余人，各哨军前后所得零贼又一千余人。于是余倭无几，不复能军，散遯入山薮；各兵乃分道搜之。
·〔嘉靖四十四年四月甲午〕，倭寇自浙江台州海洋突犯福建福宁州，总兵戚继光督参将李超、把总魏宗瀚合水陆兵击败之，斩首二百余级。乘胜追剿原犯永宁倭，斩首百余级。