然而成吉思汗意识到诸子相仇在他死后将有引起可怕纠纷的危险。《秘史》在这里说到成吉思汗曾提出明智的劝告，对诸子说：“你们不必并行，
天下地面尽阔，叫你们各守封国。”他追溯蒙古从前王室的后裔阿勒坛和忽察儿的家族，因家族不和使他们丧失了王位。最后，如果我们相信蒙古的史诗，成吉思汗此时要求预先解决这个继承问题，他属意于窝阔台。四个兄弟里面最幼的是拖雷，他答应帮助窝阔台，当他忘怀沉睡时候唤他醒，有必要时提起他的责任，并且在他指挥之下忠心耿耿地去征战。然而这个蒙古的史源，在我们看起来，实在是有些言之过早，它还说成吉思汗有言，如果窝阔台的子孙没有治国的才具，得由另一系的子孙继承帝位。
花剌子模帝国的毁灭、河中和花剌子模的征服
在出发征伐花剌子模帝国以前，成吉思汗要求西夏主或唐兀国王，即《秘史》称为不儿罕而中国编年史称为神宗的派兵助战。派人对他说：“你答应做我的右手。现在我和撒儿塔兀勒（按：这是蒙古人所称花剌子模）决裂，
即将出征。和我一同出发，做我的右手吧。”但是唐儿国的一个大臣阿沙敢不做了极其粗暴的回答说：如果成吉思汗的力量不够，何必自称为汗？这个仇恨成吉思汗留待后来报复。他不能在出征花剌子模的同时再兴兵攻唐兀，
而且对于金人进行的战争，虽然从缓，但在木华黎指挥之下，总要牵制住左翼的兵力。但是他自誓，一俟花剌子模事件结束，就要向唐兀人报仇，他结果履行了这个诺言。
在兔年，1219
年的夏天，蒙古大军在也儿的石河上游集中。秋天时候，成吉思汗到达，在巴尔哈什湖东南，在哈剌鲁人地方的海押立，哈剌鲁国王阿思兰（其意义为“狮”）和他联兵。到这里来聚会的还有阿力麻里国王苏黑纳黑特勤和从土鲁番和库车带兵而来的畏吾儿人的亦都护巴而术。依照巴托尔德的估计，蒙古军人数约在十五万人至二十万人之间。成吉思汗叫他的最幼兄弟帖木格斡赤斤留守蒙古。在他妻妾之中，他叫美丽的忽兰陪伴同行。前哨和后援的重要职务委付与少壮的统帅，他们在和最后的乃蛮人以及最后的篾儿乞惕人战争中表现勇敢，而知人善任的成吉思汗不至不立即加以拔擢的：者别担任前哨，速不台做者别的后援。脱忽察儿也被委以重任，
担任速不台的后援，这似乎一部分因为他是成吉思汗的女婿。
花剌子模帝国，即《秘史》称为撒儿惕人的，因蒙古军的来临而惊怖。数个世纪以来，河中的定居人不花剌和撒麻耳于城的伊兰族居民，锡尔河、塞拉夫香河和阿姆河乡野的伊兰种的或“撒儿惕”的农民；构成政治和军事贵族阶层的伊兰化并定居化的突厥人，常处于疑神疑鬼之中，惟恐游牧人从戈壁和阿尔泰山忽然如飓风一样的袭来。1218
年的春天，有一支商队以使节的姿态由成吉思汗处来到河中，花剌子模算端摩诃末于夜间叫一个商队队员——这个人正好是原籍花剌子模的商人——到他那里，详细问他成吉思汗的实力究竟如何。他问：真的成吉思汗曾征服桃花石，即中国北部和它的都城么？这时候，算端为了慎重起见，打算和蒙古汗成立一种通商条约，然而后来就在这一年，即1218
年，蒙古商队在讹答刺的被杀事件激起了决裂——战争爆发了。
面临蒙古人的威胁，摩诃末算端把他的军队分布在锡尔河、费尔于纳要隘和河中各城的这条防线，因此在总的人数上他虽然占优势，而到处兵力都感缺少。成吉思汗从讹答剌方面攻破锡尔河防线。由他两子察合台和窝阔台统率的一军，由畏吾儿国王巴而术协助，留在这里（指讹答剌——译者），
在包围了很久之后才攻取这个地方，因为蒙古人攻取坚城，在开始时候，方法很笨拙，我们已经在他们出兵中国之初看到了这一点，在这里也有这种情形。第二支蒙古军在成吉思汗长子拙赤指挥之下，从锡尔河两岸下趋，攻占了昔格纳黑和毡的。另一支五千蒙古兵的部队，上趋向锡尔河上游，攻取别纳客忒并进围费尔干纳的都城忽毡，这座城的花剌子模总督是英勇的帖木儿灭里（“铁王”之意）他于坚强抵御之后，沿河下趋出走。最后是成吉思汗自己和他的少子拖雷带着大军直向不花拉进军，于1220
年的4月到达。
防守不花拉的花剌子模士卒皆是雇佣的突厥人，这些人欲突破一个缺口而逃，但结果只是使自己溃散。居民看到军队试行逃走，为之气沮，于是开城迎降于蒙古人，额梯儿说，这是在2
月10日，但据术兹查尼则说，是在16
日。有突厥骑兵四百人，退守内堡，蒙古兵缘梯而登攻破之，守兵全部被杀。该城居民被迫献出全部财产并且受到种种迫害。但是蒙古人只对意欲反抗的居民使用有系统的屠杀，尤其是若干教长。杀死这些教会人物，被说成是成吉思汗意在迫害伊斯兰教。然而与其残暴本性不相符合，蒙古人不可能理解宗教战争，首先由于他们缺乏这种认识，其次因为他们以为一切宗教的代表人物都可能和他们自己的珊蛮一样，掌握某些魔术力量，因而对他们有迷信的敬仰。志费尼的富有戏剧性的记述，对我们说，成古思汗召集所有伊斯兰教徒至于不花拉的大礼拜寺，用一种意义不明的演说恐吓他们，自称是上帝派来责罚他们的人，巴托尔德认为这是过于传奇化，的确是这样。况且这位蒙古征服者很有政治头脑，绝不至以宗教问题恐吓伊斯兰教社会，他在蒙古和中国所采取的态度是善于利用腾格里或天来制造人们的幻想，允许我们推测他在必要时候还要同样利用阿拉。这里有更严重的情形，就是在劫掠之中，发生了火灾，结果焚毁了该城的一部分。
成吉思汗向撒麻耳干进军。在这座都城的外面，他和他的两个儿子察合台和窝阔合会师，他们刚刚取得了讹答剌，来到这里。撒麻尔干的突厥守兵是新近招募而来的佣兵，对于花剌子模的算端，缺乏效忠的坚定意志，没有作任何抵抗；所有这些突厥佣兵只有一种思想：被编入成吉思汗的大军。成吉思汗伪装应允，然而守兵投降之后，他出共不意地将他们残杀。这种举动当然是背信。实际上，这位征服者把佣兵的投降认做是他们对自己主人，花剌子模算端的背叛。我们知道他对于这一类事件的观念，他利用了佣兵们的卑怯，但是对他们只有鄙视，并且认为将不忠于其主的部下处死是合乎道义的。至于撒麻耳干的居民（他们的大部分还是伊兰人），他们抵抗得较好。至少是他们很勇敢地组织了一场突围，然而这些工匠们敌不过草原的骑士，他们被击溃了。［4］志费尼说，撒麻耳干城于被攻五日之后投降，
术兹查尼说于十日之后投降，术兹查尼以为这是在穆哈兰月（Mouharram）10日，即1220年的3
月17H。和不花拉的情形相反，宗教的权威人士，伊斯兰教的先知和法官等没有表示抗拒，蒙古人结果赦免了他们，这可以充分证明蒙古人并没有存心敌视伊斯兰教教会。
蒙古人占领在现今基瓦附近的花剌子模本土的都城乌尔犍赤，比较困难得多。成吉思汗不得不派遣他的三个儿子拙赤、察合台和窝阔台都到那里去，
同时还派了博尔术、脱栾扯儿必、兀孙那颜和合答安。在艰苦围攻之中，拙赤显出是一个凡庸的领袖。他和察合台又开始作对，察合台斥责他遇事没有决断，六个月之后，成吉思汗为了终止他们的争吵和成立统一的领导，不得不命令他们两人都听从窝阔台的指挥，窝阔台于是更具有预定为继位人的形像。“窝阔台和婉地使他的两兄言归于好，严肃地使蒙古军队的纪律树立。”
于是他对乌尔犍赤实行总攻击，依照涅塞维的大事年表，乌尔犍赤大约在1221年的4
月被攻下。居民除有工匠的资格者外一概被屠杀，工匠被发送往蒙古。拙赤在围攻时候所表现的软弱，据涅塞维所说，或者是因为他知道这个地方是在他的未来封地之内，所以想拯救这座城市。（参阅后“注释和参考”）《秘史》和《拉施特书》不同，没有说到拙赤和察合台的意见龃龉，
以及他们结果都归窝阔台指挥的事，但是他告诉我们，兀笼格赤（玉龙杰赤，
等于乌尔犍赤）城破之后，三个王子分取该城人口，没有留下他们的父亲的一份。等到他们回到他们父亲那里时候。
成古思汗盛怒，以至三天不见他们。于是博尔术、木华黎（有误）和失吉忽都忽全来替他们说话。他们说：“取得兀笼格赤，增加了我们的威力，
撒儿塔兀勒被征服，你的大军皆喜。汗为什么这样愤怒？你的儿子们知道错误，满心懊悔。请仁慈为怀，饶恕他们……”
成吉思汗怒气稍止，并接见这三个王子，仍然对他们严厉责骂。当他们一动不敢动地立在他面前，脸上流着焦急的汗的时候，三个箭筒士晃孩、晃塔合儿和搠儿马罕也来劝解：“三个王子似鹰雏一般加入围猎，他们来学习战争的本领。为什么一回来就这样责骂他们呢？从日出处至于日落处，我们的敌人很多。（请你）放我们去向敌人，就像你在围猎时候放西番狗（一样），蒙天地护佑，我们战胜敌人，我们将一切金银绸缎财富取来献你，我们替你攻破人民和城池。你要不要我们去攻打巴格达的哈里发呢？”这些话完全平息了成
吉思汗的心情。为了表示他对于这三个箭筒士的满意，他叫晃孩和晃塔合儿随侍左右，据说他在这个时期已经命令拥儿马罕去攻打巴格达的哈里发，实际上这是将日期提前了许多。
当花剌子模帝国面临崩溃之际，花剌子模的算端摩诃末没有去防守都城而奔往呼罗珊。徘徊于巴里黑和你沙不儿周围若干时之后，他想离开蒙古人更远些而逃避到伊剌克阿只迷。但是成吉思汗已派遣蒙古军里面最优秀的两个将领，速不台把阿秃儿和者别那颜去追赶他。速不台和者别没有受到夺取地方的指示，只奉命擒获算端，不管他死活将他带来。因此他们经过巴里黑和你沙不儿的前面时，城中人送来投降的声明，他们即认为满足。但是到了就在现今德黑兰附近的刺夷城时候，他们屠杀了一部分居民，当然这也毫不为错。他们经过哈马丹没有停留，但是焚毁了可疾云。
然而他们虽然很快，仍被算端摩诃末脱走。这个不幸的人遭到失败，由于其帝国的败亡而绝望，他向阿必思浑对面里海中的一个小岛上躲避，他就在那里死于力竭和忧伤加上疾病，其时约在1220
年12月。
至于者别和速不台的进军是在这以后的情形我们将在后面叙述。